6-methyl-1-[(1,3-dihydroxy-2-propoxy)methyl]uracil | 718633-21-7

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 二嗪类
• 英文名称: 6-methyl-1-[(1,3-dihydroxy-2-propoxy)methyl]uracil
• 英文别名: 1-[[2-Hydroxy-1-(hydroxymethyl)ethoxy]methyl]-6-methyl-pyrimidine-2,4-dione；1-(1,3-dihydroxypropan-2-yloxymethyl)-6-methylpyrimidine-2,4-dione
• CAS: 718633-21-7
• 化学式: C₉H₁₄N₂O₅
• 分子量: 230.221
• InChiKey: CSWFOWFOIGXGMQ-UHFFFAOYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -1.8
• 重原子数：
  16
• 可旋转键数：
  5
• 环数：
  1.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.56
• 拓扑面积：
  99.1
• 氢给体数：
  3
• 氢受体数：
  5

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  6-methyl-1-[(1,3-dihydroxy-2-propoxy)methyl]uracil 在 吡啶 、 4-二甲氨基吡啶 、 potassium fluoride 、 potassium carbonate 、 溶剂黄146 、 三乙胺 、 4,7,13,16,21,24-六氧-1,10-二氮双环[8.8.8]二十六烷 作用下， 以 乙醇 、 N,N-二甲基甲酰胺 、 乙腈 为溶剂， 反应 73.25h， 生成 6-methyl-1-[(3-fluoro-1-hydroxy-2-propoxy)methyl]uracil
  参考文献：
  名称：

  Syntheses of novel modified acyclic purine and pyrimidine nucleosides as potential substrates of herpes simplex virus type-1 thymidine kinase for monitoring gene expression

  摘要：

  自杀基因治疗利用单纯疱疹病毒1型胸腺嘧啶激酶基因（HSV-1 tk）被认为是治疗癌症的一种有前景的方法。该疗法利用病毒酶相对于人类胸腺嘧啶激酶的较低特异性，涉及向表达转移基因的细胞施加抗病毒药物（例如甘昔洛韦）作为前药，诱导这些细胞发生酶促细胞死亡。已经描述了¹⁸F标记的衍生物，用于通过正电子发射断层扫描（PET）监测病毒激酶酶活性的位置、持续时间和强度。由于尚未开发出最佳放射性示踪剂，因此合成了新颖的物质用于监测基因表达。合成了一组13个核苷类似物，其中包括N¹-甲基-9-[(1,3-二羟基-2-丙氧基)甲基]鸟苷（5）和N¹-甲基-9-[(4-羟基)-3-羟甲基丁基]鸟苷（7）作为甘昔洛韦和彭昔洛韦的甲基类似物及其相关的氟化合物（6，8）。进一步的新颖衍生物包括N⁶-甲基-9-[(1,3-二羟基-2-丙氧基)甲基]-，N⁶-甲基-9-[(4-羟基)-3-羟甲基丁基]腺嘌呤（9，10），以及尿嘧啶衍生物5-羟基-1-[(1,3-二羟基-2-丙氧基)甲基]尿嘧啶（11），6-甲基-1-[(1,3-二羟基-2-丙氧基)-甲基]尿嘧啶（12）及其3-氟衍生物（13）。关键词：氟化核苷类似物，基因治疗，PET，胸腺嘧啶激酶。

  DOI：

  10.1139/v04-005
• 作为产物：
  描述：

  6-甲基尿嘧啶 在 三甲基氯硅烷 、 potassium nonaflate 、 六甲基二硅氮烷 、 甲胺 作用下， 以 乙腈 为溶剂， 反应 10.0h， 生成 6-methyl-1-[(1,3-dihydroxy-2-propoxy)methyl]uracil
  参考文献：
  名称：

