1-[3',5'-O-(1,1,3,3-tetraisopropyldisiloxane-1,3-diyl)-2'-deoxy-D-erythro-pent-1'-enofuranosyl]uracil | 170033-81-5

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 二嗪类
• 英文名称: 1-[3',5'-O-(1,1,3,3-tetraisopropyldisiloxane-1,3-diyl)-2'-deoxy-D-erythro-pent-1'-enofuranosyl]uracil
• 英文别名: 1-[(6aR,9aS)-2,2,4,4-tetra(propan-2-yl)-6a,9a-dihydro-6H-furo[3,2-f][1,3,5,2,4]trioxadisilocin-8-yl]pyrimidine-2,4-dione
• CAS: 170033-81-5
• 化学式: C₂₁H₃₆N₂O₆Si₂
• 分子量: 468.698
• InChiKey: FISXFXDAIJYNIR-ZWKOTPCHSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  3.69
• 重原子数：
  31
• 可旋转键数：
  5
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.71
• 拓扑面积：
  86.3
• 氢给体数：
  1
• 氢受体数：
  6

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  1-[3',5'-O-(1,1,3,3-tetraisopropyldisiloxane-1,3-diyl)-2'-deoxy-D-erythro-pent-1'-enofuranosyl]uracil 在 二甲基二环氧乙烷 作用下， 以 二氯甲烷 、 丙酮 为溶剂， 反应 0.5h， 生成 1-((1R,8R)-4,4,6,6-Tetraisopropyl-3,5,7,10,12-pentaoxa-4,6-disila-tricyclo[6.4.0.0^9,11]dodec-11-yl)-1H-pyrimidine-2,4-dione
  参考文献：
  名称：

  有机铝试剂对核苷1'，2'-环氧化合物的开环：立体选择进入核糖核苷在无核位置的分支

  摘要：

  从α面开始用二甲基二环氧乙烷将3'，5'- O-（二叔丁基亚甲硅烷基）-1'，2'-不饱和尿苷（11）环氧化，得到1'，2'-α-环氧化合物12。在与有机铝试剂反应，1' ，2'-α环氧化物12后行优先顺式开口环氧化物环中以得到1'-甲基- （的β端基异构体13 β），1'-乙基- （14 β），1'-异丁基- （15 β），1'-乙炔基（16 β），1,1'-乙烯基- （17 β）和1'-苯基- （18 β）尿苷衍生物，尽管除了与三苯基铝反应以外，还形成了相应的α-端基异构体。然而，发现用苄氧甲基或苯甲酰基保护11的N 3-位可导致所需β-端基异构体的排他性形成。提出了可能的解释所观察到的立体化学结果。发现类似的策略适用于1'-支链腺苷类似物的合成，其中包括受保护的阿古霉素C（37）。

  DOI：

  10.1021/jo030262u
• 作为产物：
  描述：

  3',5'-O-(1,1,3,3-tetraisopropyldisiloxane-1,3-diyl)-2'-deoxy-2'-phenylselenouridine 在 间氯过氧苯甲酸 、 三乙胺 作用下， 以 二氯甲烷 、 四氢呋喃 为溶剂， 反应 8.0h， 以74%的产率得到1-[3',5'-O-(1,1,3,3-tetraisopropyldisiloxane-1,3-diyl)-2'-deoxy-D-erythro-pent-1'-enofuranosyl]uracil
  参考文献：
  名称：

  通过由1,2-酰氧基迁移产生的异头基团，立体选择性合成1'-C-支链阿拉伯呋喃糖基核苷。

  摘要：

  尿嘧啶和腺嘌呤核苷异头位置的立体选择性CC键形成是通过由1,2-酰氧基迁移产生的异头自由基与自由基受体的反应完成的。本方法由以下步骤组成：（1）亲电加成（溴-新戊酰氧基化）到3'，5'-O-（1,1,3,3-四异丙基二硅氧烷-1,3-二基）保护的1'， 2'-不饱和核苷，（2）锡自由基介导的加合物与自由基受体的反应。烯丙基（三丁基）锡的使用以66％的产率产生了1′-C-烯丙基化的尿嘧啶核苷14以及未重排的2′-C-烯丙基化的产物15（6％）。在5的反应中也可以使用苯乙烯基（三丁基）锡和3-溴-2-甲基丙烯腈之类的自由基受体。得到16（70％）和17（76％），而不会形成未重排的产品。还研究了腺嘌呤对应物12的自由基介导的CC键形成。

  DOI：

  10.1021/jo020620d

文献信息

• Scaleable and efficient synthesis of 2′-deoxy-2′-N-phthaloyl nucleoside phosphoramidites for oligonucleotide synthesis
  作者：Alexander Karpeisky、David Sweedler、Peter Haeberli、Javier Read、Keith Jarvis、Leonid Beigelman

  DOI：10.1016/s0960-894x(02)00744-8

  日期：2002.11

  2'-Deoxy-2'-N-phthaloyl nucleosides were prepared from arabino nucleosides by triflate displacement with phthalimide in the presence of DBU. The corresponding phosphoramidites suitable for automated oligonucleotide synthesis were also synthesized. The scalability of described procedures was demonstrated on a 100-g scale preparation of 2'-deoxy-2'-amino-C phosphoramidite.

