ethyl β-(1-methyl-4-nitropyrrole-2-carboxamido)alaninate | 152916-77-3

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机酸及其衍生物 - 羧酸及其衍生物
• 英文名称: ethyl β-(1-methyl-4-nitropyrrole-2-carboxamido)alaninate
• 英文别名: ethyl 3-(1-methyl-4-nitro-1H-pyrrol-2-carboxamido)propanoate；ethyl 3-(1-methyl-4-nitro-1H-pyrrole-2-carboxamido)propanoate；Ethyl 3-[(1-methyl-4-nitropyrrole-2-carbonyl)amino]propanoate
• CAS: 152916-77-3
• 化学式: C₁₁H₁₅N₃O₅
• mdl: MFCD16528348
• 分子量: 269.257
• InChiKey: MCRLECQGTNLCHT-UHFFFAOYSA-N

物化性质

• 熔点：
  120-124 °C
• 沸点：
  469.4±40.0 °C(Predicted)
• 密度：
  1.33±0.1 g/cm3(Temp: 20 °C; Press: 760 Torr)(Predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  0.3
• 重原子数：
  19
• 可旋转键数：
  6
• 环数：
  1.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.454
• 拓扑面积：
  106
• 氢给体数：
  1
• 氢受体数：
  5

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  ethyl β-(1-methyl-4-nitropyrrole-2-carboxamido)alaninate 在 palladium on activated charcoal sodium hydroxide 、 氢气 、 1-羟基苯并三唑 、 N,N'-二环己基碳二亚胺 作用下， 以 乙醇 、 氯仿 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 82.0h， 生成 N-(2-carboxyethyl)-4-[[4-[3-[hydroxy-[1-methyl-4-[(1-methyl-4-nitropyrrole-2-carbonyl)amino]pyrrol-2-yl]methylidene]azaniumylpropanoylamino]-1-methylpyrrole-2-carbonyl]amino]-1-methylpyrrole-2-carboximidate
  参考文献：
  名称：

  Synthesis and Cellular Effect of a Novel Conjugate of Polyamide and Phospholipid

  摘要：

  为了改善聚酰胺对细胞的穿透性及其向核 DNA 的移动，我们合成了一种聚酰胺与磷脂的共轭物，与原生聚酰胺相比，该共轭物的细胞毒性明显降低，并能有效抑制细胞凋亡。

  DOI：

  10.1248/cpb.54.832
• 作为产物：
  描述：

  beta-丙氨酸乙酯盐酸盐 、 1-甲基-4-硝基-2-(三氟乙酰)-1H-吡咯 在 TEA 作用下， 以 乙酸乙酯 为溶剂， 反应 5.0h， 以93%的产率得到ethyl β-(1-methyl-4-nitropyrrole-2-carboxamido)alaninate
  参考文献：
  名称：

  Synthesis and Cellular Effect of a Novel Conjugate of Polyamide and Phospholipid

  摘要：

  为了改善聚酰胺对细胞的穿透性及其向核 DNA 的移动，我们合成了一种聚酰胺与磷脂的共轭物，与原生聚酰胺相比，该共轭物的细胞毒性明显降低，并能有效抑制细胞凋亡。

  DOI：

  10.1248/cpb.54.832

文献信息

• Glycoconjugated Site-Selective DNA-Methylating Agent Targeting Glucose Transporters on Glioma Cells
  作者：Mairin K. Buchanan、Chase N. Needham、Nina E. Neill、Maria C. White、Charles B. Kelly、Kelly Mastro-Kishton、Lacie M. Chauvigne-Hines、Tyler J. Goodwin、Andrew L. McIver、Libero J. Bartolotti、Arthur R. Frampton、Andrea J. Bourdelais、Sridhar Varadarajan

  DOI：10.1021/acs.biochem.6b01075

  日期：2017.1.17

  selective uptake via glucose transporters, which are overexpressed in most cancers. The design features of the molecule, its synthesis, its reactivity with DNA, and its toxicity in human glioblastoma cells are reported here. In this molecule, a glucosamine unit, which can facilitate uptake via glucose transporters, is conjugated to one end of a bispyrrole triamide unit, which is known to bind to the

  脱氧核糖核酸烷基化药物继续仍然是抵抗癌症的武器库中的重要武器。然而，由于它们引起的不加区别的DNA损伤以及它们不能特异性地靶向癌细胞，它们通常遭受若干缺点。我们已经开发出一种策略，通过设计一种可以靶向癌细胞的位点特异性DNA甲基化剂来克服当前DNA烷基化化疗药物的不足，因为它可以通过葡萄糖转运蛋白选择性地摄取，而葡萄糖转运蛋白在大多数癌症中都是过表达的。本文报道了该分子的设计特征，其合成，与DNA的反应性及其在人胶质母细胞瘤细胞中的毒性。在该分子中，可通过葡萄糖转运蛋白促进摄取的葡萄糖胺单元与双吡咯三酰胺单元的一端偶联，已知它会在富含A / T的区域与DNA的小沟结合。磺酸甲酯部分被束缚在双吡咯单元的另一端，以用作DNA甲基化剂。该分子与DNA反应后仅产生N3-甲基腺嘌呤加合物，并且对抗治疗的人成胶质细胞瘤细胞的毒性要比食品和药物管理局批准的糖化DNA甲基化药物链霉菌素高。使用我们分子的荧
• Systematical Synthesis of Distamycin Analogues and Their Interaction with Herring Sperm DNA
  作者：Feili Tang、Jin Wang、Dan Liu、Jingjian Li、Gu Yuan

