benzyl-SAM

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 5'-脱氧核糖核苷
• 英文名称: benzyl-SAM
• 英文别名: [(3S)-3-amino-3-carboxypropyl]-[[(2S,3S,4R,5R)-5-(6-aminopurin-9-yl)-3,4-dihydroxyoxolan-2-yl]methyl]-benzylsulfanium
• 化学式: C₂₁H₂₇N₆O₅S
• 分子量: 475.549
• InChiKey: VZKPOVSIZCKYJC-PVDBMYMVSA-O

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -2
• 重原子数：
  33
• 可旋转键数：
  9
• 环数：
  4.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.43
• 拓扑面积：
  184
• 氢给体数：
  5
• 氢受体数：
  10

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  N-(4,7-dihydroxy-2-oxo-2H-chromen-3-yl)-1H-pyrrol-2-carboxamide 、 benzyl-SAM 在 bovine serum albumin 作用下， 以 二甲基亚砜 为溶剂， 反应 24.0h， 生成
  参考文献：
  名称：

  非天然辅助因子的生物催化弗瑞德-克拉夫特烷基化

  摘要：

  描述了一种新颖的CC键形成的生物催化方案，该方案等同于Friedel-Crafts烷基化。S-腺苷-L-蛋氨酸（SAM）是甲基转移酶（Mtases）催化的生物甲基化的主要甲基供体，可以进行烷基化（请参阅方案）。这些酶可以接受非天然的辅助因子，并且可以将甲基以外的其他功能转移到芳香族底物上。

  DOI：

  10.1002/anie.200905095
• 作为产物：
  描述：

  溴甲苯 、 S-(5'-腺苷)-L-高半胱氨酸 在 甲酸 、 silver perchlorate 、 溶剂黄146 作用下， 生成 benzyl-SAM
  参考文献：
  名称：

  用于蛋白质-蛋白质相互作用的等位基因特异性调节的工程甲基赖氨酸编写器和阅读器

  摘要：

  由甲基赖氨酸介导的蛋白质-蛋白质相互作用在生物系统中无处不在。这种相互作用的特定扰动仍然是一项具有挑战性的工作。在此，我们描述了一种针对与人类蛋白质组正交的工程蛋白质-蛋白质界面的等位基因特异性策略。我们开发了一种甲基转移酶 (writer) 变体，它在组蛋白上安装了芳基赖氨酸部分，只能被工程染色质域 (read-er) 识别。我们建立工程界面的生化完整性，为正交性提供结构证据，并验证其在识别转录调节因子方面的适用性。我们的方法为甲基赖氨酸相互作用组的特定操作提供了前所未有的策略。

  DOI：

  10.1021/jacs.9b05725

文献信息

• Directed Evolution of a Halide Methyltransferase Enables Biocatalytic Synthesis of Diverse SAM Analogs
  作者：Qingyun Tang、Christoph W. Grathwol、Aşkın S. Aslan‐Üzel、Shuke Wu、Andreas Link、Ioannis V. Pavlidis、Christoffel P. S. Badenhorst、Uwe T. Bornscheuer

  DOI：10.1002/anie.202013871

  日期：2021.1.18

  Biocatalytic alkylations are important reactions to obtain chemo‐, regio‐ and stereoselectively alkylated compounds. This can be achieved using S‐adenosyl‐l‐methionine (SAM)‐dependent methyltransferases and SAM analogs. It was recently shown that a halide methyltransferase (HMT) from Chloracidobacterium thermophilum can synthesize SAM from SAH and methyl iodide. We developed an iodide‐based assay for

