L-arginine hydrazide

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机酸及其衍生物 - 羧酸及其衍生物
• 英文名称: L-arginine hydrazide
• 英文别名: (S)-1-(4-amino-5-hydrazinyl-5-oxopentyl)guanidine；2-[(4S)-4-amino-5-hydrazinyl-5-oxopentyl]guanidine
• 化学式: C₆H₁₆N₆O
• 分子量: 188.233
• InChiKey: DGDQJVHLQBEALE-BYPYZUCNSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -2.9
• 重原子数：
  13
• 可旋转键数：
  5
• 环数：
  0.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.67
• 拓扑面积：
  146
• 氢给体数：
  5
• 氢受体数：
  4

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  L-arginine hydrazide 、 S-腺苷蛋氨酸 在 N-methyltransferase His₆–FzmH 作用下， 生成
  参考文献：
  名称：

  Biosynthesis of fosfazinomycin is a convergent process

  摘要：

  Fosfazinomycin A是一种磷酸酯天然产物，其中Val-Arg二肽的C-末端甲基肼与甲基2-羟基-2-磷酸乙酸酯（Me-HPnA）连接。

  DOI：

  10.1039/c4sc03095h
• 作为产物：
  描述：

  FMOC-L-精氨酸 在 N,N-二异丙基乙胺 、 哌啶 、 三氟乙酸 作用下， 以 N-甲基吡咯烷酮 、 二甲基亚砜 、 N,N-二甲基甲酰胺 、 水 为溶剂， 反应 4.5h， 以81%的产率得到L-arginine hydrazide
  参考文献：
  名称：

  Multivalent DNA recognition by self-assembled clusters: deciphering structural effects by fragments screening and evaluation as siRNA vectors

  摘要：

  片段自组装被用于生产具有多种支架和配体的簇，并成功识别了一种有效的siRNA载体。

  DOI：

  10.1039/c5ob01404b

文献信息

• Direct <i>N</i>-Glycan Profiling in the Presence of Tryptic Peptides on MALDI-TOF by Controlled Ion Enhancement and Suppression upon Glycan-Selective Derivatization
  作者：Yasuro Shinohara、Jun-ichi Furukawa、Kenichi Niikura、Nobuaki Miura、Shin-Ichiro Nishimura

  DOI：10.1021/ac0492766

  日期：2004.12.1

  Even though the formidably laborious and time-consuming nature of oligosaccharide analysis limits certain attempts to analyze the glycosylation profile, the significant elucidation of carbohydrate modifications is largely dependent on it. Aiming to substantially improve the sample preparation procedure, a novel protocol allowing glycan-specific detection in the presence of other species, such as tryptic peptides, on MALDI-TOF was proposed and then evaluated. The new protocol is based on the concept that the desorption/ionization efficiency of glycans could be selectively and substantially enhanced while drastically suppressing the other ion species upon glycan-selective derivatization. A series of known and novel labeling reagents, all of which carry hydrazide functionality to allow glycan-specific derivatization, were prepared and evaluated in terms of their abilities to enhance the detection sensitivity of glycans, suppress ions of other contaminants (e.g., peptides), and detect acidic oligosaccharides. Several novel reagents that possess hydrophobic residue(s) together with quaternary ammonium/pyridinium or guanidino functionalities significantly enhanced the detection sensitivity of oligosaccharides. When enzymatically deglycosylated tryptic ovalbumin digest was directly derivatized by these reagents and subjected to MALDI-TOF analysis without any prior purification, we observed that a single type of analyte ion (labeled glycan) could suppress a large majority of peptide ions while allowing a low-femtomole level detection of oligosaccharides. The efficacy of this approach was further evaluated using several other model glycoproteins, including α1-acid glycoprotein that contains a variety of sialylated oligosaccharides.

  尽管寡糖分析的艰巨性和耗时性限制了某些尝试来分析糖基化谱，但对碳水化合物修饰的显著阐明在很大程度上依赖于它。为了大幅度改善样品制备过程，提出并评估了一种新的方案，允许在存在其他物种（如胰蛋白酶肽）的情况下通过MALDI-TOF进行糖特定检测。新方案基于这样的概念：通过糖特定衍生化，可以有选择性地大幅度提高糖的解吸/电离效率，同时大幅度抑制其他离子物种。准备并评估了一系列已知和新颖的标记试剂，这些试剂都携带酰肼功能以便进行糖特定衍生化，根据它们提高糖检测灵敏度、抑制其他污染物离子（如肽）以及检测酸性寡糖的能力进行了评估。几种具有疏水残基和季铵/吡啶锪或胍基功能的新颖试剂显著提高了寡糖的检测灵敏度。当酶解脱糖基化的胰蛋白酶卵白蛋白消化物直接通过这些试剂衍生化，并在没有任何预先纯化的情况下进行MALDI-TOF分析时，我们观察到单一类型的分析离子（标记的糖）可以抑制大部分肽离子，同时允许低飞摩尔水平的寡糖检测。通过使用几种其他模型糖蛋白（包括含有各种唾液酸化寡糖的α1-酸性糖蛋白）进一步评估了这种方法的功效。
• Cationic polysaccharide compositions
  申请人：Polygene Ltd.

