(2E,4E)-2,4-hexadienoyl-CoA

• 分子结构分类: 有机化合物 - 脂质和类脂质分子 - 脂肪酰基
• 英文名称: (2E,4E)-2,4-hexadienoyl-CoA
• 英文别名: trans,trans-2,4-hexadienoyl-CoA；S-[2-[3-[[(2R)-4-[[[(2R,3S,4R,5R)-5-(6-aminopurin-9-yl)-4-hydroxy-3-phosphonooxyoxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-hydroxyphosphoryl]oxy-2-hydroxy-3,3-dimethylbutanoyl]amino]propanoylamino]ethyl] (2E,4E)-hexa-2,4-dienethioate
• 化学式: C₂₇H₄₂N₇O₁₇P₃S
• 分子量: 861.654
• InChiKey: OUDBPEVXTMAWSG-VUJIAKIYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -4.1
• 重原子数：
  55
• 可旋转键数：
  22
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.56
• 拓扑面积：
  389
• 氢给体数：
  9
• 氢受体数：
  22

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  L-苯丙氨酸甲酯 、 (2E,4E)-2,4-hexadienoyl-CoA 在 N-acyltransferase from Photobacterium halotolerans 作用下， 以 水 为溶剂， 反应 18.0h， 生成 methyl ((2E,4E)-hexa-2,4-dienoyl)phenylalaninate
  参考文献：
  名称：

  通用的生物合成方法来形成酰胺键

  摘要：

  通用和可持续的酰胺键形成催化策略的开发是制药行业和更广泛的化学工业的主要目标。在这里，我们报告了一种酰胺合成的生物催化方法，该方法利用了自然界中形成酰胺键的酶，N-酰基转移酶（NAT）和CoA连接酶（CL）的多样性。通过选择具有所需底物特征的NAT和CL的组合，可以以可预测的方式构建非天然的生物催化途径，以允许使用化学计量比的羧酸和胺偶联伙伴以高收率获得结构多样的仲和叔酰胺。可以使用分离的酶在体外或体内进行转化反应仅依赖于细胞产生的辅因子。这些全细胞系统的实用性通过Losmapimod的关键中间体（GW856553X）的制备规模合成得到展示，Losmapimod是一种选择性的p38促分裂原活化蛋白激酶抑制剂。

  DOI：

  10.1039/c8gc01697f
• 作为产物：
  描述：

  山梨酸 、 辅酶 A 在 氯甲酸乙酯 、 三乙胺 、 碳酸氢钠 作用下， 以 二氯甲烷 、 四氢呋喃 为溶剂， 反应 2.0h， 生成 (2E,4E)-2,4-hexadienoyl-CoA
  参考文献：
  名称：

  E-和Z-二取代的双键的立体定向形成从Fostriecin聚酮化合物合酶的模块1和2的脱水酶域。

  摘要：

  邻苯二酚聚酮合酶（PKS）模块1的脱水酶结构域FosDH1催化了（3 R）-3-羟基丁酰-FosACP1（5）和（E）-2-丁烯酰基-FosACP1（11）的立体有择互变。直接LC-MS / MS和手性GC-MS的组合。FosDH1既不作用于（3 S）-3-羟基丁酰基-FosACP1（6）也不作用于（Z）-2-丁烯酰基-FosACP1（12）。研究显示，FosKR2是一种从邻苯二酸PKS的模块2还原而来的酮还原酶，通常可为FosDH2提供天然底物，该酶可催化NADPH依赖性的3-酮丁酰-FosACP2（23）立体定向还原至（3 S）-3-羟基丁酰基-FosACP2（8）。符合这一发现，FosDH2催化了相应的三酮化合物底物（3 R，4 E）-3-羟基-4-己烯酰基-FosACP2（18）和（2 Z，4 E）-2,4-己二烯酰基-FosACP2的相互转化（21）。FosDH2还催化了（Z）-

  DOI：

  10.1021/jacs.7b08896

文献信息

• [EN] METHOD FOR SYNTHESISING AMIDES<br/>[FR] PROCÉDÉ DE SYNTHÈSE D'AMIDES
  申请人：GLAXOSMITHKLINE IP DEV LTD

  公开号：WO2018029097A1

  公开（公告）日：2018-02-15

  The present invention relates to a method for synthesising amides that is of general applicability. The method may be performed in vitro or in vivo. Cell lines for use in the in vivo methods also form aspects of the invention. The method for synthesising a non-natural amide comprises: a. reaction of a carboxylic acid with a naturally occurring CoA ligase or a variant thereof; and b. reaction of the product of step a with an amine in the presence of a naturally occurring acyltransferase or a variant thereof; with the proviso that where the CoA ligase and acyltransferase are both naturally occurring, they are not derived from the same source species and do not act sequentially in a metabolic pathway; and with the proviso that the non-natural product is not N-(E)-p-coumaroyl-3-hydroxyanthranilic acid or N-(E)-p-caffeoyl-3-hydroxyanthranilic acid. Further, a method for producing an active pharmaceutical ingredient by the aforementioned method and host cells for carrying out said methods are envisaged.

