S-(2-acetamidoethyl) 3-oxooctanethioate

• 分子结构分类: 有机化合物 - 脂质和类脂质分子 - 脂肪酰基
• 英文名称: S-(2-acetamidoethyl) 3-oxooctanethioate
• 英文别名: 3-Keto-octanoyl-S-N-acetyl cysteamine
• 化学式: C₁₂H₂₁NO₃S
• 分子量: 259.37
• InChiKey: DXAAQBABINNIHG-UHFFFAOYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  1.7
• 重原子数：
  17
• 可旋转键数：
  10
• 环数：
  0.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.75
• 拓扑面积：
  88.5
• 氢给体数：
  1
• 氢受体数：
  4

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  S-(2-acetamidoethyl) 3-oxooctanethioate 在 Aspergillus oryzae acylalkylpyrone synthase CsyB, I₃₇₅F mutant, hydrate form 作用下， 以 aq. phosphate buffer 为溶剂， 反应 0.33h， 生成 3-己基-4-羟基-6-戊基-2-吡喃酮
  参考文献：
  名称：

  真菌III型聚酮化合物合酶CsyB由两个β-酮酰基单元形成酰基烷基吡喃酮的结构基础。

  摘要：

  米曲霉的酰基烷基吡喃酮合酶CsyB催化由乙酰乙酰辅酶A，脂肪酰基辅酶A和丙二酰辅酶A一锅形成3-酰基-4-羟基-6-烷基-α-吡喃酮支架。这是第一种III型聚酮化合物合酶，不仅可以进行聚酮化合物链的延伸，还可以使两个β-酮酰基单元缩合。野生型CsyB及其I375F和I375W突变体的晶体结构分别以1.7-，2.3-和2.0-A的分辨率解析。晶体结构揭示了一个独特的活性位点结构，该结构具有迄今无法识别的新颖口袋，可容纳乙酰乙酰辅酶A起始物，此外还具有带有Cys-His-Asn催化三联体的常规延伸/环化口袋和用于结合脂肪的长疏水通道酰基链。该结构还表明存在一个假定的亲核水分子，该分子被氢键网络激活，其活性位点中心处有His-377和Cys-155。此外，体外酶反应证实，H2（18）O分子的（18）O原子通过酶法结合到最终产物中。这些观察结果表明，酶反应是通过将乙酰乙酰辅酶A负载到Cys-155

  DOI：

  10.1074/jbc.m114.626416
• 作为产物：
  描述：

  3-羟基辛酸 在 4-二甲氨基吡啶 、 盐酸-N-乙基-Nˊ-(3-二甲氨基丙基)碳二亚胺 、 pyridinium chlorochromate 作用下， 以 二氯甲烷 为溶剂， 反应 2.0h， 生成 S-(2-acetamidoethyl) 3-oxooctanethioate
  参考文献：
  名称：

  链霉菌天蓝色解离的脂肪酸合酶的FabG和FabI的表征。

  摘要：

  功能性串扰：鉴定并鉴定了来自天蓝色链霉菌的β-酮酰基-酰基载体蛋白（ACP; FabG）和烯酰-ACP还原酶（FabI）。动力学分析表明，这些酶可处理直链和支链底物，以及来自脂肪酸和十一烷基脯氨酸的生物合成途径中的ACP。这种松弛的底物特异性使这些酶参与了两个过程。

  DOI：

  10.1002/cbic.201402670

文献信息

• Understanding Programming of Fungal Iterative Polyketide Synthases: The Biochemical Basis for Regioselectivity by the Methyltransferase Domain in the Lovastatin Megasynthase
  作者：Ralph A. Cacho、Justin Thuss、Wei Xu、Randy Sanichar、Zhizeng Gao、Allison Nguyen、John C. Vederas、Yi Tang

