2'-O-叔丁基二甲基硅烷基尿苷 | 54925-71-2

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 嘧啶核苷
• 中文名称: 2'-O-叔丁基二甲基硅烷基尿苷
• 英文名称: 2'-O-(tert-butyldimethylsilyl)uridine
• 英文别名: 1-[(2R,3R,4R,5R)-3-[tert-butyl(dimethyl)silyl]oxy-4-hydroxy-5-(hydroxymethyl)oxolan-2-yl]pyrimidine-2,4-dione
• CAS: 54925-71-2
• 化学式: C₁₅H₂₆N₂O₆Si
• 分子量: 358.467
• InChiKey: AYQZFVZTNUOLCQ-OJAKKHQRSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  0.59
• 重原子数：
  24
• 可旋转键数：
  5
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.73
• 拓扑面积：
  108
• 氢给体数：
  3
• 氢受体数：
  6

安全信息

• 储存条件：
  2-8℃

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  2'-O-叔丁基二甲基硅烷基尿苷 在 1,3-丙二醇 环己烯 作用下， 以 甲醇 为溶剂， 生成 尿嘧啶核苷
  参考文献：
  名称：

  使用催化转移氢化从碳水化合物中除去TBDMS保护基

  摘要：

  催化转移氢化为从伯羟基和仲羟基裂解TBDMS醚提供了一种简便的方法。

  DOI：

  10.1016/0040-4039(91)80850-6
• 作为产物：
  描述：

  尿嘧啶核苷 在 咪唑 、 氟化氢吡啶 作用下， 以 吡啶 、 二氯甲烷 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 5.75h， 生成 2'-O-叔丁基二甲基硅烷基尿苷
  参考文献：
  名称：

  一种有效的制备用于亚磷酰胺RNA合成的受保护核糖核苷的方法

  摘要：

  描述了可用于亚磷酰胺RNA合成的受保护的核糖核苷的有效合成。二吨-butylsilylene组用于和的3'-保护同时核苷的5'位羟基的功能。随后将游离的2'-OH基团进行甲硅烷基化，然后在碱基部分上引入适当的保护，除去环甲硅烷基的保护基团并进行5'-OH的三苯甲基化反应，目标化合物的总收率为60-66％。

  DOI：

  10.1016/s0040-4039(02)00181-8

文献信息

• Synthesis and antibacterial activity of 5′-tetrachlorophthalimido and 5′-azido 5′-deoxyribonucleosides
  作者：Robert Van Ostrand、Casey Jacobsen、Alicia Delahunty、Carley Stringer、Ryan Noorbehesht、Haidi Ahmed、Ahmed M. Awad

  DOI：10.1080/15257770.2016.1250906

  日期：2017.3.4

  ABSTRACT Reported is an efficient synthesis of adenyl and uridyl 5′-tetrachlorophthalimido-5′-deoxyribonucleosides, and guanylyl 5′-azido-5′-deoxyribonucleosides, which are useful in solid-phase synthesis of phosphoramidate and ribonucleic guanidine oligonucleotides. Replacement of 5′-hydroxyl with tetrachlorophthalimido group was performed via Mitsunobu reaction for adenosine and uridine. An alternative

  摘要 报道了腺苷和尿苷基 5'-四氯邻苯二甲酰亚胺-5'-脱氧核糖核苷和鸟苷酰 5'-叠氮基-5'-脱氧核糖核苷的有效合成，可用于固相合成氨基磷酸酯和核糖核胍寡核苷酸。通过腺苷和尿苷的光信反应，用四氯邻苯二甲酰亚胺基团取代 5'-羟基。另一种方法用于鸟苷，用叠氮基取代 5'-羟基。将所得化合物转化为 5'-氨基-5'-脱氧核糖核苷用于寡核苷酸合成。合成中间体被测试为针对六种细菌菌株的抗微生物剂。所有含有 2',3'-O-异丙基保护基团的类似物均显示出对脑膜炎奈瑟菌的抗菌活性，
• Synthesis of 2′-<i>O</i>-Substituted Ribonucleosides
  作者：V. Serebryany、L. Beigelman