  DOI：10.1002/jccs.200200155

  日期：2002.12

  A simple procedure for the systematical synthesis of eight distamycin analogues containing N-methyl-pyrrole (Py) and N-methylimidazole (Im) has been developed by a chloroform reaction and DCC coupling reaction without amino protection and deprotection, and the interaction of the analogues with Herring Sperm DNA was investigated by fluorescence spectroscopy.

  已通过氯仿反应和 DCC 偶联反应开发了一种系统合成八种含有 N-甲基-吡咯 (Py) 和 N-甲基咪唑 (Im) 的远霉素类似物的简单程序，无需氨基保护和脱保护，以及类似物的相互作用通过荧光光谱研究了鲱鱼精子 DNA。
• A Convenient Method for the Synthesis of DNA-Recognizing Polyamides in Solution
  作者：Junhua Xiao、Gu Yuan、Weiqiang Huang、Albert S. C. Chan、K.-L. Daniel Lee

  DOI：10.1021/jo000135n

  日期：2000.9.1

  A convenient method for the synthesis of polyamides containing N-methylpyrrole (Py) and N-methylimidazole (Im) in solution has been developed. Most of the building blocks have been prepared by a haloform reaction in a simple way that column chromatography can be avoided. By use of the DCC/HOBT coupling reaction, the building blocks prepared have been effectively connected to construct a variety of subchains and polyamides without employing amino protection and deprotection. By use of the present method, an eight-ring polyamide, PyPyPyPy gamma PyImImPy beta Dp (gamma is gamma-aminobutyric acid, beta is beta-alanine, Dp is N,N-dimethylpropyldiamine), has been synthesized by the coupling of two four-ring subchains in one step.
• Mechanistic Investigation of Site-specific DNA Methylating Agents Targeting Breast Cancer Cells
  作者：Leah L. Lowder、Matthew Powell、Sean E. Miller、Rigel J. Kishton、Charles B. Kelly、Connor B. Cribb、Kelly Mastro-Kishton、Manoj Chelvanambi、Phat T. Do、Rajeshwar Reddy Govindapur、Suzanne E. Wardell、Donald P. McDonnell、Libero J. Bartolotti、Giridhar R. Akkaraju、Arthur R. Frampton、Sridhar Varadarajan

  DOI：10.1021/acs.jmedchem.1c00615

  日期：2021.9.9

  the essential role of ERα in modulating the toxicity. Minor alterations in the compound structure significantly affects the DNA binding ability, which correlates to the DNA-methylating ability. These studies demonstrate the utility of DNA-alkylating compounds to accomplish targeted inhibition of the growth of specific cancer cells; an approach that may overcome shortcomings of currently used chemotherapy

  我们之前描述了一种 DNA 烷基化化合物的开发，该化合物在乳腺癌细胞中显示出选择性毒性。该化合物含有雌激素受体 α (ERα) 结合配体和 DNA 结合/甲基化成分，可选择性甲基化 DNA 腺嘌呤-胸腺嘧啶丰富区域的腺嘌呤 N3 位。在此，我们描述了机制研究，证明此类化合物促进 ERα-化合物复合物向细胞核的易位并诱导 ERα 靶基因的表达。我们证实这些化合物在表达 ERα 的细胞中显示出选择性毒性，诱导 ERα 在细胞核中的定位，并验证了 ERα 在调节毒性中的重要作用。化合物结构的微小改变会显着影响 DNA 结合能力，这与 DNA 甲基化能力有关。这些研究证明了 DNA 烷基化化合物可用于实现对特定癌细胞生长的靶向抑制；一种可以克服目前使用的化疗药物缺点的方法。
• Synthesis and Cellular Effect of a Novel Conjugate of Polyamide and Phospholipid
  作者：Yi Liu、Yulin Deng、Rong Zheng、Peilong Zhang、Hui Zhai、Changjin Zhu

  DOI：10.1248/cpb.54.832

  日期：——

  In order to improve the cell penetration of polyamide and its movement toward nucleic DNA we synthesized a conjugate of polyamide and phospholipid, which showed a significantly reducecd cytotoxicity and effective apoptosis when comparing with the native polyamide.

  为了改善聚酰胺对细胞的穿透性及其向核 DNA 的移动，我们合成了一种聚酰胺与磷脂的共轭物，与原生聚酰胺相比，该共轭物的细胞毒性明显降低，并能有效抑制细胞凋亡。