cyclo^8C3β-5'-O-(N-[L-alanyl]sulfamoyl)adenosine

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 咪唑并嘧啶类
• 英文名称: cyclo^8C3β-5'-O-(N-[L-alanyl]sulfamoyl)adenosine
• 英文别名: (1R,15S,21R,22S,23R)-7,15-diamino-22,23-dihydroxy-18,18-dioxo-19,24-dioxa-18lambda6-thia-2,4,6,9,17-pentazatetracyclo[19.2.1.02,10.03,8]tetracosa-3,5,7,9-tetraen-16-one；(1R,15S,21R,22S,23R)-7,15-diamino-22,23-dihydroxy-18,18-dioxo-19,24-dioxa-18λ6-thia-2,4,6,9,17-pentazatetracyclo[19.2.1.02,10.03,8]tetracosa-3,5,7,9-tetraen-16-one
• 化学式: C₁₆H₂₃N₇O₇S
• 分子量: 457.467
• InChiKey: RUMJNDBADRCDOJ-MLGGYXDXSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -2.6
• 重原子数：
  31
• 可旋转键数：
  0
• 环数：
  4.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.62
• 拓扑面积：
  226
• 氢给体数：
  5
• 氢受体数：
  12

反应信息

• 作为产物：
  描述：

  2',3'-O-isopropylidene-5'-O-(tert-butyldimethylsilyl)adenosine 在 RuCl2(1,3-dimesityl-imidazolidin-2-yl)(PCy3)(=CHPh) 、 palladium on activated charcoal 、 四(三苯基膦)钯 4-二甲氨基吡啶 、 正丁基锂 、 氨基磺酰氯 、 氢气 、 氟化氢吡啶 、 1,8-二氮杂双环[5.4.0]十一碳-7-烯 、 二异丙胺 、 三氟乙酸 、 N-[(dimethylamino)-3-oxo-1H-1,2,3-triazolo[4,5-b]pyridin-1-yl-methylene]-N-methylmethanaminium hexafluorophosphate 作用下， 以 四氢呋喃 、 六甲基磷酰三胺 、 乙醇 、 正己烷 、 二氯甲烷 、 N,N-二甲基乙酰胺 、 乙腈 为溶剂， 反应 68.92h， 生成 cyclo^8C3β-5'-O-(N-[L-alanyl]sulfamoyl)adenosine
  参考文献：
  名称：

  利用配体构象选择性抑制非核糖体肽合成酶氨基酸腺苷酸化与设计的大环小分子

  摘要：

  已开发出大环氨酰基-AMP 类似物，通过模拟晶体结构中观察到的 cisoid 配体结合构象，选择性地抑制非核糖体肽合成酶氨基酸腺苷酸化结构域。相比之下，这些大环化合物不抑制氨酰-tRNA 合成酶，它们在机制上密切相关，但以不同的转体构象结合它们的配体。大环在氨基酸部分的 Cβ 和腺嘌呤环的 C8 之间包含一个两碳或三碳连接器，以及一个氨基磺酸盐代替磷酸基团。这些化合物是耶尔森菌素铁载体合成酶 HMWP2 的半胱氨酸腺苷酸化结构域活性的有效抑制剂，并且与相应的线性氨酰基-AMP 类似物不同，它们不抑制体外蛋白质翻译。

  DOI：

  10.1021/ja0721521

文献信息

• WO2006/113615
  申请人：——

  公开号：——

  公开（公告）日：——
• ANTI-MICROBIAL AGENTS AND USES THEREOF
  申请人：Tan Derek Shieh

  公开号：US20090170805A1

  公开（公告）日：2009-07-02

  Many pathogens, including Mycobacterium tuberculosis and Yersinia pestis , rely on an iron acquisition system based on siderophores, secreted iron-chelating compounds with extremely high Fe(III) affinity. The compounds of the invention are inhibitors of domain salicylation enzymes, which catalyze the salicylation of an aroyl carrier protein (ArCP) domain to form a salicyl-ArCP domain thioester intermediate via a two-step reaction. The compounds include the intermediate mimic 5′-O—[N-(salicyl)sulfamoyl]-adenosine (salicyl-AMS) and analogs thereof. These compounds are inhibitors of the salicylate activity of MbtA, YbtE, PchD, and other domain salicylation enzymes involved in the biosynthesis of siderophores. Therefore, these compounds may be used in the treatment of infection caused by microorganisms which rely on siderphore-based iron acquisition systems. Pharmaceutical composition and methods of using these compounds to treat or prevent infection are also provided as well as methods of preparing the inventive compounds.
• US8461128B2
  申请人：——

  公开号：US8461128B2

  公开（公告）日：2013-06-11
• US8946188B2
  申请人：——

  公开号：US8946188B2

  公开（公告）日：2015-02-03
• Exploiting Ligand Conformation in Selective Inhibition of Non-Ribosomal Peptide Synthetase Amino Acid Adenylation with Designed Macrocyclic Small Molecules
  作者：Justin S. Cisar、Julian A. Ferreras、Rajesh K. Soni、Luis E. N. Quadri、Derek S. Tan

  DOI：10.1021/ja0721521

  日期：2007.6.1

  or three-carbon linker between Cβ of the amino acid moiety and C8 of the adenine ring and a sulfamate in place of the phosphate group. These compounds are potent inhibitors of the cysteine adenylation domain activity of the yersiniabactin siderophore synthetase HMWP2 and, unlike the corresponding linear aminoacyl-AMP analogs, do not inhibit protein translation in vitro. Selective small molecule inhibitors

  已开发出大环氨酰基-AMP 类似物，通过模拟晶体结构中观察到的 cisoid 配体结合构象，选择性地抑制非核糖体肽合成酶氨基酸腺苷酸化结构域。相比之下，这些大环化合物不抑制氨酰-tRNA 合成酶，它们在机制上密切相关，但以不同的转体构象结合它们的配体。大环在氨基酸部分的 Cβ 和腺嘌呤环的 C8 之间包含一个两碳或三碳连接器，以及一个氨基磺酸盐代替磷酸基团。这些化合物是耶尔森菌素铁载体合成酶 HMWP2 的半胱氨酸腺苷酸化结构域活性的有效抑制剂，并且与相应的线性氨酰基-AMP 类似物不同，它们不抑制体外蛋白质翻译。