(3AR,4S,6AS)-3A,6A-二氢-2,2-二甲基-4H-环戊-1,3-二氧杂环戊烯-4-胺 | 71772-25-3

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机氧化合物
• 中文名称: (3AR,4S,6AS)-3A,6A-二氢-2,2-二甲基-4H-环戊-1,3-二氧杂环戊烯-4-胺
• 英文名称: (3S,4R,5S)-3-amino-4,5-(isopropylidenedioxy)-cyclopentene
• 英文别名: (3aR,4S,6aS)-2,2-Dimethyl-3a,6a-dihydro-4H-cyclopenta[d][1,3]dioxol-4-amine；(3aR,4S,6aS)-2,2-dimethyl-4,6a-dihydro-3aH-cyclopenta[d][1,3]dioxol-4-amine
• CAS: 71772-25-3
• 化学式: C₈H₁₃NO₂
• 分子量: 155.197
• InChiKey: BGNBJFIGIYMQPT-LYFYHCNISA-N

物化性质

• 沸点：
  213.1±40.0 °C(Predicted)
• 密度：
  1.075±0.06 g/cm3(Predicted)
• 溶解度：
  可溶于氯仿、甲醇

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -0.2
• 重原子数：
  11
• 可旋转键数：
  0
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.75
• 拓扑面积：
  44.5
• 氢给体数：
  1
• 氢受体数：
  3

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  (3AR,4S,6AS)-3A,6A-二氢-2,2-二甲基-4H-环戊-1,3-二氧杂环戊烯-4-胺 在 盐酸 作用下， 以 乙醚 为溶剂， 反应 22.0h， 以100%的产率得到(3S,4R,5S)-3-amino-4,5-dihydroxycyclopentene hydrochloride
  参考文献：
  名称：

  Enantioselective Synthesis of the Cyclopentene Segment of Queuosine

  摘要：

  (3S,4R,5S)-3-氨基-4,5-二羟基环戊烯是以(-)-3-内-羟基双环戊二烯为原料，通过立体选择性方式合成的奎宁环戊烯段，该环戊二烯段位于 +RNA、Tyr +RNA、His +RNA、Asn 和 +RNA、Asp 的反密码子的第一个位置。

  DOI：

  10.1055/s-1996-4197
• 作为产物：
  描述：

  (1R,4'S,5'R)-1-(2',2'-dimethyl-5'-vinyl[1',3']dioxo-4'-yl)prop-2-en-1-ol 在 Grubbs catalyst first generation sodium hydroxide 、 1,8-二氮杂双环[5.4.0]十一碳-7-烯 作用下， 以 乙醇 、 二氯甲烷 、 xylene 为溶剂， 反应 9.17h， 生成 (3AR,4S,6AS)-3A,6A-二氢-2,2-二甲基-4H-环戊-1,3-二氧杂环戊烯-4-胺
  参考文献：
  名称：

  （3S，4R，5S）-（+）-4,5-二羟基环戊-1-en-3-基胺的立体选择性有效途径：超修饰核苷Q的侧链

  摘要：

  描述了对（3S，4R，5S）-（+）-3-氨基-4，5-二羟基环戊-1-烯，即奎松碱的侧链部分的适当保护的衍生物的立体选择性和高产率的途径。合成途径包括甘露呋喃糖衍生的二烯的闭环易位（RCM），然后进行超人重排。

  DOI：

  10.1016/s0040-4039(98)01738-9

文献信息

• Synthesis of Galactosyl‐Queuosine and Distribution of Hypermodified Q‐Nucleosides in Mouse Tissues
  作者：Peter Thumbs、Timm T. Ensfelder、Markus Hillmeier、Mirko Wagner、Matthias Heiss、Constanze Scheel、Alexander Schön、Markus Müller、Stylianos Michalakis、Stefanie Kellner、Thomas Carell

  DOI：10.1002/anie.202002295

  日期：2020.7.20

  report a total synthesis of the hypermodified nucleoside galactosyl‐queuosine (galQ). The availability of the compound enabled us to study the absolute levels of the Q‐family nucleosides in six different organs of newborn and adult mice, and also in human cytosolic tRNA. Our synthesis now paves the way to a more detailed analysis of the biological function of the Q‐nucleoside family.

  Queuosine（Q）是一种高度修饰的RNA核苷，存在于tRNA His，tRNA Asn，tRNA Tyr和tRNA Asp中。它位于tRNA反密码子环的摆动位置，在这里它可以与位于相应mRNA密码子各自位置的U以及C碱基相互作用。在tRNA Tyr和tRNA Asp中在包括人类在内的高等真核生物中，由于未知的原因，分别通过添加半乳糖和甘露糖糖进一步修饰了Q碱基。尚不清楚这种额外修饰的原因，以及如何通过Q的形成和插入来协调糖的修饰。在这里，我们报告了高度修饰的核苷半乳糖基奎宁（galQ）的总合成。该化合物的可用性使我们能够研究新生和成年小鼠的六个不同器官以及人胞质tRNA中Q族核苷的绝对水平。现在，我们的合成为Q-核苷家族的生物学功能的更详细分析铺平了道路。
• A short, concise synthesis of queuine
  作者：Allen F. Brooks、George A. Garcia、H.D. Hollis Showalter

  DOI：10.1016/j.tetlet.2010.06.008

  日期：2010.8

  reductive amination as the penultimate step. The synthesis demonstrates the utility of silylation to facilitate reactions of various pyrrolo[2,3-d]pyrimidine intermediates, and offers the possibility of easily accessing related pyrrolo[2,3-d]pyrimidines as well as making additional analogues of queuine.