  DOI：10.1021/jacs.5b11814

  日期：2015.12.23

  Highly reducing polyketide synthases (HR-PKSs) from fungi synthesize complex natural products using a single set of domains in a highly programmed, iterative fashion. The most enigmatic feature of HR-PKSs is how tailoring domains function selectively during different iterations of chain elongation to afford structural diversity. Using the lovastatin nonaketide synthase LovB as a model system and a

  来自真菌的高度还原性聚酮化合物合酶 (HR-PKS) 以高度程序化的迭代方式使用一组域合成复杂的天然产物。HR-PKS 最神秘的特征是在链伸长的不同迭代过程中，剪裁域如何有选择地发挥作用，以提供结构多样性。使用洛伐他汀九肽合酶 LovB 作为模型系统和各种酰基底物，我们表征了 LovB 甲基转移酶 (MT) 域的底物特异性。我们表明，虽然 MT 结构域对不同的 β-酮酰基基团显示出甲基化活性，但在链长和功能化方面，它对其自然编程的 β-酮-二烯基四酮底物具有异常选择性。伴随酮还原酶 (KR) 结构域的表征显示出对不同 β-酮酰基基团更广泛的底物特异性。我们的研究表明，相对于其他竞争域的转化率，通过对特定底物的更高动力学效率来实现通过定制域（例如 MT）进行的选择性修饰。
• Control Mechanism for <i>cis</i> Double‐Bond Formation by Polyunsaturated Fatty‐Acid Synthases
  作者：Shohei Hayashi、Yasuharu Satoh、Yasushi Ogasawara、Chitose Maruyama、Yoshimitsu Hamano、Tetsuro Ujihara、Tohru Dairi

  DOI：10.1002/anie.201812623

  日期：2019.2.18

  Polyunsaturated fatty acids (PUFAs) such as docosahexaenoic acid (DHA), eicosapentaenoic acid (EPA), and arachidonic acid (ARA) are essential fatty acids for humans. Some microorganisms biosynthesize these PUFAs through PUFA synthases composed of four subunits with multiple catalytic domains. These PUFA synthases each create a specific PUFA without undesirable byproducts, even though the multiple catalytic domains

  二十二碳六烯酸（DHA），二十碳五烯酸（EPA）和花生四烯酸（ARA）等多不饱和脂肪酸（PUFA）是人类必需的脂肪酸。一些微生物通过由具有多个催化结构域的四个亚基组成的PUFA合酶生物合成这些PUFA。尽管每个大亚基中的多个催化结构域非常相似，但这些PUFA合成酶均可产生特定的PUFA，而不会产生不希望的副产物。但是，用于控制最终产品特征的详细生物合成途径和机制仍然不清楚。在这项研究中，C亚基中的FabA型脱水酶结构域（DH FabA）和聚酮化合物合酶型脱水酶结构域（DH PKS）通过体内基因交换分析揭示了ARA合酶的B亚基对ARA生物合成至关重要。此外，在体外用截短的重组酶和C 4至C 8酰基ACP底物进行的体外分析表明，ARA和EPA合酶利用了两种类型的DH域，即DH PKS和DH FabA，具体取决于碳链长度，从而引入了两种饱和或顺式双键与增长的酰基链。
• Reconstitution of a Type II Polyketide Synthase that Catalyzes Polyene Formation
  作者：Danyao Du、Yohei Katsuyama、Kazuo Shin-ya、Yasuo Ohnishi

  DOI：10.1002/anie.201709636

  日期：2018.2.12

  While type II polyketide synthases (PKSs) are known for producing aromatic compounds, a phylogenetically new subfamily of type II PKSs have been recently proposed to synthesize polyene structures. Here we report in vitro analysis of such a type II PKS, IgaPKS for ishigamide biosynthesis. The ketoreductase (Iga13) and dehydratase (Iga16) were shown to catalyze the reduction of a β‐keto group and dehydration