  生物催化烷基化是获得化学、区域和立体选择性烷基化化合物的重要反应。这可以通过使用 S-腺苷-L-甲硫氨酸 (SAM) 依赖性甲基转移酶和 SAM 类似物来实现。最近的研究表明，来自嗜热氯酸杆菌的卤化物甲基转移酶（HMT）可以从 SAH 和碘甲烷合成 SAM。我们开发了一种基于碘化物的测定方法，用于拟南芥HMT 的定向进化，并用它来鉴定 V140T 变体，该变体也可以接受乙基、丙基和烯丙基碘，产生相应的 SAM 类似物（90、50 和15 毫克 SAH 的 70% 转化率）。 V140T AtHMT 与O-甲基转移酶（IeOMT 或 COMT）进行一锅级联，以实现木犀草素的区域选择性乙基化和 3,4-二羟基苯甲醛的烯丙基化。虽然 3,4-二羟基苯甲醛的丙基化级联反应转化率较低，但丙基-SAH 中间体可以通过 NMR 光谱得到证实。
• Preparation, Assay, and Application of Chlorinase SalL for the Chemoenzymatic Synthesis of S-Adenosyl-l-Methionine and Analogs
  作者：Tony D. Davis、Sylvia Kunakom、Michael D. Burkart、Alessandra S. Eustaquio

  DOI：10.1016/bs.mie.2018.02.012

  日期：——

  However, SAM and its analogs are expensive and unstable, degrading rapidly under physiological conditions. Thus, the availability of methods to prepare SAM in situ is desirable. In addition, synthetic methods to generate SAM analogs suffer from low yields and poor diastereoselectivity. The chlorinase SalL from the marine bacterium Salinispora tropica catalyzes the reversible, nucleophilic attack of chloride

  S-腺苷-1-甲硫氨酸（SAM）在生物学上很普遍，在各种酶促反应中是第二最常见的辅助因子。SAM的主要作用之一是核酸，蛋白质和代谢物的甲基化。甲基化通常赋予DNA和蛋白质以调节控制力，并导致专门代谢产物（如开发为药物的那些代谢产物）的活性增加。在甲基转移酶催化的生物分子修饰中使用SAM类似物的兴趣已经增加。然而，SAM及其类似物昂贵且不稳定，在生理条件下会迅速降解。因此，期望有用于原位制备SAM的方法的可用性。另外，产生SAM类似物的合成方法产率低且非对映选择性差。来自海洋细菌Salinispora tropica的氯化酶SalL催化氯化物对SAM的C5'核糖基碳的可逆亲核攻击，导致5'-氯-5'-脱氧腺苷（ClDA）的形成，伴随着1-甲硫氨酸的置换。已经证明，SalL催化的反应的体外平衡有利于SAM的合成。在本章中，我们描述了用SalL制备SalL的方法，以及用ClDA和1-蛋氨酸同源物
• NEW S-ADENOSYL-L-METHIONINE ANALOGS WITH EXTENDED ACTIVATED GROUPS FOR TRANSFER BY METHYLTRANSFERASES
  申请人：RWTH Aachen

  公开号：EP1874790A2

  公开（公告）日：2008-01-09
• S-ADENOSYL-L-METHIONINE ANALOGS WITH EXTENDED ACTIVATED GROUPS FOR TRANSFER BY METHYLTRANSFERASES
  申请人：Weinhold Elmar

  公开号：US20090018101A1

  公开（公告）日：2009-01-15

  S-Adenosyl- L -methionine analogs of formula (I) wherein R comprises a carbon-carbon double bond, carbon-oxygen double bond, carbon-sulfur double bond, carbon-nitrogen double bond, a carbon-carbon triple bond, carbon-nitrogen triple bond or an aromatic carbocyclic or heterocyclic system in β-position to the sulfonium center, X— is an organic or inorganic anion carrying one or more negative charges, Z is —CR 1 R 2 —, —O—, —S— or —NR 3 — and R 1 , R 2 and R 3 are independently selected from H, D and C 1 -C 12 alkyl. Also disclosed are complexes of the compound with a methyltransferase, pharmaceutical compositions comprising the same, methods for modifying biomolecule using the compound, and methods for detecting sequences specific methylation of biomolecules using the compound.
• US8008007B2
  申请人：——

  公开号：US8008007B2

  公开（公告）日：2011-08-30