N-(tert-butoxycarbonyl)-4-(6-methyl-1,2,4,5-tetrazin-3-yl)-L-phenylalanine

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机酸及其衍生物 - 羧酸及其衍生物
• 英文名称: N-(tert-butoxycarbonyl)-4-(6-methyl-1,2,4,5-tetrazin-3-yl)-L-phenylalanine
• 英文别名: (2S)-2-[(2-methylpropan-2-yl)oxycarbonylamino]-3-[4-(6-methyl-1,2,4,5-tetrazin-3-yl)phenyl]propanoic acid
• 化学式: C₁₇H₂₁N₅O₄
• 分子量: 359.385
• InChiKey: XVJRFZQUQAYVOF-ZDUSSCGKSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  1.3
• 重原子数：
  26
• 可旋转键数：
  7
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.41
• 拓扑面积：
  127
• 氢给体数：
  2
• 氢受体数：
  8

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  N-(tert-butoxycarbonyl)-4-(6-methyl-1,2,4,5-tetrazin-3-yl)-L-phenylalanine 在 盐酸 作用下， 以 1,4-二氧六环 、 乙酸乙酯 为溶剂， 以98%的产率得到4-(6-methyl-1,2,4,5-tetrazin-3-yl)-L-phenylalanine hydrochloride
  参考文献：
  名称：

  IMMOBILIZATION OF PROTEINS WITH CONTROLLED ORIENTATION AND LOAD

  摘要：

  将蛋白质或蛋白质功能片段固定在表面上的方法，以控制方向固定蛋白质或蛋白质功能片段在表面上，以高效固定蛋白质或蛋白质片段的负载，并保持蛋白质或蛋白质片段活性的方法。在这些方法中，通过将四唑改性的蛋白质或四唑改性的蛋白质功能片段与反-环辛烯改性表面接触，从而在表面上固定蛋白质或功能蛋白质片段。通过该方法获得的在表面上固定蛋白质或功能蛋白质片段的表面，以及用于测量配体与蛋白质或功能蛋白质片段结合的表面的方法。

  公开号：

  US20210072238A1
• 作为产物：
  描述：

  乙腈 、 Boc-L-4-氰基苯丙氨酸 在 nickel(II) triflate 、 肼 、 盐酸 、 sodium nitrite 作用下， 以 水 为溶剂， 反应 24.0h， 以60%的产率得到N-(tert-butoxycarbonyl)-4-(6-methyl-1,2,4,5-tetrazin-3-yl)-L-phenylalanine
  参考文献：
  名称：

  [EN] REAGENTS AND METHODS FOR BIOORTHOGONAL LABELING OF BIOMOLECULES IN LIVING CELLS
  [FR] RÉACTIFS ET PROCÉDÉS DE MARQUAGE BIOORTHOGONAL DE BIOMOLÉCULES DANS DES CELLULES VIVANTES

  摘要：

  Tetrazine非经典氨基酸，利用tetrazine氨基酸进行基因编码蛋白质和多肽的方法，包含tetrazine氨基酸的蛋白质和多肽，以及包含至少一种经过翻译后修饰的蛋白质和多肽的组合物，其在体内与已经嵌入的tetrazine氨基酸和第二分子发生反应。

  公开号：

  WO2016176689A1

文献信息

• [EN] FUNCTIONALIZED 1,2,4,5-TETRAZINE COMPOUNDS FOR USE IN BIOORTHOGONAL COUPLING REACTIONS<br/>[FR] COMPOSÉS 1,2,4,5-TÉTRAZINES FONCTIONNALISÉS DESTINÉS À ÊTRE UTILISÉS DANS DES RÉACTIONS DE COUPLAGE BIOORTHOGONAUX
  申请人：GEN HOSPITAL CORP

  公开号：WO2014065860A1

  公开（公告）日：2014-05-01

  The present application relates to functionalized 1,2,4,5-tetrazine compounds. The compounds are useful in compositions and methods using bioorthogonal inverse electron demand Diels-Alder cycloaddition reactions for the rapid and specific covalent delivery of a "payload" to a ligand bound to a biological target.

  本申请涉及功能化的1,2,4,5-四唑化合物。这些化合物在使用生物正交反电子需求Diels-Alder环加成反应进行快速和特异的共价传递“有效载荷”到与生物靶点结合的配体的组合物和方法中非常有用。
• FUNCTIONALIZED 1,2,4,5-TETRAZINE COMPOUNDS FOR USE IN BIOORTHOGONAL COUPLING REACTIONS
  申请人：DEVARAJ Neal K.

  公开号：US20150246893A1

  公开（公告）日：2015-09-03

  The present application relates to functionalized 1,2,4,5-tetrazine compounds. The compounds are useful in compositions and methods using bioorthogonal inverse electron demand Diels-Alder cycloaddition reactions for the rapid and specific covalent delivery of a “payload” to a ligand bound to a biological target.

