2-((4-(3-chlorophenyl)-5-phenyl-4H-1,2,4-triazol-3-yl)thio)acetic acid

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 唑类
• 英文名称: 2-((4-(3-chlorophenyl)-5-phenyl-4H-1,2,4-triazol-3-yl)thio)acetic acid
• 英文别名: 2-[[4-(3-Chlorophenyl)-5-phenyl-1,2,4-triazol-3-yl]sulfanyl]acetic acid
• 化学式: C₁₆H₁₂ClN₃O₂S
• 分子量: 345.809
• InChiKey: RDRAWMRXSXPVIF-UHFFFAOYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  3.8
• 重原子数：
  23
• 可旋转键数：
  5
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.06
• 拓扑面积：
  93.3
• 氢给体数：
  1
• 氢受体数：
  5

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  2-氨基-1,3,4-噻二唑 、 2-((4-(3-chlorophenyl)-5-phenyl-4H-1,2,4-triazol-3-yl)thio)acetic acid 在 N,N-二异丙基乙胺 、 N-[(dimethylamino)-3-oxo-1H-1,2,3-triazolo[4,5-b]pyridin-1-yl-methylene]-N-methylmethanaminium hexafluorophosphate 作用下， 以 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 0.5h， 以90%的产率得到2-((4-(3-chlorophenyl)-5-phenyl-4H-1,2,4-triazol-3-yl)thio)-N-(1,3,4-thiadiazol-2-yl)acetamide
  参考文献：
  名称：

  新型非肽小分子NRP1拮抗剂的发现：虚拟筛选，分子模拟和结构修饰。

  摘要：

  血管内皮生长因子（VEGF）-神经纤维蛋白1（NRP1）相互作用的多方面作用已与癌症有关，但关于VEGF-NRP1相互作用的小分子抑制剂的报道很少。在这里，我们描述1，通过基于结构的虚拟筛选具有中等活性的新型非肽小分子NRP1拮抗剂的鉴定。进行了1的整体对接和分子动力学（MD）模拟，并获得了有趣的结合模型。我们发现，NRP1的Tyr297，Trp301和Tyr353所包围的“芳香盒”对于NRP1-1结合至关重要。基于源自MD模拟的结合模型对1的进一步结构修饰导致鉴定了具有显着改善的活性的12a。

  DOI：

  10.1016/j.bmc.2019.115183
• 作为产物：
  描述：

  Ethyl 2-[[4-(3-chlorophenyl)-5-phenyl-1,2,4-triazol-3-yl]sulfanyl]acetate 在 sodium hydroxide 作用下， 生成 2-((4-(3-chlorophenyl)-5-phenyl-4H-1,2,4-triazol-3-yl)thio)acetic acid
  参考文献：
  名称：

  新型非肽小分子NRP1拮抗剂的发现：虚拟筛选，分子模拟和结构修饰。

  摘要：

  血管内皮生长因子（VEGF）-神经纤维蛋白1（NRP1）相互作用的多方面作用已与癌症有关，但关于VEGF-NRP1相互作用的小分子抑制剂的报道很少。在这里，我们描述1，通过基于结构的虚拟筛选具有中等活性的新型非肽小分子NRP1拮抗剂的鉴定。进行了1的整体对接和分子动力学（MD）模拟，并获得了有趣的结合模型。我们发现，NRP1的Tyr297，Trp301和Tyr353所包围的“芳香盒”对于NRP1-1结合至关重要。基于源自MD模拟的结合模型对1的进一步结构修饰导致鉴定了具有显着改善的活性的12a。

  DOI：

  10.1016/j.bmc.2019.115183

文献信息

• Discovery of novel nonpeptide small-molecule NRP1 antagonists: Virtual screening, molecular simulation and structural modification
  作者：Kewen Peng、Yu Li、Ying Bai、Teng Jiang、Huiyong Sun、Qihua Zhu、Yungen Xu

  DOI：10.1016/j.bmc.2019.115183

  日期：2020.1

  factor (VEGF)-neuropilin-1 (NRP1) interaction have been implicated in cancer, but reports on small-molecule inhibitors of VEGF-NRP1 interaction are scarce. Herein, we describe the identification of 1, a novel nonpeptide small-molecule NRP1 antagonist with moderate activity via structure-based virtual screening. Ensemble docking and molecular dynamics (MD) simulations of 1 were carried out and an interesting

  血管内皮生长因子（VEGF）-神经纤维蛋白1（NRP1）相互作用的多方面作用已与癌症有关，但关于VEGF-NRP1相互作用的小分子抑制剂的报道很少。在这里，我们描述1，通过基于结构的虚拟筛选具有中等活性的新型非肽小分子NRP1拮抗剂的鉴定。进行了1的整体对接和分子动力学（MD）模拟，并获得了有趣的结合模型。我们发现，NRP1的Tyr297，Trp301和Tyr353所包围的“芳香盒”对于NRP1-1结合至关重要。基于源自MD模拟的结合模型对1的进一步结构修饰导致鉴定了具有显着改善的活性的12a。