New Base Pairing Motifs. The Synthesis and Thermal Stability of Oligodeoxynucleotides Containing Imidazopyridopyrimidine Nucleosides with the Ability to Form Four Hydrogen Bonds
作者:Noriaki Minakawa、Naoshi Kojima、Sadao Hikishima、Takashi Sasaki、Arihiro Kiyosue、Naoko Atsumi、Yoshihito Ueno、Akira Matsuda
DOI:10.1021/ja0347686
日期:2003.8.1
The synthesis and thermal stability of oligodeoxynucleotides (ODNs) containing imidazo[5',4':4,5]pyrido[2,3-d]pyrimidine nucleosides 1-4 (N(N), O(O), N(O), and O(N), respectively) with the aim of developing two sets of new base pairing motifs consisting of four hydrogen bonds (H-bonds) is described. The proposed four tricyclic nucleosides 1-4 were synthesized through the Stille coupling reaction of
含有咪唑并[5',4':4,5]吡啶并[2,3-d]嘧啶核苷1-4 (N(N), O(O), N(O)的寡聚脱氧核苷酸 (ODN) 的合成和热稳定性) 和 O(N)),目的是开发两组由四个氢键(H 键)组成的新碱基配对基序。提出的四种三环核苷 1-4 是通过 5-碘咪唑核苷与合适的 5-甲锡烷基嘧啶衍生物的 Stille 偶联反应合成的,然后进行分子内环化。这些核苷被纳入 ODN 以研究 H 键合能力。当一个分子的三环核苷结合到每个 ODN(ODN I 和 II,每个 17mer)的中心时,没有观察到明显的碱基配对特异性,并且所有双链体都比含有天然 G:C 和 A:T 对的双链体更不稳定。另一方面,当三个三环核苷分子连续掺入每个 ODN(ODN III 和 IV,每个 17 聚体)的中心时,由于特定的碱基配对,观察到双链体的热和热力学稳定性。含有 N(O):O(N) 对的双链体的熔解温度 (T(m))