  本申请涉及功能化的1,2,4,5-四唑化合物。这些化合物在使用生物正交反电子需求Diels-Alder环加成反应的组合物和方法中非常有用，以实现快速和特异性的共价传递“有效负载”到结合于生物靶标的配体。
• METHOD FOR PRODUCING, IN A CELL, A PROTEIN OR A POLYPEPTIDE COMPRISING A TETRAZINE AMINO ACID
  申请人：Oregon State University

  公开号：EP3971169A1

  公开（公告）日：2022-03-23

  The present patent application refers to: 1. A method for producing, in a cell, a protein or a polypeptide comprising at least one tetrazine amino acid, comprising: • culturing a cell that comprises a nucleic acid that comprises at least one selector codon and encodes the protein or polypeptide in a medium including a tetrazine amino acid, wherein the cell includes an orthogonal tRNA that functions in the cell and recognizes the selector codon and an orthogonal aminoacyl tRNA synthetase, and wherein the orthogonal aminoacyl tRNA synthetase preferentially aminoacylates the orthogonal tRNA with the tetrazine amino acid; and • in the cultured cell, incorporating the tetrazine amino acid into the protein or polypeptide to produce the protein or polypeptide comprising the at least one tetrazine amino acid residue. 2. A method for making a cell with translation components, the method comprising: • manufacturing in a cell, an orthogonal tRNA and an orthogonal aminoacyl tRNA synthetase, wherein the orthogonal tRNA recognizes the orthogonal aminoacyl tRNA synthetase, and wherein the orthogonal aminoacyl tRNA synthetase preferentially aminoacylates the orthogonal tRNA with a tetrazine amino acid. 3. A kit, comprising: • a cultured cell that comprises a nucleic acid in a medium including a tetrazine amino acid, wherein the cell includes an orthogonal tRNA; and • an orthogonal aminoacyl tRNA synthetase, and wherein the orthogonal aminoacyl tRNA synthetase preferentially aminoacylates the orthogonal tRNA with the tetrazine amino acid.

  本专利申请涉及 1.一种在细胞中生产包含至少一种四嗪氨基酸的蛋白质或多肽的方法，包括 - 在包括四嗪氨基酸的培养基中培养包含至少一个选择密码子并编码蛋白质或多肽的核酸的细胞，其中细胞包括在细胞中起作用并识别选择密码子的正交tRNA和正交氨基酰tRNA合成酶，正交氨基酰tRNA合成酶优先将正交tRNA与四嗪氨基酸氨基酰化；以及 - 在培养细胞中，将四嗪氨基酸结合到蛋白质或多肽中，以产生包含至少一个四嗪氨基酸残基的蛋白质或多肽。 2.一种制造具有翻译成分的细胞的方法，该方法包括 - 在细胞中制造正交tRNA和正交氨基酰tRNA合成酶，其中正交tRNA识别正交氨基酰tRNA合成酶，正交氨基酰tRNA合成酶优先用四嗪氨基酸氨基酰化正交tRNA。 3.一种试剂盒，包括 - 在包括四嗪氨基酸的培养基中含有核酸的培养细胞，其中细胞含有正交 tRNA；以及 - 正交氨基酰 tRNA 合成酶，其中正交氨基酰 tRNA 合成酶优先将正交 tRNA 与四嗪氨基酸氨基酰化。
• Functionalized 1,2,4,5-tetrazine compounds for use in bioorthogonal coupling reactions
  申请人：The General Hospital Corporation

  公开号：US10611738B2

  公开（公告）日：2020-04-07

  The present application relates to functionalized 1,2,4,5-tetrazine compounds. The compounds are useful in compositions and methods using bioorthogonal inverse electron demand Diels-Alder cycloaddition reactions for the rapid and specific covalent delivery of a “payload” to a ligand bound to a biological target.

  本申请涉及官能化 1,2,4,5-四嗪化合物。这些化合物适用于使用生物正交反电子需求 Diels-Alder 环加成反应的组合物和方法，用于将 "有效载荷 "快速、特异地共价传递给与生物靶标结合的配体。
• Ideal Bioorthogonal Reactions Using A Site-Specifically Encoded Tetrazine Amino Acid
  作者：Robert J. Blizzard、Dakota R. Backus、Wes Brown、Christopher G. Bazewicz、Yi Li、Ryan A. Mehl

  DOI：10.1021/jacs.5b03275

  日期：2015.8.19

  Bioorthogonal reactions for labeling biomolecules in live cells have been limited by slow reaction rates or low component selectivity and stability. Ideal bioorthogonal reactions with high reaction rates, high selectivity, and high stability would allow for stoichiometric labeling of biomolecules in minutes and eliminate the need to wash out excess labeling reagent. Currently, no general method exists for controlled stoichiometric or substoichiometric labeling of proteins in live cells. To overcome this limitation, we developed a significantly improved tetrazine-containing amino acid (Tet-v2.0) and genetically encoded Tet-v2.0 with an evolved aminoacyl-tRNA synthetase/tRNA((CUA)) pair. We demonstrated in cellulo that protein containing Tet-v2.0 reacts selectively with cyclopropane-fused trans-cyclooctene (sTCO) with a bimolecular rate constant of 72,500 +/- 1660 M-1 s(-1) without reacting with other cellular components. This bioorthogonal ligation of Tet-v2.0-protein reacts in cellulo with substoichiometric amounts of sTCO-label fast enough to remove the labeling reagent from media in minutes, thereby eliminating the need to wash out label. This ideal bioorthogonal reaction will enable the monitoring of a larger window of cellular processes in real time.