6-(4-Fluoro-benzyl)-5-methyl-2-thioxo-2,3-dihydro-1H-pyrimidin-4-one | 221121-61-5

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 二嗪类
• 英文名称: 6-(4-Fluoro-benzyl)-5-methyl-2-thioxo-2,3-dihydro-1H-pyrimidin-4-one
• 英文别名: 6-[(4-fluorophenyl)methyl]-5-methyl-2-sulfanylidene-1H-pyrimidin-4-one
• CAS: 221121-61-5
• 化学式: C₁₂H₁₁FN₂OS
• 分子量: 250.297
• InChiKey: YFAQXZJVEVPTAQ-UHFFFAOYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  2
• 重原子数：
  17
• 可旋转键数：
  2
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.17
• 拓扑面积：
  73.2
• 氢给体数：
  2
• 氢受体数：
  3

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  6-(4-Fluoro-benzyl)-5-methyl-2-thioxo-2,3-dihydro-1H-pyrimidin-4-one 在 sodium tetrahydroborate 、 potassium carbonate 作用下， 以 四氢呋喃 、 甲醇 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 生成 6-(4-fluorobenzyl)-2-((2-(4-fluorophenyl)-2-hydroxyethyl)thio)-5-methylpyrimidin-4(3H)-one
  参考文献：
  名称：

  新型抗丙型肝炎病毒（HCV）药剂的合成和生物学评估：2-羟基苯乙基硫烷基硫氧嘧啶

  摘要：

  已经合成了一系列新的二氢-羟基-苯基-硫烷基-ω-环己基/苯基-氧嘧啶衍生物，并使用Huh 7.5.1细胞评估了它们的体外抗丙型肝炎病毒活性。一些化合物显示出中等的抗丙型肝炎病毒活性，EC 50为7.53至0.13μM。在所有化合物中，6-（环己基甲基）-5-乙基-2-（（2-羟基-2-苯基乙基）硫基）嘧啶-4（3H）-一（3a）在抑制丙型肝炎方面最有潜力EC 50病毒该化合物的值是0.13μM，SI值是121。注意到这些化合物中的一些对丙型肝炎病毒和人免疫缺陷病毒均具有活性。除实验评估外，还讨论了这些新同类物的构效关系和分子模型分析。

  DOI：

  10.1007/s00044-017-1815-z
• 作为产物：
  描述：

  4-氟苯乙酸 在 sodium ethanolate 、 三乙胺 、 magnesium chloride 作用下， 以 乙醇 、 乙腈 为溶剂， 反应 2.0h， 生成 6-(4-Fluoro-benzyl)-5-methyl-2-thioxo-2,3-dihydro-1H-pyrimidin-4-one
  参考文献：
  名称：

  具有亚纳摩尔级抗HIV-1活性的新S-DABO衍生物的平行溶液相和微波辅助合成。

  摘要：

  已经建立了用于平行溶液相合成的简单而有效的方法，以获得一系列硫尿嘧啶，然后在微波辐射下选择性地将S-苄基化，得到新的S-DABO。生物筛选导致鉴定出对高度纯化的重组人免疫缺陷病毒1型（HIV-1）逆转录酶（RT）酶（野生型和突变型）和野生型（wt）和突变型HIV具有纳摩尔活性的化合物-1株。特别是，发现20种是迄今为止报道的最有效的S-DABO（针对分离的wt酶的ID50 = 26 nM），对wt和多抗性病毒（IRLL98）HIV-1菌株均具有亚纳摩尔活性（EC50 <0.14 nM和EC50分别为0.22 nM）。

  DOI：

  10.1021/jm050744t

文献信息

• Parallel Solution-Phase and Microwave-Assisted Synthesis of New <i>S</i>-DABO Derivatives Endowed with Subnanomolar Anti-HIV-1 Activity
  作者：Fabrizio Manetti、José A. Esté、Imma Clotet-Codina、Mercedes Armand-Ugón、Giovanni Maga、Emmanuele Crespan、Reynel Cancio、Claudia Mugnaini、Cesare Bernardini、Andrea Togninelli、Caterina Carmi、Maddalena Alongi、Elena Petricci、Silvio Massa、Federico Corelli、Maurizio Botta

  DOI：10.1021/jm050744t

  日期：2005.12.1

  for the parallel solution-phase synthesis has been set up to obtain a series of thiouracils, in turn selectively S-benzylated under microwave irradiation to give new S-DABOs. Biological screening led to the identification of compounds with nanomolar activity toward both the highly purified recombinant human immunodeficiency virus type 1 (HIV-1) reverse transcriptase (RT) enzyme (wild-type and mutants)

  已经建立了用于平行溶液相合成的简单而有效的方法，以获得一系列硫尿嘧啶，然后在微波辐射下选择性地将S-苄基化，得到新的S-DABO。生物筛选导致鉴定出对高度纯化的重组人免疫缺陷病毒1型（HIV-1）逆转录酶（RT）酶（野生型和突变型）和野生型（wt）和突变型HIV具有纳摩尔活性的化合物-1株。特别是，发现20种是迄今为止报道的最有效的S-DABO（针对分离的wt酶的ID50 = 26 nM），对wt和多抗性病毒（IRLL98）HIV-1菌株均具有亚纳摩尔活性（EC50 <0.14 nM和EC50分别为0.22 nM）。
• Solution-phase parallel synthesis of S-DABO analogues
  作者：Andrea Togninelli、Caterina Carmi、Elena Petricci、Claudia Mugnaini、Silvio Massa、Federico Corelli、Maurizio Botta