  通过在DBU存在下用邻苯二甲酰亚胺三氟甲磺酸酯置换从阿拉伯核苷制备2'-脱氧-2'-N-邻苯二甲酰基核苷。还合成了适用于自动寡核苷酸合成的相应亚磷酰胺。在100 g规模的2'-脱氧-2'-氨基-C亚磷酰胺制备中证明了所描述方法的可扩展性。
• Radical-initiated 1,2-acyloxy migration which generates a nucleoside anomeric radical
  作者：Yoshiharu Itoh、Kazuhiro Haraguchi、Hiromichi Tanaka、Kouichiro Matsumoto、Kazuo T. Nakamura、Ta-i Miyasaka

  DOI：10.1016/0040-4039(95)00718-r

  日期：1995.5

  Face-selectivity of bromo-pivaloyloxylation to 1'2'-unsaturated uridine can be altered by changing the 3'5'-O-protecting group. The resulting 2'-bromo-1'-pivaloyloxylated adduct, upon being reacted under radical conditions, undergoes 1,2-acyloxy migration to generate a nucleoside anomeric radical which was allowed to react with Bu(3)SnH or allyltributyltin. Factors governing stereochemistry and efficacy of this migration are also discussed.
• Furanyl nucleosides: synthesis and kinetics of their formation
  作者：Chryssostomos Chatgilialoglu、Despoina Vrantza、Thanasis Gimisis

  DOI：10.1016/j.tetlet.2004.04.045

  日期：2004.5

  The thermal reaction (at 140degreesC) of various 1',2'-didehydro-2'-deoxynucleosides afforded the corresponding furanyl nucleosides in good yields. The reaction kinetics were monitored by H-1 NMR and the mechanism in terms of 'four-center complex fission' is discussed. (C) 2004 Elsevier Ltd. All rights reserved.
• Stereoselective Synthesis of 1‘-<i>C</i>-Branched Arabinofuranosyl Nucleosides via Anomeric Radicals Generated by 1,2-Acyloxy Migration
  作者：Kazuhiro Haraguchi、Yoshiharu Itoh、Kouichiro Matsumoto、Kyoko Hashimoto、Kazuo T. Nakamura、Hiromichi Tanaka

  DOI：10.1021/jo020620d

  日期：2003.3.1

  formation at the anomeric position of uracil and adenine nucleoside has been accomplished through reaction of the anomeric radical, generated by 1,2-acyloxy migration, with a radical acceptor. The present method consists of the following steps: (1) electrophilic addition (bromo-pivaloyloxylation) to 3',5'-O-(1,1,3,3-tetraisopropyldisiloxane-1,3-diyl)-protected 1',2'-unsaturated nucleoside, (2) tin radical-mediated

  尿嘧啶和腺嘌呤核苷异头位置的立体选择性CC键形成是通过由1,2-酰氧基迁移产生的异头自由基与自由基受体的反应完成的。本方法由以下步骤组成：（1）亲电加成（溴-新戊酰氧基化）到3'，5'-O-（1,1,3,3-四异丙基二硅氧烷-1,3-二基）保护的1'， 2'-不饱和核苷，（2）锡自由基介导的加合物与自由基受体的反应。烯丙基（三丁基）锡的使用以66％的产率产生了1′-C-烯丙基化的尿嘧啶核苷14以及未重排的2′-C-烯丙基化的产物15（6％）。在5的反应中也可以使用苯乙烯基（三丁基）锡和3-溴-2-甲基丙烯腈之类的自由基受体。得到16（70％）和17（76％），而不会形成未重排的产品。还研究了腺嘌呤对应物12的自由基介导的CC键形成。
• Ring Opening of Nucleoside 1‘,2‘-Epoxides with Organoaluminum Reagents:  Stereoselective Entry to Ribonucleosides Branched at the Anomeric Position
  作者：Kazuhiro Haraguchi、Yutaka Kubota、Hiromichi Tanaka

  DOI：10.1021/jo030262u

  日期：2004.3.1

  uridine (11) with dimethyldioxirane proceeded from the α-face to give the 1‘,2‘-α-epoxide 12. Upon reacting with organoaluminum reagents, the 1‘,2‘-α-epoxide 12 underwent preferential syn-opening of the epoxide ring to yield the β-anomers of 1‘-methyl- (13β), 1‘-ethyl- (14β), 1‘-isobutyl- (15β), 1‘-ethynyl- (16β), 1‘-vinyl- (17β), and 1‘-phenyl- (18β) uridine derivatives, although the corresponding α-anomers

  从α面开始用二甲基二环氧乙烷将3'，5'- O-（二叔丁基亚甲硅烷基）-1'，2'-不饱和尿苷（11）环氧化，得到1'，2'-α-环氧化合物12。在与有机铝试剂反应，1' ，2'-α环氧化物12后行优先顺式开口环氧化物环中以得到1'-甲基- （的β端基异构体13 β），1'-乙基- （14 β），1'-异丁基- （15 β），1'-乙炔基（16 β），1,1'-乙烯基- （17 β）和1'-苯基- （18 β）尿苷衍生物，尽管除了与三苯基铝反应以外，还形成了相应的α-端基异构体。然而，发现用苄氧甲基或苯甲酰基保护11的N 3-位可导致所需β-端基异构体的排他性形成。提出了可能的解释所观察到的立体化学结果。发现类似的策略适用于1'-支链腺苷类似物的合成，其中包括受保护的阿古霉素C（37）。