Lam-Glc3-ol

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机氧化合物
• 英文名称: Lam-Glc3-ol
• 英文别名: (2R,3R,4R,5S)-4-[(2S,3R,4S,5R,6R)-3,5-dihydroxy-6-(hydroxymethyl)-4-[(2S,3R,4S,5S,6R)-3,4,5-trihydroxy-6-(hydroxymethyl)oxan-2-yl]oxyoxan-2-yl]oxyhexane-1,2,3,5,6-pentol
• 化学式: C₁₈H₃₄O₁₆
• 分子量: 506.458
• InChiKey: IGGRGXIBKYLLRJ-VDSJFZOZSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -6.8
• 重原子数：
  34
• 可旋转键数：
  11
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  1.0
• 拓扑面积：
  280
• 氢给体数：
  12
• 氢受体数：
  16

反应信息

• 作为产物：
  描述：

  laminaritriose 在 sodium hydroxide 、 sodium tetrahydroborate 作用下， 生成 Lam-Glc3-ol
  参考文献：
  名称：

  碳水化合物测序的一致策略。1.通过MSn挖掘结构细节。

  摘要：

  该报告是三份系列报告中的第一份，主要针对建立一致的碳水化合物测序策略。这些报告分为（i）通过MSn分解解释小低聚物结构所有方面的分析考虑因素；（ii）使用离子片段库和相关工具进行高通量分析的数据库支持；以及（iii）用于分析的结论算法。从MSn拆卸途径定义寡糖拓扑结构。这份第一份报告的分析性贡献探索了通过离子阱质谱法暴露的结构细节的局限性，其中样品制备为甲基衍生物，并作为金属离子加合物进行了分析。这项数据挖掘工作着眼于将小寡聚物的片段与立体特异性聚糖结构相关联，结果归因于金属离子加合和分析物构象的结合。容易的糖苷裂解引入了一个不稳定性点（吡喃糖基-1-烯），该点在碰撞激活后会引发随后的环断裂。产物质量和离子强度随残基间键合，支化位置和单体立体化学而变化。过度碎片化是小型低聚物的特性，少数振荡器中的碰撞能量会通过大量碎片化消散。使用离子阱质谱仪将本报告中讨论的程序统一为单一策略，其灵敏度可预

  DOI：

  10.1021/ac050724z

文献信息

• Exploring novel non-Leloir β-glucosyltransferases from proteobacteria for modifying linear (β1→3)-linked gluco-oligosaccharide chains
  作者：Gudmundur O Hreggvidsson、Justyna M Dobruchowska、Olafur H Fridjonsson、Jon O Jonsson、Gerrit J Gerwig、Arnthor Aevarsson、Jakob K Kristjansson、Delphine Curti、Robert R Redgwell、Carl-Eric Hansen、Johannis P Kamerling、Takoua Debeche-Boukhit

  DOI：10.1093/glycob/cwq165

  日期：2011.3

  Over the years several β-glucan transferases from yeast and fungi have been reported, but enzymes with such an activity from bacteria have not been characterized so far. In this work, we describe the cloning and expression of genes encoding β-glucosyltransferase domains of glycosyl hydrolase family GH17 from three species of proteobacteria: Pseudomonas aeruginosa PAO1, P. putida KT2440 and Azotobacter vinelandii ATCC BAA-1303. The encoded enzymes of these GH17 domains turned out to have a non-Leloir trans-β-glucosylation activity, as they do not use activated nucleotide sugar as donor, but transfer a glycosyl group from a β-glucan donor to a β-glucan acceptor. More particularly, the activity of the three recombinant enzymes on linear (β1 → 3)-linked gluco-oligosaccharides (Lam-Glc4–9) and their corresponding alditols (Lam-Glc4–9-ol) was studied. Detailed structural analysis, based on thin-layer chromatography, matrix-assisted laser desorption ionization time-of-flight mass spectrometry, electrospray ionization mass spectrometry, and 1D/2D 1H and 13C nuclear magnetic resonance data, revealed diverse product spectra. Depending on the enzyme used, besides (β1 → 3)-elongation activity, (β1 → 4)- or (β1 → 6)-elongation, or (β1 → 6)-branching activities were also detected.

  多年来，酵母和真菌中的β-葡聚糖转移酶已被报道，但细菌中具有这种活性的酶迄今尚未被鉴定。在这项工作中，我们描述了三种蛋白细菌中编码糖基水解酶家族 GH17 β-葡聚糖转移酶结构域的基因的克隆和表达：铜绿假单胞菌（Pseudomonas aeruginosa PAO1）、腐生假单胞菌（P. putida KT2440）和乙烯绿氮菌（AzotoBActer vinelandii ATCC BAA-1303）。这些 GH17 结构域编码的酶具有非 Leloir 反式-β-葡萄糖基化活性，因为它们不使用活化的核苷酸糖作为供体，而是将一个糖基从β-葡聚糖供体转移到β-葡聚糖受体。更具体地说，研究了这三种重组酶对线性（β1 → 3）连接的葡聚寡糖（Lam-Glc4-9）及其相应的醛醇（Lam-Glc4-9-ol）的活性。基于薄层色谱法、基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱法、电喷雾电离质谱法以及 1D/2D 1H 和 13C 核磁共振数据的详细结构分析揭示了不同的产物光谱。根据所用酶的不同，除了（β1 → 3）-伸长活性外，还检测到（β1 → 4）-或（β1 → 6）-伸长或（β1 → 6）-分支活性。