(-)-4-(tert-butyl) 2-methyl (2R,4R,5S)-5-(4-bromophenyl)-1-(2-((4-chlorophenyl)thio)acetyl)pyrrolidine-2,4-dicarboxylate | 1448550-68-2

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机酸及其衍生物 - 羧酸及其衍生物
• 英文名称: (-)-4-(tert-butyl) 2-methyl (2R,4R,5S)-5-(4-bromophenyl)-1-(2-((4-chlorophenyl)thio)acetyl)pyrrolidine-2,4-dicarboxylate
• 英文别名: 4-O-tert-butyl 2-O-methyl (2R,4R,5S)-5-(4-bromophenyl)-1-[2-(4-chlorophenyl)sulfanylacetyl]pyrrolidine-2,4-dicarboxylate
• CAS: 1448550-68-2
• 化学式: C₂₅H₂₇BrClNO₅S
• 分子量: 568.916
• InChiKey: HMHLHQGXKALGAE-KCZVDYSFSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  5.7
• 重原子数：
  34
• 可旋转键数：
  9
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.4
• 拓扑面积：
  98.2
• 氢给体数：
  0
• 氢受体数：
  6

反应信息

• 作为产物：
  描述：

  N-(4-bromobenzylidene)glycine methyl ester 在 potassium carbonate 、 三乙胺 、 lithium bromide 作用下， 以 四氢呋喃 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 29.0h， 生成 (-)-4-(tert-butyl) 2-methyl (2R,4R,5S)-5-(4-bromophenyl)-1-(2-((4-chlorophenyl)thio)acetyl)pyrrolidine-2,4-dicarboxylate
  参考文献：
  名称：

  Design of small-molecule thrombin inhibitors based on the cis-5-phenylproline scaffold

  摘要：

  为了开发一种口服抗凝药，设计了不含典型的丝氨酸蛋白酶抑制剂的强碱性胍基或氨基功能团的新型有机化合物。构建并优化了凝血酶活性位点的三维计算模型，以便对小分子有机化合物进行对接，并计算抑制剂-酶相互作用的能量。合成了1-[2-(4-氯苯硫)乙酰]-5-苯基吡咯烷-2,4-二羧酸的新型消旋衍生物，模型预测抑制剂与凝血酶活性位点的S1口袋之间存在氯-π相互作用。合成的化合物在体外灭活了凝血酶，抑制特性与计算结果显示出良好的相关性。

  DOI：

  10.1007/s11172-011-0107-x

文献信息

• Design of small-molecule thrombin inhibitors based on the cis-5-phenylproline scaffold
  作者：K. V. Kudryavtsev、D. A. Shulga、V. I. Chupakhin、A. V. Churakov、N. G. Datsuk、D. V. Zabolotnev、N. S. Zefirov

  DOI：10.1007/s11172-011-0107-x

  日期：2011.4

  The design of novel organic compounds containing no strongly basic amidine or guanidine functional groups typical of serine protease inhibitors was performed to develop an oral anticoagulant drug. A three-dimensional computational model for thrombin active site was constructed and optimized for docking of small-molecule organic compounds and calculating the energies of inhibitor-enzyme interactions. Novel racemic derivatives of 1-[2-(4-chlorophenylthio)acetyl]-5-phenylpyrrolidine-2,4-dicarboxylic acids were synthesized for which Cl-π interactions between the inhibitors and the S1 pocket of thrombin active site are predicted by modeling. The compounds synthesized deactivate thrombin in vitro and the inhibition properties show good correlations with the results of calculations.

  为了开发一种口服抗凝药，设计了不含典型的丝氨酸蛋白酶抑制剂的强碱性胍基或氨基功能团的新型有机化合物。构建并优化了凝血酶活性位点的三维计算模型，以便对小分子有机化合物进行对接，并计算抑制剂-酶相互作用的能量。合成了1-[2-(4-氯苯硫)乙酰]-5-苯基吡咯烷-2,4-二羧酸的新型消旋衍生物，模型预测抑制剂与凝血酶活性位点的S1口袋之间存在氯-π相互作用。合成的化合物在体外灭活了凝血酶，抑制特性与计算结果显示出良好的相关性。
• Asymmetric synthesis and molecular docking study of enantiomerically pure pyrrolidine derivatives with potential antithrombin activity
  作者：Seylan Ayan、Özdemir Dogan、Polina M. Ivantcova、Nikita G. Datsuk、Dmitry A. Shulga、Vladimir I. Chupakhin、Dmitry V. Zabolotnev、Konstantin V. Kudryavtsev

  DOI：10.1016/j.tetasy.2013.05.023

  日期：2013.7

  The (2R,4R,5S)- and (2S,4S,5R)-enantiomers of 4-(tert-butyl) 2-methyl 5-(4-bromophenyl)-pyrrolidine-2,4-dicarboxylate 3 were synthesized efficiently with an ee of >90% on a gram scale using a FAM-catalytic methodology. Subsequent modification afforded enantiopure N-((4-chlorophenyl)thio)acetyl pyrrolidine derivatives 4, which are potential thrombin inhibitors according to comprehensive molecular docking studies. (C) 2013 Elsevier Ltd. All rights reserved.