  通过使用还原胺化作为倒数第二个步骤的收敛方案，以简短，简洁的方式合成了奎宁，总收率为36％。该合成证明了甲硅烷基化作用有助于各种吡咯并[2,3- d ]嘧啶中间体的反应，并提供了容易获得相关的吡咯并[2,3- d ]嘧啶以及制备奎宁的其他类似物的可能性。
• Evolution of eukaryal tRNA-guanine transglycosylase: insight gained from the heterocyclic substrate recognition by the wild-type and mutant human and Escherichia coli tRNA-guanine transglycosylases
  作者：Yi-Chen Chen、Allen F. Brooks、DeeAnne M. Goodenough-Lashua、Jeffrey D. Kittendorf、Hollis D. Showalter、George A. Garcia

  DOI：10.1093/nar/gkq1188

  日期：2011.4

  of the eukaryal class of TGTs is not known. We performed sequence homology and phylogenetic analyses, and carried out enzyme kinetics studies with the wild-type and mutant TGTs from Escherichia coli and human using various heterocyclic substrates that we synthesized. Observations with the Cys145Val (E. coli) and the corresponding Val161Cys (human) TGTs are consistent with the idea that the Cys145 evolved

  tRNA-鸟嘌呤转糖基酶 (TGT) 参与真核生物和真细菌中 tRNA 的 queuosine 修饰以及古细菌中 tRNA 的古核苷修饰。然而，不同类别的 TGT 使用不同的杂环底物（在古细菌的情况下使用 tRNA）。基于 X 射线结构分析，一项较早的研究 [Stengl等人。(2005) tRNA-鸟嘌呤转糖基酶 (TGT) 的机制和底物特异性：来自三个不同生命王国的 tRNA 修饰酶具有共同的催化机制。化学生化, 6, 1926-1939] 为真细菌和古细菌 TGT 的不同进化提供了一个令人信服的案例。真核类 TGT 的 X 射线结构尚不清楚。我们进行了序列同源性和系统发育分析，并使用我们合成的各种杂环底物对来自大肠杆菌和人类的野生型和突变型 TGT 进行了酶动力学研究。对 Cys145Val（大肠杆菌）和相应的 Val161Cys（人）TGT 的观察结果与 Cys145在真细菌 TGT
• Total Synthesis of the Hypermodified tRNA Nucleoside Epoxyqueuosine
  作者：Ines Thoma、Thomas Carell

  DOI：10.1002/ejoc.201300586

  日期：2013.7

  modified nucleosides found in transferRNA (tRNA) of almost all species. Queuosine is found exclusively in the wooble position of the anticodon loop of several tRNA, where it is involved in tRNAAsp, tRNAAsn tRNAHis, and tRNATyr. The biosynthesis of queuosine is performed by prokaryotes, and eukaryotes are fully dependent on this external source. To investigate the interesting biosynthesis of the Q base

  Queuosine 是几乎所有物种的转移 RNA (tRNA) 中发现的最强烈修饰的核苷之一。Queuosine 仅存在于几种 tRNA 的反密码子环的 wooble 位置，在那里它参与 tRNAAsp、tRNAAsn、tRNAHis 和 tRNATyr。queuosine 的生物合成是由原核生物进行的，而真核生物则完全依赖于这种外部来源。为了研究 Q 碱基的有趣生物合成，我们在此报告了直接生物合成前体 oQ 的首次全合成。通过将 LC-MS 与特殊的大肠杆菌生长条件（培养基中不含维生素 B12）结合使用，我们确认了 oQ 天然产物的结构。
• Synthesis of the aminocyclopentenediol fragment of queuosine by way of the stereoselective addition of an organometallic reagent to a <i>N-t</i>-butanesulfinyl glycosylamine
  作者：Floriane Heis、Estelle Gallienne、Olivier R. Martin

  DOI：10.1039/d3ob01713c

  日期：——

  An innovative, concise synthesis of the aminocyclopentenediol fragment of queuosine is reported. The synthesis is based on the stereocontrolled addition of a vinylGrignard·LiCl reagent to a t-butanesulfinyl L-ribofuranosylamine, followed by dehydrodeoxygenation to generate a second vinyl group and ring-closing metathesis to form the five-membered ring scaffold of the natural product. This approach

  报道了一种创新、简洁的奎奥辛氨基环戊烯二醇片段的合成方法。该合成基于乙烯基格氏·LiCl试剂与叔丁亚磺酰基L-呋喃核糖胺的立体控制加成，然后脱氢脱氧生成第二个乙烯基和闭环复分解形成天然产物的五元环支架。这种方法具有开发更大规模合成的潜力。