  公开号：EP1222926A1

  公开（公告）日：2002-07-17

  The invention provides a polycation composition comprising a polysaccharide chain having an amount of saccharide units ranging from 2 to 2000, at least one oligoamine directly grafted to said polysaccharide chain per each segment of 5 saccharide units, wherein said oligoamine is selected from the group consisting of a linear, branched and cyclic alkyl amine having at least two amino groups, and at least one further grafted group selected from the group consisting of a hydrophobic and an amphiphilic group directly grafted to said polysaccharide chain per each segment of 50 saccharide units, wherein said hydrophobic or amphiphilic group includes an aliphatic chain of at least 4 carbons atoms.

  本发明提供了一种多阳离子组合物，其包括一个聚糖链，该聚糖链的糖单元数量在2到2000之间，每个5个糖单元的片段上至少直接嫁接有一种寡肽，其中所述的寡肽选自线性、支链和环状烷基胺，其具有至少两个氨基团，每个50个糖单元的片段上至少直接嫁接有至少一种进一步嫁接的基团，所述进一步嫁接的基团选自疏水性和两性亲和基团，其中所述的疏水性或两性亲和基团包括至少4个碳原子的脂肪链。
• Multivalent Metallosupramolecular Assemblies as Effective DNA Binding Agents
  作者：Wojciech Drożdż、Anna Walczak、Yannick Bessin、Virginie Gervais、Xiao-Yu Cao、Jean-Marie Lehn、Sébastien Ulrich、Artur R. Stefankiewicz

  DOI：10.1002/chem.201801552

  日期：2018.7.25

  implementation of coordination chemistry onto the generation of new types of metallosupramolecular complexes with laterally appended cationic moieties for DNA binding in buffered aqueous media. Utilization of an N,N,O‐type coordination pocket along with an octahedral zinc(II) metal ion allowed us to obtain mono‐ and tetranuclear complexes in both solution and solid state, as confirmed by NMR spectroscopy

  我们报告配位化学的实现对新型的金属超分子配合物与横向附加的阳离子部分在缓冲水性介质中的DNA结合产生的实现。通过NMR和单晶X射线证实，利用N，N，O型配位口袋以及八面体锌（II）金属离子使我们能够获得溶液和固态的单核和四核配合物衍射。通过使用等温滴定量热法和凝胶电泳，观察到多电荷的阳离子组件通过多价静电相互作用有效地结合到DNA。此外，我们观察到所用化合物的多价与DNA结合的有效性之间存在相关性。
• Fluorescent Dynamic Covalent Polymers for DNA Complexation and Templated Assembly
  作者：Clément Kotras、Maxime Leclercq、Maxime Roger、Camille Bouillon、Antonio Recupido、Aurélien Lebrun、Yannick Bessin、Philippe Gerbier、Sébastien Richeter、Sébastien Ulrich、Sébastien Clément、Mathieu Surin

  DOI：10.3390/molecules27196648

  日期：——

  π-conjugated fluorescent moieties based on thiophene-ethynyl-fluorene cores. Two types of fluorescent building blocks bearing neutral or cationic side groups on the fluorene moiety are considered in order to assess the role of the number of cationic units on complexation with DNA. The (chir)optical properties of the building blocks, the DCPs, and their complexes with several types of DNA are explored

  动态共价聚合物 (DCP) 为生物分子的靶向、传感和传递提供了作为特别感兴趣的适应性材料的机会。在这种观点中，将阳离子单元和荧光单元沿 DCP 链组合对于实现用于识别和递送核酸的光学探针具有吸引力。在这里，我们报告了基于噻吩-乙炔基-芴核的基于酰基腙的 DCP 的设计，该 DCP 结合了阳离子精氨酸单元和 π 共轭荧光部分。考虑了两种在芴部分上带有中性或阳离子侧基的荧光结构单元，以评估阳离子单元的数量对与 DNA 络合的作用。探索了构建块、DCP 及其与多种类型 DNA 的复合物的（手性）光学特性，提供有关超分子复合物形成及其在水溶液中稳定性的详细信息。展示了以 DNA 为模板的 DCP 形成，为基于核酸结构的荧光 DCP 组装提供了新的视角。
• US6958325B2
  申请人：——

  公开号：US6958325B2

  公开（公告）日：2005-10-25