  能够模拟天然2'-脱氧核糖的具有1-[（（2-羟基-1-（羟甲基）乙氧基）甲基]部分的嘧啶对野生型和突变型乙型肝炎病毒复制的影响。

  摘要：

  乙型肝炎病毒（HBV）是全世界慢性肝病的最常见原因。由于长期使用和停止治疗后病毒DNA反弹，对临床抗HBV药物拉米夫定产生的耐药性已成为当前疗法的主要挫折。我们合成了一系列嘧啶核苷，它们在C-5位具有多个取代基，在N-1位具有1-[（（2-羟基-1-（羟甲基）乙氧基）甲基]柔性无环糖基部分，具有模仿天然2'-脱氧核糖基部分的能力。这些潜在的抗病毒化合物中的一些在尿嘧啶碱基的C-5和C-6位置均包含变异。尿嘧啶衍生物的其他变体是6-氮杂同源物。还制备了4-氨基和4-甲氧基嘧啶衍生物。碱基部分被5-氯-（25），5-（2-溴乙烯基）-（32）或5-溴-6-甲基-（37）基团取代的化合物对鸭HBV具有显着的活性，野生型人HBV（2.2.15个细胞）和抗拉米夫定的HBV，其中包含单突变和双突变。直至测试的最高浓度，在宿主HepG2和Vero细胞中均未见细胞毒性。与相应的嘌呤核苷更昔洛韦相比，化合物

  DOI：

  10.1021/jm060102l

文献信息

• Synthesis of modified pyrimidine bases and positive impact of chemically reactive substituents on their in vitro antiproliferative activity
  作者：Steffi Noll、Marijeta Kralj、Lidija Šuman、Holger Stephan、Ivo Piantanida

  DOI：10.1016/j.ejmech.2008.06.002

  日期：2009.3

  The antiproliferative activity screening on human tumor cell lines of a series of modified uracil and cytosine bases as well as some corresponding acyclonucleosides, and comparison of structure–activity relationship revealed the importance of chemical reactivity of the substituent attached to the C5-position of uracil for the activity of studied compounds. Namely, the results obtained for the most

  一系列修饰的尿嘧啶和胞嘧啶碱基以及一些相应的无环核苷在人肿瘤细胞系中的抗增殖活性筛选，以及结构-活性关系的比较表明，尿嘧啶C5位上取代基的化学反应活性对于研究化合物的活性。即，对于活性最高的化合物5-（氯乙酰氨基）尿嘧啶（2）及其无环糖类似物18所获得的结果表明，反应性取代基与胸苷酸合酶机制内若干可能的靶标之间形成了共价键（半胱氨酸残基，酶的基本部分，N，N-亚甲基四氢叶酸或其反应性亚胺形式）是最可能的作用方式。另外，新型的C 5-取代的尿嘧啶衍生物6（5- [双-（2-对-甲氧基苄基硫乙基）胺]乙酰氨基尿嘧啶）通过未知的机制对HeLa和MiaPaCa-2细胞系表现出高的抗增殖活性。
• Effect of Various Pyrimidines Possessing the 1-[(2-Hydroxy-1-(hydroxymethyl)ethoxy)methyl] Moiety, Able To Mimic Natural 2‘-Deoxyribose, on Wild-type and Mutant Hepatitis B Virus Replication
  作者：Rakesh Kumar、Wassila Semaine、Monika Johar、D. Lorne J. Tyrrell、Babita Agrawal

  DOI：10.1021/jm060102l

  日期：2006.6.1

  glycosyl moiety at the N-1 position, that have the ability to mimic the natural 2'-deoxyribosyl moiety. Some of these potential antiviral compounds included variations at both C-5 and C-6 positions of the uracil base. Other variations of the uracil derivatives were the 6-aza congeners. 4-Amino and 4-methoxy pyrimidine derivatives were also made. Compounds in which the base moiety was substituted by 5-chloro-