  DOI：10.1081/ncn-120022724

  日期：2003.10

  efficient synthesis of 2'-O-substituted ribonucleosides, including 2'-O-TBDMS and 2'-O-TOM protected as well as 2'-O-Me and 2'-O-allyl derivatives is presented. Di-t-butylsilylene group was employed for simultaneous protection of 3'- and 5'- hydroxyl functions of nucleoside on the first step. Subsequent silylation or alkylation of free 2'-OH followed by introduction of suitable protection on the base

  提出了2'-O-取代的核糖核苷的有效合成方法，包括2'-O-TBDMS和受保护的2'-O-TOM以及2'-O-Me和2'-O-烯丙基衍生物。第一步，使用二叔丁基亚甲硅烷基同时保护核苷的3'-和5'-羟基官能团。随后将游离的2'-OH进行甲硅烷基化或烷基化，然后在碱基部分上引入合适的保护基，并除去环状甲硅烷基保护基，从而以高收率得到目标化合物。
• Ceric Ammonium Nitrate on Silica Gel for Efficient and Selective Removal of Trityl and Silyl Groups
  作者：Jih Ru Hwu、Moti L. Jain、Fu-Yuan Tsai、Shwu-Chen Tsay、Arumugham Balakumar、Gholam H. Hakimelahi

  DOI：10.1021/jo000024o

  日期：2000.8.1

  triisopropylsilyl group from a primary hydroxyl functionality in di- or trisilyl ethers of ribonucleosides. A comparative study of deprotection reactions by utilization of CAN alone or CAN-SiO2 indicates a remarkable increase in the rate of the reactions involving a solid support. The mechanism of electron-transfer processes is proposed for the use of CAN-SiO2 in the removal of these protective groups from organic

  发现硅胶负载的硝酸铈铵（CAN-SiO2）在温和条件下可从受保护的核苷和核苷酸中快速选择性地裂解三苯甲基（Tr），单甲氧基三苯甲基（MMTr）和二甲氧基三苯甲基（DMTr）基团。脱保护的效率取决于所得碳阳离子物质的稳定性：DMTr +> MMTr +> Tr +。使用催化量的这种固体负载的试剂还可以有效地和选择性地从核糖核苷的二或三甲硅烷基醚中的伯羟基官能团中除去叔丁基二甲基甲硅烷基或三异丙基甲硅烷基。通过单独使用CAN或CAN-SiO2进行脱保护反应的比较研究表明，涉及固相支持物的反应速率显着提高。
• Formation of Interribonucleoside Phosphate Bond by the Use of Reagent Formed by the Reaction of 2-Chlorophenyl Phosphorodichloridate with 5-Nitrobenzotriazole and Preparation of Anticodon Triplet of Yeast tRNA^Lys
  作者：Hiroshi Seki、Oyo Mitsunobu

  DOI：10.1246/cl.1987.775

  日期：1987.5.5

  The reagent formed by the reaction of 2-chlorophenyl phosphorodichloridate with an equimolar amount of 5-nitrobenzotriazole was treated with protected ribonucleosides having free 3′-OH, followed by protected ribonucleosides having free 5′-OH in pyridine for 8 h (the second step), the corresponding dinucleoside phosphates being obtained in 55–84% yields. When the second step was carried out in the presence of 2,6-lutidine, the yields were increased to 80–90% within 2h. By this procedure, the anticodon triplet of yeast tRNALys was prepared in 71% yield.

  由2-氯苯基磷酸二氯酯与等摩尔量的5-硝基苯并三唑反应生成的试剂，经过处理带有游离3′-OH的保护核糖核苷，然后再处理带有游离5′-OH的保护核糖核苷，在吡啶中反应8小时（第二步），获得相应的二核苷酸磷酸盐，产率为55–84%。当第二步在2,6-路丁啶存在下进行时，产率在2小时内提高至80–90%。通过此步骤，酵母tRNALys的反密码子三联体以71%的产率制备成功。
• Facile and highly selective 5′-desilylation of multisilylated nucleosides
  作者：Xue-Feng Zhu、Howard J. Williams、A. Ian Scott

  DOI：10.1039/b003562i

  日期：——

  Efficient methods for selective 5'-desilylation of multisilylated nucleosides are described.

  介绍了选择性地对多硅烷基化核苷进行 5'-去硅烷基化的高效方法。