  虽然已知II型聚酮化合物合酶（PKS）可产生芳族化合物，但最近有人提出了系统发育上II型PKS的新亚家族来合成多烯结构。在这里，我们报告了这种II型PKS，IgaPKS用于ishigamide生物合成的体外分析。研究表明，酮还原酶（Iga13）和脱水酶（Iga16）分别催化β-酮基的还原和β-羟基的脱水，形成反式双键。酰基载体蛋白（Iga10），酮合成酶/链长因子复合物（Iga11–Iga12），Iga13和Iga16与丙二酸和己酰辅酶A和NADPH的孵育，然后KOH水解导致形成四种不饱和羧酸（C 8，C 10，C 12，和C 14），表明IgaPKS通过严格的立体特异性重复缩合，酮还原和脱水循环来催化四烯形成。对于产多烯的II型PKS，我们建议“高度还原II型PKS亚家族”。
• MmfL catalyses formation of a phosphorylated butenolide intermediate in methylenomycin furan biosynthesis
  作者：Shanshan Zhou、Nicolas R. Malet、Lijiang Song、Christophe Corre、Gregory L. Challis

  DOI：10.1039/d0cc05658h

  日期：——

  condensation of dihydroxyacetone phosphate with a β-ketoacyl thioester to form a phosphorylated butenolide intermediate in the biosynthesis of the methylenomycin furans, which induce methlenomycin antibiotic production in Streptomyces coelicolor A3(2). AfsA homologues are also involved in the biosynthesis of 2-akyl-4-hydroxy-3-methyl butenolide inducers of antibiotic production in other Streptomyces species

  使用合成底物类似物和产品标准品的组合，γ-丁内酯生物合成酶 AfsA 的同系物 MmfL 被证明可催化磷酸二羟基丙酮与 β-酮酰基硫酯的缩合，在生物合成中形成磷酸化的丁烯内酯中间体。亚甲霉素呋喃，在天蓝色链霉菌A3(2) 中诱导甲烯霉素抗生素的产生。AfsA 同系物还参与其他链霉菌属物种抗生素生产的 2-akyl-4-hydroxy-3-methyl butenolide 诱导剂的生物合成，表明不同的信号分子由类似的磷酸化丁烯内酯中间体组装而成。
• Insights into the programmed ketoreduction of partially reducing polyketide synthases: stereo- and substrate-specificity of the ketoreductase domain
  作者：Ishin Soehano、Lifeng Yang、Feiqing Ding、Huihua Sun、Zhen Jie Low、Xuewei Liu、Zhao-Xun Liang

  DOI：10.1039/c4ob01777c

  日期：——

  hallmarks of iterative polyketide synthases (PKSs) is the programming mechanism which is essential for the generation of structurally diverse polyketide products. In partially reducing iterative PKSs (PR-PKSs), the programming mechanism is mainly dictated by the ketoreductase (KR) domain. The KR domain contributes to the programming of PR-PKSs through selective reduction of polyketide intermediates. How

  迭代聚酮化合物合酶（PKSs）的标志之一是编程机制，该机制对于生成结构多样的聚酮化合物产品至关重要。在部分减少迭代PKS（PR-PKS）时，编程机制主要由酮还原酶（KR）域决定。KR结构域通过选择性还原聚酮化合物中间体而有助于PR-PKS的编程。KR域如何实现选择性酮还原仍有待充分理解。在这项研究中，我们发现，（的KR结构域- [R）-mellein-合成PR-PKS SACE5532用作B型KR结构域，以产生（ř）-羟基官能团。对SACE5532和NcsB的KR域的比较研究表明，两个KR域对简单的N-乙酰半胱胺硫酯（SNAC）底物具有不同的底物偏好。我们进一步发现，可以通过用KR NcsB交换几个基序来切换KR SACE5532的底物偏好，并且在全长SACE5532中交换相同基序会导致PKS的重新编程。总之，这些结果通过为聚酮化合物中间体的差异识别来实现编程的酮还原反应这一假设提供了新的