  乙型肝炎病毒（HBV）是全世界慢性肝病的最常见原因。由于长期使用和停止治疗后病毒DNA反弹，对临床抗HBV药物拉米夫定产生的耐药性已成为当前疗法的主要挫折。我们合成了一系列嘧啶核苷，它们在C-5位具有多个取代基，在N-1位具有1-[（（2-羟基-1-（羟甲基）乙氧基）甲基]柔性无环糖基部分，具有模仿天然2'-脱氧核糖基部分的能力。这些潜在的抗病毒化合物中的一些在尿嘧啶碱基的C-5和C-6位置均包含变异。尿嘧啶衍生物的其他变体是6-氮杂同源物。还制备了4-氨基和4-甲氧基嘧啶衍生物。碱基部分被5-氯-（25），5-（2-溴乙烯基）-（32）或5-溴-6-甲基-（37）基团取代的化合物对鸭HBV具有显着的活性，野生型人HBV（2.2.15个细胞）和抗拉米夫定的HBV，其中包含单突变和双突变。直至测试的最高浓度，在宿主HepG2和Vero细胞中均未见细胞毒性。与相应的嘌呤核苷更昔洛韦相比，化合物
• Syntheses of novel modified acyclic purine and pyrimidine nucleosides as potential substrates of herpes simplex virus type-1 thymidine kinase for monitoring gene expression
  作者：Michaela Grote、Steffi Noll、Bernhard Noll、Bernd Johannsen、Werner Kraus

  DOI：10.1139/v04-005

  日期：2004.4.1

  Suicide gene therapy with the herpes simplex virus type-1 thymidine kinase gene (HSV-1 tk) is considered to be a promising approach to the treatment of cancer. Making use of the lower specificity of the viral enzyme compared to human thymidine kinase, the therapy involves the administration of antiviral agents (e.g., ganciclovir) as prodrugs to induce enzymatic cell death in those cells that express the transferred gene. ¹⁸F-labelled derivatives have been described for monitoring location, duration, and magnitude of the viral kinase enzyme activity by positron emission tomography (PET). Since an optimal radiotracer has not been developed, novel substances were synthesized for monitoring gene expression. A group of 13 nucleoside analogues were synthesized, among them N¹-methyl-9-[(1,3-dihydroxy-2-propoxy)methyl]guanine (5) and N¹-methyl-9-[(4-hydroxy)-3-hydroxymethylbutyl]guanine (7) as methyl analogues of ganciclovir and penciclovir and their related fluoro compounds (6, 8). Further novel derivatives include N⁶-methyl-9-[(1,3-dihydroxy-2-propoxy)methyl]-, N⁶-methyl-9-[(4-hydroxy)-3-hydroxymethylbutyl]adenine (9, 10), as well as the uracil derivatives 5-hydroxy-1-[(1,3-dihydroxy-2-propoxy)methyl]uracil (11), 6-methyl-1-[(1,3-dihydroxy-2-propoxy)-methyl]uracil (12), and its 3-fluoro-derivative (13).Key words: fluorinated nucleoside analogues, gene therapy, PET, thymidine kinase.

  自杀基因治疗利用单纯疱疹病毒1型胸腺嘧啶激酶基因（HSV-1 tk）被认为是治疗癌症的一种有前景的方法。该疗法利用病毒酶相对于人类胸腺嘧啶激酶的较低特异性，涉及向表达转移基因的细胞施加抗病毒药物（例如甘昔洛韦）作为前药，诱导这些细胞发生酶促细胞死亡。已经描述了¹⁸F标记的衍生物，用于通过正电子发射断层扫描（PET）监测病毒激酶酶活性的位置、持续时间和强度。由于尚未开发出最佳放射性示踪剂，因此合成了新颖的物质用于监测基因表达。合成了一组13个核苷类似物，其中包括N¹-甲基-9-[(1,3-二羟基-2-丙氧基)甲基]鸟苷（5）和N¹-甲基-9-[(4-羟基)-3-羟甲基丁基]鸟苷（7）作为甘昔洛韦和彭昔洛韦的甲基类似物及其相关的氟化合物（6，8）。进一步的新颖衍生物包括N⁶-甲基-9-[(1,3-二羟基-2-丙氧基)甲基]-，N⁶-甲基-9-[(4-羟基)-3-羟甲基丁基]腺嘌呤（9，10），以及尿嘧啶衍生物5-羟基-1-[(1,3-二羟基-2-丙氧基)甲基]尿嘧啶（11），6-甲基-1-[(1,3-二羟基-2-丙氧基)-甲基]尿嘧啶（12）及其3-氟衍生物（13）。关键词：氟化核苷类似物，基因治疗，PET，胸腺嘧啶激酶。