  DOI：10.1016/j.tetlet.2005.10.142

  日期：2006.1

  A simple and straightforward methodology for the parallel, solution-phase synthesis of a new series of S-DABO derivatives 1 and 2, bearing aromatic substituents at the C2 and C6 positions, has been developed. Starting from potassium ethyl malonates 3, thiouracil intermediates 5 were prepared through parallel synthesis and isolated as pure products by simple extraction with ethyl acetate. Selective

  已经开发出一种简单，直接的方法，用于平行，溶液相合成一系列在C2和C6位置带有芳族取代基的S -DABO衍生物1和2。从丙二酸乙基钾3出发，通过平行合成制备硫尿嘧啶中间体5，并通过用乙酸乙酯简单萃取将其分离为纯产物。在微波辐射下，在几分钟内完成5的选择性S-苄基化反应，得到标题化合物1，与相应的砜2平行氧化。一些新化合物1 对HIV-1 RT显示出有效的抑制活性。
• 5-Alkyl-2-(alkylthio)-6-(2,6-dihalophenylmethyl)-3,4-dihydropyrimidin-4(3<i>H</i>)-ones:  Novel Potent and Selective Dihydro-alkoxy-benzyl-oxopyrimidine Derivatives
  作者：Antonello Mai、Marino Artico、Gianluca Sbardella、Silvio Massa、Ettore Novellino、Giovanni Greco、Anna Giulia Loi、Enzo Tramontano、Maria Elena Marongiu、Paolo La Colla

  DOI：10.1021/jm980260f

  日期：1999.2.1

  Molecular modeling analysis of compounds belonging to the recently published series of dihydroalkoxy-benzyl-oxopyrimidines (DABOs), such as S-DABOs and DATNOs, gave support to the design of new 2,6-disubstituted benzyl-DABO derivatives as highly potent and specific inhibitors of the HIV-1 reverse transcriptase (RT). To follow up on the novel DABO derivatives, we decided to investigate the effect of electron-withdrawing substituents in the benzyl unit of the S-DABO skeleton versus their anti-HIV-1 activity. Such chemical modifications impacted the inhibitory activity, especially when two halogen units were introduced at positions 2 and 6 in the phenyl portion of the benzyl group bound to C-6 of the pyrimidine ring. Various 5-alkyl-2-(alkyl(or cycloalkyl)thio)-6-(2,B-dichloro(or 2, 6-difluoro)phenylmethyl)-3,4-dihydropyrimidin-4(3H)-ones were then synthesized and tested as anti-HIV-1 agents in both cell-based and enzyme (recombinant reverse transcriptase, rRT) assays. Among the various mono- and disubstituted phenyl derivatives, the most potent were those containing a 6-(2,6-difluorophenylmethyl) substituent (F-DABOs), which showed EC50's ranging between 40 and 90 nM and selectivity indexes up to greater than or equal to 5000. An excellent correlation was found between EC50 and IC50 values which confirmed that these compounds act as inhibitors of the HIV-1 RT. The structure-activity relationships of the newly synthesized pyrimidinones are presented herein.
• Synthesis and biological evaluation of novel anti-hepatitis C virus (HCV) agents: 2-hydroxylphenethyl sulfanyl-oxopyrimidines
  作者：Daochun Wu、Yue Feng、Hua Wang、Junfeng Yang、Xian Chen、Yueping Wang、Christopher Cong Lai、Yufang Zhang、Cong Li、Xueshan Xia、Yanping He

  DOI：10.1007/s00044-017-1815-z

  日期：2017.7

  and their in vitro anti-hepatitis C virus activities have been evaluated using Huh 7.5.1 cells. Some of the compounds showed moderate anti-hepatitis C virus activities, with EC50 range from 7.53 to 0.13 μM. Among all the compounds, 6-(cyclohexylmethyl)-5-ethyl-2-((2-hydroxy-2-phenylethyl)thio)-pyrimidin-4 (3H)-one (3a) had the most promising potential in inhibiting hepatitis C virus with an EC50 value

  已经合成了一系列新的二氢-羟基-苯基-硫烷基-ω-环己基/苯基-氧嘧啶衍生物，并使用Huh 7.5.1细胞评估了它们的体外抗丙型肝炎病毒活性。一些化合物显示出中等的抗丙型肝炎病毒活性，EC 50为7.53至0.13μM。在所有化合物中，6-（环己基甲基）-5-乙基-2-（（2-羟基-2-苯基乙基）硫基）嘧啶-4（3H）-一（3a）在抑制丙型肝炎方面最有潜力EC 50病毒该化合物的值是0.13μM，SI值是121。注意到这些化合物中的一些对丙型肝炎病毒和人免疫缺陷病毒均具有活性。除实验评估外，还讨论了这些新同类物的构效关系和分子模型分析。