2,3-dimethyl-3-(4-sulfonatobutyl)-1-phenyl-3H-indolium | 1622234-23-4

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 吲哚及其衍生物
• 英文名称: 2,3-dimethyl-3-(4-sulfonatobutyl)-1-phenyl-3H-indolium
• 英文别名: 2,3-Dimethyl-3-(4-sulfonatobutyl)-1-phenyl-3H-indolium；4-(2,3-dimethyl-1-phenylindol-1-ium-3-yl)butane-1-sulfonate
• CAS: 1622234-23-4
• 化学式: C₂₀H₂₃NO₃S
• 分子量: 357.474
• InChiKey: PQFNVGCGBUKOJI-UHFFFAOYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  3.2
• 重原子数：
  25
• 可旋转键数：
  5
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.35
• 拓扑面积：
  68.6
• 氢给体数：
  0
• 氢受体数：
  3

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  3,3-dimethyl-1-(5-carboxypentyl)-2-(4-anilidovinyl)-3H-indol-1-ium-5-sulfonate 、 2,3-dimethyl-3-(4-sulfonatobutyl)-1-phenyl-3H-indolium 在 乙酸酐 、 溶剂黄146 、 吡啶 作用下， 反应 3.5h， 以35%的产率得到triethylammonium 2-{(5-[(4-sulfonatobutyl)-1-phenyl-3-methyl]-1,2-dihydro-3H-indol-2-ylidene)-1-propen-1-yl}-3,3-dimethyl-1-(5-carboxypentyl)-indol-1-ium-5-sulfonate
  参考文献：
  名称：

  Polymethine compounds and their use as fluorescent labels

  摘要：

  本公开涉及新的聚甲烯化合物及其作为荧光标记物的用途。这些化合物可以作为核酸测序应用中核苷酸的荧光标记物。

  公开号：

  US08809551B1
• 作为产物：
  描述：

  5-(ethoxycarbonyl)-5-methyl-6-oxoheptane-1-sulfonic acid 在 potassium hydroxide 作用下， 以 水 为溶剂， 生成 2,3-dimethyl-3-(4-sulfonatobutyl)-1-phenyl-3H-indolium
  参考文献：
  名称：

  一种荧光化合物及其制备方法、荧光修饰核苷酸、试剂盒

  摘要：

  本发明涉及有机化合物试剂技术领域，具体涉及一种荧光化合物及其制备方法、荧光修饰核苷酸、试剂盒，其中荧光修饰核苷酸能够应用于边合成边测序的核酸测序反应。本发明创造性的改进‑COR5‑与荧光化合物核心结构之间的连接结构，采用含有醚键的杂烷基结构‑(CH2)m‑O‑(CH2)n‑作为连接结构将连接基‑COR5‑连接至荧光化合物核心结构，提高荧光化合物作为修饰分子形成的修饰核苷酸用作核酸测序反应过程中的聚合酶亲和力，提高掺入效率，同时也提高测序质量。

  公开号：

  CN114656394A

文献信息

• [EN] POLYMETHINE COMPOUNDS AND THEIR USE AS FLUORESCENT LABELS<br/>[FR] COMPOSÉS DE POLYMÉTHINE ET LEUR UTILISATION COMME MARQUEURS FLUORESCENTS
  申请人：ILLUMINA CAMBRIDGE LTD

  公开号：WO2014135221A1

  公开（公告）日：2014-09-12

  The present disclosure relates to new polymethine compounds and their use as fluorescent labels. The compounds may be used as fluorescent labels for nucleotides in nucleic acid sequencing applications.

  本公开涉及新的聚甲亚胺化合物及其作为荧光标记物的用途。这些化合物可用作核酸测序应用中核苷酸的荧光标记物。
• POLYMETHINE COMPOUNDS AND THEIR USE AS FLUORESCENT LABELS
  申请人：Illumina Cambridge Limited

  公开号：US20150167073A1

  公开（公告）日：2015-06-18

  The present disclosure relates to new polymethine compounds and their use as fluorescent labels. The compounds may be used as fluorescent labels for nucleotides in nucleic acid sequencing applications.

  本公开涉及新的聚甲烯化合物及其作为荧光标记物的用途。该化合物可用作核酸测序应用中核苷酸的荧光标记物。
• 一种荧光化合物、荧光修饰核苷酸、试剂盒
  申请人：郑州思昆生物工程有限公司

  公开号：CN114671843A

  公开（公告）日：2022-06-28

  本发明涉及有机化合物试剂技术领域，具体涉及一种荧光化合物、荧光修饰核苷酸、试剂盒，其中荧光修饰核苷酸能够应用于边合成边测序的核酸测序反应。本发明创造性的改进‑COR11‑与荧光化合物核心结构之间的连接结构，采用含有醚键的杂烷基结构‑(CH2)m‑O‑(CH2)n‑作为连接结构将连接基‑COR11‑连接至荧光化合物核心结构，提高荧光化合物作为修饰分子形成的修饰核苷酸用作核酸测序反应过程中的聚合酶亲和力，提高掺入效率，同等掺入效率需求条件下，降低试剂用量，降低试剂成本。
• TW2016/5796
  申请人：——

  公开号：——

  公开（公告）日：——
• MULTIPLEXED FLUORESCENT DETECTION OF ANALYTES
  申请人：Illumina, Inc.

  公开号：EP3837384A1

  公开（公告）日：2021-06-23