6-[(3S,9S,12R)-3-benzyl-2,5,8,11-tetraoxospiro[1,4,7,10-tetrazabicyclo[10.4.0]hexadecane-6,1'-cyclooctane]-9-yl]-N-hydroxyhexanamide

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机酸及其衍生物 - 羧酸及其衍生物
• 英文名称: 6-[(3S,9S,12R)-3-benzyl-2,5,8,11-tetraoxospiro[1,4,7,10-tetrazabicyclo[10.4.0]hexadecane-6,1'-cyclooctane]-9-yl]-N-hydroxyhexanamide
• 化学式: C₃₂H₄₇N₅O₆
• 分子量: 597.755
• InChiKey: IQZNQLYROKCHAJ-KKUQBAQOSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  3.5
• 重原子数：
  43
• 可旋转键数：
  8
• 环数：
  4.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.66
• 拓扑面积：
  157
• 氢给体数：
  5
• 氢受体数：
  6

反应信息

• 作为产物：
  描述：

  tert-butyl pipecolinate 在 palladium on activated charcoal 、 三乙胺 盐酸羟胺 、 氢气 、 (benzotriazo-1-yloxy)tris(dimethylamino)phosphonium hexafluorophosphate 、 1-羟基苯并三唑 、 O-(1H-benzotriazol-1-yl)-N,N,N',N'-tetramethyluronium hexafluorophosphate 、 溶剂黄146 、 三乙胺 、 N,N-二异丙基乙胺 、 Methanaminium,N-[(dimethylamino)(3H-1,2,3-triazolo[4,5-b]pyridin-3-yloxy)methylene]-N-methyl-, hexafluorophosphate(1-) 作用下， 以 甲醇 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 40.0h， 生成 6-[(3S,9S,12R)-3-benzyl-2,5,8,11-tetraoxospiro[1,4,7,10-tetrazabicyclo[10.4.0]hexadecane-6,1'-cyclooctane]-9-yl]-N-hydroxyhexanamide
  参考文献：
  名称：

  衣原霉素-异羟肟酸类似物作为组蛋白脱乙酰基酶抑制剂。

  摘要：

  根据衣原霉素和曲古抑菌素A的结构和HDAC抑制活性，设计并合成了衣原霉素-异羟肟酸类似物作为组蛋白脱乙酰基酶（HDAC）抑制剂。衣原霉素是环状四肽，在侧链中含有环氧酮部分，使其成为不可逆抑制剂。 HDAC。我们用异羟肟酸代替了衣原体的环氧酮部分，以设计有效且可逆的HDAC抑制剂。另外，对于一系列衣藻多菌素类似物系列，引入了许多氨基-环烷羧酸（Acc）而不是简单的氨基-异丁酸（Aib）。测试了所合成的化合物的HDAC抑制活性，结果表明其中许多是HDAC的有效抑制剂。用芳香族氨基酸代替衣原体的Aib残基增强了体内和体外的抑制活性。我们已经对衣原霉素-异羟肟酸类似物进行了圆二色性和分子模拟研究，并将其与衣原霉素的溶液结构进行了比较。

  DOI：

  10.1016/j.bmc.2004.08.041

文献信息

• Chlamydocin–hydroxamic acid analogues as histone deacetylase inhibitors
  作者：Norikazu Nishino、Binoy Jose、Ryuzo Shinta、Tamaki Kato、Yasuhiko Komatsu、Minoru Yoshida

  DOI：10.1016/j.bmc.2004.08.041

  日期：2004.11

  Chlamydocin-hydroxamic acid analogues were designed and synthesized as histone deacetylase (HDAC) inhibitors based on the structure and HDAC inhibitory activity of chlamydocin and trichostatin A. Chlamydocin is a cyclic tetrapeptide containing an epoxyketone moiety in the side chain that makes it an irreversible inhibitor of HDAC. We replaced the epoxyketone moiety of chlamydocin with hydroxamic acid to

  根据衣原霉素和曲古抑菌素A的结构和HDAC抑制活性，设计并合成了衣原霉素-异羟肟酸类似物作为组蛋白脱乙酰基酶（HDAC）抑制剂。衣原霉素是环状四肽，在侧链中含有环氧酮部分，使其成为不可逆抑制剂。 HDAC。我们用异羟肟酸代替了衣原体的环氧酮部分，以设计有效且可逆的HDAC抑制剂。另外，对于一系列衣藻多菌素类似物系列，引入了许多氨基-环烷羧酸（Acc）而不是简单的氨基-异丁酸（Aib）。测试了所合成的化合物的HDAC抑制活性，结果表明其中许多是HDAC的有效抑制剂。用芳香族氨基酸代替衣原体的Aib残基增强了体内和体外的抑制活性。我们已经对衣原霉素-异羟肟酸类似物进行了圆二色性和分子模拟研究，并将其与衣原霉素的溶液结构进行了比较。