二甲基烯丙基色
氨酸合酶(
DMATS 1)的异
戊烯基转移酶催化
异戊二烯基或
异戊二烯基样部分与各种受体化合物的连接。这些受体分子通常本质上是芳族的,并且大多数是
吲哚或类似
吲哚的。它们的催化转化代表了次生代谢产物(包括
吲哚生物碱)的
生物合成过程中主要的骨骼多样化步骤。因此,
DMATS酶显着促进了小分子代谢产物的
生物学和药理学多样性。了解这些酶的底物特异性可能为它们在制备复杂的合成支架中的
生物催化用途创造机会。但是,还没有任何框架可以以合理的方式实现这一目标。这里,我们报告了
化学信息流
水线,以启用
异戊二烯基转移酶底物预测。我们系统地分类了32种独特的
异戊二烯基转移酶和167种独特的底物,以创建可能的反应基质,并将这些数据汇编到名为PrenDB的可浏览数据库中。然后,我们使用了一种新开发的基于分子片段化的算法来自动提取反应性
化学表位。对收集到的数据的分析揭示了迄今为止探索的
DMATS酶底物空间。为了