N-(3-((3-(2-((4,6-dimethylpyrimidin-2-yl)thio)acetamido)benzyl)oxy)phenyl) pyrrolidine-2-carboxamide

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机酸及其衍生物 - 羧酸及其衍生物
• 英文名称: N-(3-((3-(2-((4,6-dimethylpyrimidin-2-yl)thio)acetamido)benzyl)oxy)phenyl) pyrrolidine-2-carboxamide
• 英文别名: N-[3-[[3-[[2-(4,6-dimethylpyrimidin-2-yl)sulfanylacetyl]amino]phenyl]methoxy]phenyl]pyrrolidine-2-carboxamide
• 化学式: C₂₆H₂₉N₅O₃S
• 分子量: 491.614
• InChiKey: ZKSQNUDDDUEAKR-UHFFFAOYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  3.5
• 重原子数：
  35
• 可旋转键数：
  9
• 环数：
  4.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.31
• 拓扑面积：
  131
• 氢给体数：
  3
• 氢受体数：
  7

反应信息

• 作为产物：
  描述：

  4,6-二甲基-2-巯基嘧啶 在 potassium tert-butylate 、 三氟乙酸 作用下， 以 二氯甲烷 为溶剂， 反应 6.0h， 生成 N-(3-((3-(2-((4,6-dimethylpyrimidin-2-yl)thio)acetamido)benzyl)oxy)phenyl) pyrrolidine-2-carboxamide
  参考文献：
  名称：

  X射线晶体结构指导发现新的选择性，模拟底物的sirtuin 2抑制剂的发现，该抑制剂具有针对非小细胞肺癌细胞的活性

  摘要：

  人sirtuin 2（SIRT2）是烟酰胺腺嘌呤二核苷酸（NAD +）依赖性脱酰基酶，与人类疾病（包括癌症）有关。寻找用于SIRT2的选择性小分子抑制剂作为化学工具和潜在的治疗剂。在这里，我们报告了新的N-（3-（苯氧基甲基）苯基）乙酰胺衍生物与SIRT2的X射线晶体结构指导的结构-活性关系研究，从而鉴定了有效的，选择性的SIRT2抑制剂。晶体学分析表明，新的抑制剂通过诱导扩大的疏水口袋的形成，特别是模仿肉豆蔻酰化赖氨酸底物的相互作用而起作用。最有效的抑制剂24a可以剂量依赖性地提高非小细胞肺癌H441细胞中α-微管蛋白的乙酰化水平，该蛋白具有较高的SIRT2表达水平（通过Western印迹分析确定）。进一步的细胞分析表明，24a主要通过抑制细胞增殖而不是诱导细胞凋亡来抑制细胞生长。此外，24a可以抑制H441细胞的迁移和侵袭。这些结果为进一步开发新的有效，选择性和具有细胞活性的SIRT2

  DOI：

  10.1016/j.ejmech.2018.06.041

文献信息

• X-ray crystal structure guided discovery of new selective, substrate-mimicking sirtuin 2 inhibitors that exhibit activities against non-small cell lung cancer cells
  作者：Ling-Ling Yang、Hua-Li Wang、Lei Zhong、Chen Yuan、Si-Yu Liu、Zhu-Jun Yu、Sha Liu、Yu-Hang Yan、Chengyong Wu、Yuxi Wang、Zhouyu Wang、Yamei Yu、Qiang Chen、Guo-Bo Li

  DOI：10.1016/j.ejmech.2018.06.041

  日期：2018.7

  cancer. Selective small-molecule inhibitors for SIRT2 are sought as chemical tools and potential therapeutics. Here we report the X-ray crystal structure guided structure-activity relationship studies of new N-(3-(phenoxymethyl)phenyl)acetamide derivatives with SIRT2, which led to the identification of potent, selective SIRT2 inhibitors. Crystallographic analyses reveal that the new inhibitors act via

  人sirtuin 2（SIRT2）是烟酰胺腺嘌呤二核苷酸（NAD +）依赖性脱酰基酶，与人类疾病（包括癌症）有关。寻找用于SIRT2的选择性小分子抑制剂作为化学工具和潜在的治疗剂。在这里，我们报告了新的N-（3-（苯氧基甲基）苯基）乙酰胺衍生物与SIRT2的X射线晶体结构指导的结构-活性关系研究，从而鉴定了有效的，选择性的SIRT2抑制剂。晶体学分析表明，新的抑制剂通过诱导扩大的疏水口袋的形成，特别是模仿肉豆蔻酰化赖氨酸底物的相互作用而起作用。最有效的抑制剂24a可以剂量依赖性地提高非小细胞肺癌H441细胞中α-微管蛋白的乙酰化水平，该蛋白具有较高的SIRT2表达水平（通过Western印迹分析确定）。进一步的细胞分析表明，24a主要通过抑制细胞增殖而不是诱导细胞凋亡来抑制细胞生长。此外，24a可以抑制H441细胞的迁移和侵袭。这些结果为进一步开发新的有效，选择性和具有细胞活性的SIRT2