2-morpholino-1H-benzo[d]imidazole-6-carboxylic acid

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 苯并咪唑类
• 英文名称: 2-morpholino-1H-benzo[d]imidazole-6-carboxylic acid
• 英文别名: 2-morpholin-4-yl-3H-benzimidazole-5-carboxylic acid
• 化学式: C₁₂H₁₃N₃O₃
• 分子量: 247.254
• InChiKey: VYDQCWGBCIHKSX-UHFFFAOYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  1.1
• 重原子数：
  18
• 可旋转键数：
  2
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.33
• 拓扑面积：
  78.4
• 氢给体数：
  2
• 氢受体数：
  5

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  2-morpholino-1H-benzo[d]imidazole-6-carboxylic acid 、 1-(2-氟苄基)哌嗪 在 N,N-二异丙基乙胺 、 N-[(dimethylamino)-3-oxo-1H-1,2,3-triazolo[4,5-b]pyridin-1-yl-methylene]-N-methylmethanaminium hexafluorophosphate 作用下， 以 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 3.17h， 以0.03 g的产率得到(4-(2-fluorobenzyl)piperazin-1-yl)(2-morpholino-1H-benzo[d]imidazol-5-yl)methanone
  参考文献：
  名称：

  人 BRCA1 串联 BRCT 域靶向磷酸肽识别以中断 BRCA1 依赖性信号传导

  摘要：

  由 DNA 断裂触发的细胞内信号流经含有 BRCT（BRCA1 C 末端）结构域的蛋白质。这个家族包含 23 个在人体中保守的磷酸肽结合模块，小分子化学抑制剂无法使用。在这里，我们开发了 Bractoppin，这是一种人类 BRCA1 串联 (t)BRCT 结构域对磷酸肽识别的类药物抑制剂，它在体外选择性地抑制底物与纳摩尔效价的结合。结构-活性探索表明，Bractoppin 与 BRCA1 tBRCT 残基结合，识别共有基序中的 pSer，pSer-Pro-Thr-Phe，加上在结构相关的 BRCT 结构域中不同的邻接疏水袋，赋予选择性。在细胞中，Bractoppin 抑制 Förster 共振能量转移检测到的底物识别，并减少 BRCA1 对 DNA 断裂的募集，反过来抑制损伤诱导的 G2 停滞和重组酶 RAD51 的组装。但损伤诱导的 MDC1 募集、单链 DNA (ssDNA) 生成和

  DOI：

  10.1016/j.chembiol.2018.02.012
• 作为产物：
  描述：

  3,4-二氨基苯甲酸甲酯 在 盐酸 、 溶剂黄146 、 三氯氧磷 作用下， 以 水 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 10.0h， 生成 2-morpholino-1H-benzo[d]imidazole-6-carboxylic acid
  参考文献：
  名称：

  人 BRCA1 串联 BRCT 域靶向磷酸肽识别以中断 BRCA1 依赖性信号传导

  摘要：

  由 DNA 断裂触发的细胞内信号流经含有 BRCT（BRCA1 C 末端）结构域的蛋白质。这个家族包含 23 个在人体中保守的磷酸肽结合模块，小分子化学抑制剂无法使用。在这里，我们开发了 Bractoppin，这是一种人类 BRCA1 串联 (t)BRCT 结构域对磷酸肽识别的类药物抑制剂，它在体外选择性地抑制底物与纳摩尔效价的结合。结构-活性探索表明，Bractoppin 与 BRCA1 tBRCT 残基结合，识别共有基序中的 pSer，pSer-Pro-Thr-Phe，加上在结构相关的 BRCT 结构域中不同的邻接疏水袋，赋予选择性。在细胞中，Bractoppin 抑制 Förster 共振能量转移检测到的底物识别，并减少 BRCA1 对 DNA 断裂的募集，反过来抑制损伤诱导的 G2 停滞和重组酶 RAD51 的组装。但损伤诱导的 MDC1 募集、单链 DNA (ssDNA) 生成和

  DOI：

  10.1016/j.chembiol.2018.02.012

文献信息

• Targeting Phosphopeptide Recognition by the Human BRCA1 Tandem BRCT Domain to Interrupt BRCA1-Dependent Signaling
  作者：Jayaprakash Periasamy、Vadiraj Kurdekar、Subbarao Jasti、Mamatha B. Nijaguna、Sanjana Boggaram、Manjunath A. Hurakadli、Dhruv Raina、Lokavya Meenakshi Kurup、Chetan Chintha、Kavyashree Manjunath、Aneesh Goyal、Gayathri Sadasivam、Kavitha Bharatham、Muralidhara Padigaru、Vijay Potluri、Ashok R. Venkitaraman

  DOI：10.1016/j.chembiol.2018.02.012

  日期：2018.6

  triggered by DNA breakage flow through proteins containing BRCT (BRCA1 C-terminal) domains. This family, comprising 23 conserved phosphopeptide-binding modules in man, is inaccessible to small-molecule chemical inhibitors. Here, we develop Bractoppin, a drug-like inhibitor of phosphopeptide recognition by the human BRCA1 tandem (t)BRCT domain, which selectively inhibits substrate binding with nanomolar potencyin vitro

  由 DNA 断裂触发的细胞内信号流经含有 BRCT（BRCA1 C 末端）结构域的蛋白质。这个家族包含 23 个在人体中保守的磷酸肽结合模块，小分子化学抑制剂无法使用。在这里，我们开发了 Bractoppin，这是一种人类 BRCA1 串联 (t)BRCT 结构域对磷酸肽识别的类药物抑制剂，它在体外选择性地抑制底物与纳摩尔效价的结合。结构-活性探索表明，Bractoppin 与 BRCA1 tBRCT 残基结合，识别共有基序中的 pSer，pSer-Pro-Thr-Phe，加上在结构相关的 BRCT 结构域中不同的邻接疏水袋，赋予选择性。在细胞中，Bractoppin 抑制 Förster 共振能量转移检测到的底物识别，并减少 BRCA1 对 DNA 断裂的募集，反过来抑制损伤诱导的 G2 停滞和重组酶 RAD51 的组装。但损伤诱导的 MDC1 募集、单链 DNA (ssDNA) 生成和