4'-α-allyl-3'-O-(t-butyldimethylsilyl)thymidine

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 二嗪类
• 英文名称: 4'-α-allyl-3'-O-(t-butyldimethylsilyl)thymidine
• 英文别名: 3'-O-(t-butyldimethylsilyl)-4'-α-allylthymidine；1-[(2R,4S,5R)-4-[tert-butyl(dimethyl)silyl]oxy-5-(hydroxymethyl)-5-prop-2-enyloxolan-2-yl]-5-methylpyrimidine-2,4-dione
• 化学式: C₁₉H₃₂N₂O₅Si
• 分子量: 396.559
• InChiKey: DHWFIJQVJGRNDS-QMTMVMCOSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  2.46
• 重原子数：
  27
• 可旋转键数：
  7
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.68
• 拓扑面积：
  88.1
• 氢给体数：
  2
• 氢受体数：
  5

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  4'-α-allyl-3'-O-(t-butyldimethylsilyl)thymidine 在 四丁基氟化铵 作用下， 以 四氢呋喃 为溶剂， 反应 12.0h， 以90%的产率得到4′-allylthymidine
  参考文献：
  名称：

  Anti-viral nucleoside analogs and methods for treating viral infections, especially HIV infections

  摘要：

  本发明涉及根据一般式I、II、III、IV或V的新化合物： 其中B是根据以下结构的核苷酸碱基： 以及规范中定义的其余变量，以及包含这些化合物的药物组合物。这些化合物可用作抗病毒剂，用于病毒治疗。

  公开号：

  US09126971B2
• 作为产物：
  描述：

  1-(3-O-tert-butyldimethylsilyl-2,5-dideoxy-β-D-glycero-pent-4-enofuranosyl)thymine 在 二甲基二环氧乙烷 、 四氯化锡 作用下， 以 二氯甲烷 、 丙酮 为溶剂， 反应 16.5h， 生成 4'-α-allyl-3'-O-(t-butyldimethylsilyl)thymidine
  参考文献：
  名称：

  4'，5'-环氧核苷的开环：4'-C-支链核苷的新型立体选择性进入。

  摘要：

  立体选择性合成4'-α-碳取代的核苷已通过4'，5'-不饱和核苷与二甲基二环氧乙烷（DMDO）的环氧化和连续的SnCl（4）促进所得4'，5'-的开环而完成环氧核苷与有机硅试剂。[反应：看文字]

  DOI：

  10.1021/ol020259h

文献信息

• Synthesis, Duplex-Forming Ability, and Nuclease Resistance of Oligonucleotides Containing a Thymidine Derivative with a 1-Oxaspiro[4.5]decane Skeleton
  作者：Takashi Osawa、Natsumi Yano、Hiroshi Aoyama、Satoshi Obika

  DOI：10.1248/cpb.c22-00458

  日期：2022.10.1

  Chemically modified nucleic acids are essential for the therapeutic application of oligonucleotides. In this study, 6′-C-spiro-thymidine exhibiting a fixed torsion angle γ was designed, synthesized, and incorporated into oligonucleotides. The conformational analysis of the 6′-C-spiro-thymidine monomer revealed that its torsion angle γ was in the +synclinal range (approx. 60°), which is similar to that

  化学修饰的核酸对于寡核苷酸的治疗应用至关重要。在本研究中，设计、合成了具有固定扭转角γ的6′- C-螺胸苷，并将其掺入寡核苷酸中。6'- C-螺胸苷单体的构象分析表明，其扭转角γ在+向斜范围内（约60°），这与天然RNA双链体中的扭转角类似，正如预期的那样。另一方面，已知 RNA 双链体的糖构象主要是 N 型，而合成单体的糖构象是 S 型。紫外熔解分析结果表明6'- C-螺胸苷的双链体形成能力低于天然DNA。相反，6'- C-螺胸苷可以增强寡核苷酸对核酸酶的稳定性。特别地，在寡核苷酸的3'末端掺入6'- C-螺胸苷显着增加了寡核苷酸的核酸酶抗性。 全尺寸图像
• A NEW APPROACH TO THE SYNTHESIS OF 4′-CARBON-SUBSTITUTED NUCLEOSIDES: DEVELOPMENT OF A HIGHLY ACTIVE ANTI-HIV AGENT 2′, 3′-DIDEHYDRO-3′-DEOXY-4′-ETHYNYLTHYMIDINE
  作者：Kazuhiro Haraguchi、Shingo Takeda、Masanori Sumino、Hiromichi Tanaka、Ginger E. Dutschman、Yung-Chi Cheng、Takao Nitanda、Masanori Baba

  DOI：10.1081/ncn-200059774

  日期：2005.4.1

  Oxidation of 3'-O-TBDMS-4',5'-unsaturated thymidine 3 with dimethyldioxirane (DMDO) allowed the isolation of the epoxide 4. Upon reacting with organosilicon reagents in the Presence of SnCl4, 4 underwent stereoselective ring opening to give 4'-alpha-allyl (6), 4'-alpha-(2-bromoallyl) (7), 4'-alpha(cyclopenten-3-yl) (8), and 4'-alpha-cyano (9) derivatives of thymidine. Reactions of the 3'-epimer 12 with organoaluminum reagents gave 4-alpha-methyl (13), 4'-alpha-vinyl (14), and 4'-alpha-ethynyl (15) analogues. Compounds 13-15 were transformed into corresponding 2',3'-didehydro-3'-deoxy derivatives. Evaluation of their ability to inhibit the replication of HIV in cell culture showed that 4'-ethynyl-d4T (19) is more potent and less toxic than the parent compound d4T.
• Anti-viral nucleoside analogs and methods for treating viral infections, especially HIV infections
  申请人：Cheng Yung-chi

  公开号：US09126971B2

  公开（公告）日：2015-09-08

  The present invention relates to novel compounds according to the general formulas I, II, III, IV or V: wherein B is nucleoside base according to the structure: and the remaining variables as defined in the specification, and pharmaceutical compositions comprising the compounds. The compounds are useful interalia as anti-viral agents in viral therapy.

  本发明涉及根据一般式I、II、III、IV或V的新化合物： 其中B是根据以下结构的核苷酸碱基： 以及规范中定义的其余变量，以及包含这些化合物的药物组合物。这些化合物可用作抗病毒剂，用于病毒治疗。
• Ring Opening of 4‘,5‘-Epoxynucleosides:  A Novel Stereoselective Entry to 4‘-<i>C</i>-Branched Nucleosides
  作者：Kazuhiro Haraguchi、Shingo Takeda、Hiromichi Tanaka

  DOI：10.1021/ol020259h

  日期：2003.5.1

  Stereoselective synthesis of 4'-alpha-carbon-substituted nucleosides has been accomplished through epoxidation of 4',5'-unsaturated nucleosides with dimethyldioxirane (DMDO) and successive SnCl(4)-promoted ring opening of the resulting 4',5'-epoxynucleosides with organosilicon reagents. [reaction: see text]

  立体选择性合成4'-α-碳取代的核苷已通过4'，5'-不饱和核苷与二甲基二环氧乙烷（DMDO）的环氧化和连续的SnCl（4）促进所得4'，5'-的开环而完成环氧核苷与有机硅试剂。[反应：看文字]