  本发明涉及一种合成酰胺的方法，具有普遍适用性。该方法可以在体外或体内进行。用于体内方法的细胞系也构成本发明的方面之一。合成非天然酰胺的方法包括：a. 将羧酸与天然存在的辅酶A连接酶或其变体反应；b. 在天然存在的酰基转移酶或其变体存在下，将步骤a的产物与胺反应；但辅酶A连接酶和酰基转移酶若均为天然存在，则不能来自相同源物种且不能在代谢途径中依次作用；并且非天然产物不是N-(E)-对香豆酰-3-羟基蒽醌酸或N-(E)-对咖啡酰-3-羟基蒽醌酸。此外，还可以通过上述方法生产活性药物成分的方法和用于执行该方法的宿主细胞。
• Stereospecific Formation of <i>E</i>- and <i>Z</i>-Disubstituted Double Bonds by Dehydratase Domains from Modules 1 and 2 of the Fostriecin Polyketide Synthase
  作者：Dhara D. Shah、Young-Ok You、David E. Cane

  DOI：10.1021/jacs.7b08896

  日期：2017.10.11

  shown to catalyze the NADPH-dependent stereospecific reduction of 3-ketobutyryl-FosACP2 (23) to (3S)-3-hydroxybutyryl-FosACP2 (8). Consistent with this finding, FosDH2 catalyzed the interconversion of the corresponding triketide substrates (3R,4E)-3-hydroxy-4-hexenoyl-FosACP2 (18) and (2Z,4E)-2,4-hexadienoyl-FosACP2 (21). FosDH2 also catalyzed the stereospecific hydration of (Z)-2-butenoyl-FosACP2 (14)

  邻苯二酚聚酮合酶（PKS）模块1的脱水酶结构域FosDH1催化了（3 R）-3-羟基丁酰-FosACP1（5）和（E）-2-丁烯酰基-FosACP1（11）的立体有择互变。直接LC-MS / MS和手性GC-MS的组合。FosDH1既不作用于（3 S）-3-羟基丁酰基-FosACP1（6）也不作用于（Z）-2-丁烯酰基-FosACP1（12）。研究显示，FosKR2是一种从邻苯二酸PKS的模块2还原而来的酮还原酶，通常可为FosDH2提供天然底物，该酶可催化NADPH依赖性的3-酮丁酰-FosACP2（23）立体定向还原至（3 S）-3-羟基丁酰基-FosACP2（8）。符合这一发现，FosDH2催化了相应的三酮化合物底物（3 R，4 E）-3-羟基-4-己烯酰基-FosACP2（18）和（2 Z，4 E）-2,4-己二烯酰基-FosACP2的相互转化（21）。FosDH2还催化了（Z）-
• A versatile biosynthetic approach to amide bond formation
  作者：Helena K. Philpott、Pamela J. Thomas、David Tew、Doug E. Fuerst、Sarah L. Lovelock

  DOI：10.1039/c8gc01697f

  日期：——

  The development of versatile and sustainable catalytic strategies for amide bond formation is a major objective for the pharmaceutical sector and the wider chemical industry. Herein, we report a biocatalytic approach to amide synthesis which exploits the diversity of Nature's amide bond forming enzymes, N-acyltransferases (NATs) and CoA ligases (CLs). By selecting combinations of NATs and CLs with

  通用和可持续的酰胺键形成催化策略的开发是制药行业和更广泛的化学工业的主要目标。在这里，我们报告了一种酰胺合成的生物催化方法，该方法利用了自然界中形成酰胺键的酶，N-酰基转移酶（NAT）和CoA连接酶（CL）的多样性。通过选择具有所需底物特征的NAT和CL的组合，可以以可预测的方式构建非天然的生物催化途径，以允许使用化学计量比的羧酸和胺偶联伙伴以高收率获得结构多样的仲和叔酰胺。可以使用分离的酶在体外或体内进行转化反应仅依赖于细胞产生的辅因子。这些全细胞系统的实用性通过Losmapimod的关键中间体（GW856553X）的制备规模合成得到展示，Losmapimod是一种选择性的p38促分裂原活化蛋白激酶抑制剂。