N-(2-((Boc)amino)ethyl)-β-alanine methyl ester | 677028-32-9

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机酸及其衍生物 - 羧酸及其衍生物
• 英文名称: N-(2-((Boc)amino)ethyl)-β-alanine methyl ester
• 英文别名: N-Boc-ethylenediamine propionic acid methyl ester；methyl 3-((2-((tertbutoxycarbonyl)amino)ethyl)amino)propanoate；(N-Boc-aminoethyl)-β-alanine methyl ester；Methyl 3-((2-((tert-butoxycarbonyl)amino)ethyl)amino)propanoate；methyl 3-[2-[(2-methylpropan-2-yl)oxycarbonylamino]ethylamino]propanoate
• CAS: 677028-32-9
• 化学式: C₁₁H₂₂N₂O₄
• 分子量: 246.307
• InChiKey: ABXAVZNGKMUOKD-UHFFFAOYSA-N

物化性质

• 沸点：
  358.7±27.0 °C(Predicted)
• 密度：
  1.049±0.06 g/cm3(Predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  0.3
• 重原子数：
  17
• 可旋转键数：
  9
• 环数：
  0.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.82
• 拓扑面积：
  76.7
• 氢给体数：
  2
• 氢受体数：
  5

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  N-(2-((Boc)amino)ethyl)-β-alanine methyl ester 在 lithium hydroxide 、 1-羟基苯并三唑 、 盐酸-N-乙基-Nˊ-(3-二甲氨基丙基)碳二亚胺 、 三乙胺 、 三氟乙酸 作用下， 以 水 为溶剂， 生成
  参考文献：
  名称：

  双取代的3-（氨基乙氧基）丙酸连接基约束的二肽的合成与构象研究

  摘要：

  已经制备了具有二甲基取代的3-（氨基乙氧基）丙酸连接基的一系列环状化合物作为潜在的β-转角模拟物。期望的连接子从二取代的吡喃酮，将其加上二肽，然后进行使用氰基磷酸二乙酯，得到环状化合物大环化来制备1 - 5。使用NMR和X射线晶体学进行构象分析。发现所有五个环状化合物都以I型或II型β-转角构象存在。

  DOI：

  10.1021/jo035683q
• 作为产物：
  描述：

  ([2-[(叔丁氧羰基)氨基]乙基]氨基)乙酸 以 水 、 丙烯酸甲酯（MA） 、 乙腈 为溶剂， 以13.09 g (46%)的产率得到N-(2-((Boc)amino)ethyl)-β-alanine methyl ester
  参考文献：
  名称：

  Peptide nucleic acids having 2,6-diaminopurine nucleobases

  摘要：

  一种新型化合物类别，被称为肽核酸，比相应的DNA链和RNA链结合更牢固，并表现出增强的序列特异性和结合亲和力。该发明的肽核酸包括从天然存在的核碱基和连接到聚酰胺骨架的非天然核碱基中选择的配体。该发明的一些肽核酸还包含C1-C8烷基胺侧链。

  公开号：

  US06414112B1

文献信息

• [EN] NOVEL COMPOUNDS AND COMPOSITION FOR TARGETED THERAPY OF KIDNEY-ASSOCIATED CANCERS<br/>[FR] NOUVEAUX COMPOSÉS ET COMPOSITION POUR LA THÉRAPIE CIBLÉE DE CANCERS ASSOCIÉS AU REIN
  申请人：MICURX PHARMACEUTICALS INC

  公开号：WO2021150792A1

  公开（公告）日：2021-07-29

  The present invention provides therapeutic compounds of the following formula I: or pharmaceutically acceptable salts, hydrates, or solvates thereof that are therapeutic or anticancer agents, pharmaceutical compositions containing them, methods for their use, and methods for preparing these compounds.

  本发明提供了以下化合物I的治疗性化合物：或其药用可接受的盐、水合物或溶剂合物，这些化合物是治疗性或抗癌剂，包含它们的药物组合物，使用它们的方法，以及制备这些化合物的方法。
• Modification of the binding affinity of peptide nucleic acids (PNA). PNA with extended backbones consisting of 2-aminoethyl-β-alanine or 3-aminopropylglycine units
  作者：Birgitte Hyrup、Michael Egholm、Marc Rolland、Peter E. Nielsen、Rolf H. Berg、Ole Buchardt

  DOI：10.1039/c39930000518

  日期：——

  The binding affinity between peptide nucleic acids (PNA) and DNA is reduced by incorporation of PNA units with extended backbones.

