摘要:
基于结构的ChikV nsP2蛋白酶(PDB: 3TRK)高通量虚拟筛选(HTVS)使用了两个公开数据库ZINC12和BindingDB,旨在寻找适用于治疗基孔肯雅热感染的合适抑制剂。在GLIDE 5.0(Schrodinger LLC)中实施的HTVS协议被用于筛选ZINC12的药物样子集(10,090,210个)以及BindingDB中的蛋白酶抑制剂(83,000个)。从不同化学类别列表中选取了一种化学骨架用于合成(ZINC04725220,化合物11)。此外,还合成了几个席夫碱(13-21),使用中间体1,3-二苯基-1H-吡唑-4-甲醛(4-6)并进行了抗ChikV(OPY1菌株,2006年留尼汪岛)活性测试,采用细胞病变效应减少(CPE) assay。出人意料的是,只有化合物11(IC50: 5µg/ml即14.15 µM)显示出对ChikV的抑制活性。为了理解化合物11与目标蛋白之间重要的分子相互作用,进一步进行了精确对接。