selection criteria for linked peptides in addition to mass. To provide such criteria, we incorporated cross-links with a distinct isotope pattern into the microtubule-destabilizing protein Op18/stathmin (Op18) and into complexes formed by Op18 with tubulin. The deuterium-labeled cross-linking reagents bis(sulfosuccinimidyl)-glutarate-d4, -pimelate-d4, and -sebacate-d4 were prepared together with their
在蛋白质相互作用分析中,一种鉴定参与蛋白质并同时表征相互作用位点的有前途的方法是对共价交联复合物的酶
水解产物进行质谱分析。尽管可以通过为蛋白质组分析开发的方法来完成蛋白质鉴定,但是仍然需要明确地检测和鉴定交联位点,而除了质量以外,还没有针对连接肽的选择标准。为了提供这样的标准,我们将具有独特同位素模式的交联引入微管稳定蛋白Op18 / stathmin(Op18)以及由Op18与微管蛋白形成的复合物中。
氘标记的
交联剂双(磺基琥珀
酰亚胺)-
戊二酸酯-d4,-
庚二酸酯-d4,和-
癸二酸酯-d4及其未
氘代的对应物一起制备,并以各自的d0和d4异位异构体的1∶1混合物形式使用。所得的d0 / d4同位素标签即使在复杂的酶促蛋白
水解物中也可以直接质谱检测带有连接子的肽。在通过MS / MS阐明连接肽的结构时,d0 / d4标签再次大大促进了连接
氨基酸的分配。通过平行应用两个具有相似反应性但间隔长度不