  肽核酸（PNA）与DNA之间的结合亲和力通过将PNA单元与扩展的骨架结合而降低。
• Thermodynamic studies of a series of homologous HIV-1 TAR RNA ligands reveal that loose binders are stronger Tat competitors than tight ones
  作者：Lise Pascale、Stéphane Azoulay、Audrey Di Giorgio、Laura Zenacker、Marc Gaysinski、Pascal Clayette、Nadia Patino

  DOI：10.1093/nar/gkt237

  日期：2013.6

  stronger Tat competitors than those forming tight ones, and thermal denaturation studies demonstrated that loose complexes are more stable than tight ones. This could be correlated to the fact that loose and tight ligands induce distinct RNA conformational changes as revealed by circular dichroism experiments, although nuclear magnetic resonance (NMR) experiments showed that the TAR binding site is the

  RNA 是一个主要的药物靶点，但调节 RNA 功能的小分子的设计仍然是一个巨大的挑战。在这种情况下，研究了一系列结构同源的“聚酰胺氨基酸”（PAA）作为 HIV-1 反式激活反应（TAR）RNA 配体。一项广泛的热力学研究揭示了焓-熵补偿现象的发生，导致所有 PAA 的 TAR 亲和力非常接近。然而，根据它们的结构，它们的结合模式和它们与 Tat 片段竞争的能力有很大不同。令人惊讶的是，与 TAR 形成松散复合物的 PAA 比形成紧密复合物的 PAA 更强，热变性研究表明松散复合物比紧密复合物更稳定。这可能与圆二色性实验揭示的松散和紧密配体诱导不同的 RNA 构象变化有关，尽管核磁共振 (NMR) 实验表明 TAR 结合位点在所有情况下都是相同的。最后，一些松散的 PAA 也显示出对 HIV 感染细胞的有希望的抑制活性。总之，这些结果有助于更好地理解 RNA 相互作用模式，这对于设计相关 RNA
• Oxygen-Substituted Isocyanates: Blocked (Masked) Isocyanates Enable Controlled Reactivity
  作者：Ryan A. Ivanovich、Dilan E. Polat、André M. Beauchemin

  DOI：10.1002/adsc.201701046

  日期：2017.12.19

  Oxygen‐substituted isocyanates (O‐isocyanates) are rare isocyanates with a reported propensity to trimerize, a side‐reaction that severely limited their use in synthesis. Herein, the development of blocked (masked) O‐isocyanate precursors that form this reactive intermediate in situ provide controlled reactivity, allowing the first examples of cascade reactions involving O‐isocyanates. Complex hydroxylamine‐derived

  氧取代的异氰酸酯（O-异氰酸酯）是稀有的异氰酸酯，据报道具有三聚作用的倾向，这种副反应严重限制了它们在合成中的使用。这里，原位形成该反应性中间体的嵌段（掩蔽的）O-异氰酸酯前体的开发提供了可控的反应性，这是涉及O-异氰酸酯的级联反应的第一个例子。复杂的羟胺衍生的乙内酰脲和二氢尿嘧啶化合物可以从α-和β-氨基酯快速组装，这说明了被掩盖的O-异氰酸酯作为羟胺衍生的结构单元的便利性。提供了O-异氰酸酯中间体的中间证据。
• Triplex‐Forming Peptide Nucleic Acids with Extended Backbones
  作者：Vipin Kumar、Nikita Brodyagin、Eriks Rozners

  DOI：10.1002/cbic.202000432

  日期：2020.12

  PNAs form higher‐stability triple helices with dsRNA than DNA. Structural considerations suggested that extending the PNA backbone by one carbon atom might reverse this preference in favor of DNA; however, experiments disproved this hypothesis. The studies suggested that PNA has an inherent preference for forming A‐form triple‐helical structures and, hence, has higher affinity for RNA than DNA.

  PNA 与 dsRNA 形成比 DNA 稳定性更高的三螺旋。结构考虑表明，将 PNA 主链延长一个碳原子可能会逆转这种偏好，有利于 DNA；然而，实验反驳了这个假设。研究表明，PNA 具有形成 A 型三螺旋结构的内在偏好，因此对 RNA 的亲和力高于 DNA。