6-amino-2-{[4-(2-hydroxyethyl)phenethyl]amino}-1,7-dihydro-8H-imidazo[4,5-g]quinazolin-8-one

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 二氮杂萘
• 英文名称: 6-amino-2-{[4-(2-hydroxyethyl)phenethyl]amino}-1,7-dihydro-8H-imidazo[4,5-g]quinazolin-8-one
• 英文别名: 6-Amino-2-({2-[4-(2-Hydroxyethyl)phenyl]ethyl}amino)-1,7-Dihydro-8h-Imidazo[4,5-G]quinazolin-8-One；6-amino-2-[2-[4-(2-hydroxyethyl)phenyl]ethylamino]-1,7-dihydroimidazo[4,5-g]quinazolin-8-one
• 化学式: C₁₉H₂₀N₆O₂
• 分子量: 364.407
• InChiKey: RGCYFFRYXJGABS-UHFFFAOYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  1.5
• 重原子数：
  27
• 可旋转键数：
  6
• 环数：
  4.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.21
• 拓扑面积：
  128
• 氢给体数：
  5
• 氢受体数：
  5

反应信息

• 作为产物：
  描述：

  1,4-苯二乙酸 在 N-甲基咪唑 、 lithium aluminium tetrahydride 、 二甲基砜 、 偶氮二甲酸二异丙酯 、 硫酸 、 碘 、 一水合肼 、 溶剂黄146 、 N,N-二异丙基乙胺 、 三苯基膦 、 锌 作用下， 以 四氢呋喃 、 乙醇 、 水 、 乙酸乙酯 、 乙腈 为溶剂， 反应 168.0h， 生成 6-amino-2-{[4-(2-hydroxyethyl)phenethyl]amino}-1,7-dihydro-8H-imidazo[4,5-g]quinazolin-8-one
  参考文献：
  名称：

  在带有修饰的或不规则的侧链的tRNA修饰酶中占据平坦的子腔：是结合还是不结合？

  摘要：

  就其结合性能而言，通常认为具有部分无序或增强的残留迁移率的小分子配体是不利的。考虑到热力学，无序或残余迁移率在熵上是有利的，并有助于吉布斯结合能。在本研究中，我们分析了一系列抑制tRNA修饰酶TGT的同类配体。附在亲林-苯并鸟嘌呤支架，位置2的取代基容纳在暴露于溶剂的平坦袋中，并显示出不同程度的残留迁移率。这在晶体结构中通过增强的B因子，减少的占有率或在分裂构象异构体上的分布来表明。配合物的MD模拟表明，在几个构象族上的散射更大。末端酸性基团的引入通过盐桥将取代基固定至Arg残基。总的来说，所有取代的衍生物都显示出相同的亲和力，即顺序和无序性都不是结合亲和力的决定性因素。额外的盐桥保持强烈的溶剂接触，因此不会增加亲和力。医师建议这种接触是暂时性的。

  DOI：

  10.1016/j.bmc.2016.07.053

文献信息

• Occupying a flat subpocket in a tRNA-modifying enzyme with ordered or disordered side chains: Favorable or unfavorable for binding?
  作者：Manuel Neeb、Christoph Hohn、Frederik Rainer Ehrmann、Adrian Härtsch、Andreas Heine、François Diederich、Gerhard Klebe

  DOI：10.1016/j.bmc.2016.07.053

  日期：2016.10

  series of congeneric ligands inhibiting the tRNA-modifying enzyme TGT. Attached to the parent lin-benzoguanine scaffold, substituents in position 2 accommodate in a flat solvent-exposed pocket and exhibit varying degree of residual mobility. This is indicated in the crystal structures by enhanced B-factors, reduced occupancies, or distributions over split conformers. MD simulations of the complexes suggest

  就其结合性能而言，通常认为具有部分无序或增强的残留迁移率的小分子配体是不利的。考虑到热力学，无序或残余迁移率在熵上是有利的，并有助于吉布斯结合能。在本研究中，我们分析了一系列抑制tRNA修饰酶TGT的同类配体。附在亲林-苯并鸟嘌呤支架，位置2的取代基容纳在暴露于溶剂的平坦袋中，并显示出不同程度的残留迁移率。这在晶体结构中通过增强的B因子，减少的占有率或在分裂构象异构体上的分布来表明。配合物的MD模拟表明，在几个构象族上的散射更大。末端酸性基团的引入通过盐桥将取代基固定至Arg残基。总的来说，所有取代的衍生物都显示出相同的亲和力，即顺序和无序性都不是结合亲和力的决定性因素。额外的盐桥保持强烈的溶剂接触，因此不会增加亲和力。医师建议这种接触是暂时性的。