生物素-PEG3-羧酸 | 252881-76-8

• 物质功能分类: 有机原料 - 羧酸类化合物及衍生物
• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 生物素及其衍生物
• 中文名称: 生物素-PEG3-羧酸
• 英文名称: 14-oxo-18-((3aS,4S,6aR)-2-oxohexahydro-1H-thieno[3,4-d]imidazol-4-yl)-4,7,10-trioxa-13-azaoctadecanoic acid
• 英文别名: biotin-PEG3-acid；Biotin-PEG3-COOH；3-[2-[2-[2-[5-[(3aS,4S,6aR)-2-oxo-1,3,3a,4,6,6a-hexahydrothieno[3,4-d]imidazol-4-yl]pentanoylamino]ethoxy]ethoxy]ethoxy]propanoic acid；Biotin-PEG3-acid
• CAS: 252881-76-8
• 化学式: C₁₉H₃₃N₃O₇S
• 分子量: 447.553
• InChiKey: HRGPPBXEZFBGDJ-MPGHIAIKSA-N

物化性质

• 沸点：
  770.7±60.0 °C(Predicted)
• 密度：
  1?+-.0.06 g/cm3(Predicted)
• 溶解度：
  溶于水、DMSO、DMF

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -0.9
• 重原子数：
  30
• 可旋转键数：
  17
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.84
• 拓扑面积：
  161
• 氢给体数：
  4
• 氢受体数：
  8

安全信息

• 危险性防范说明：
  P261,P264,P270,P271,P280,P302+P352,P304+P340,P305+P351+P338,P312,P330,P362,P403+P233,P501
• 危险性描述：
  H302,H315,H319,H335
• 储存条件：
  2-8°C

制备方法与用途

Biotin-PEG3-acid 是一种生物素标记的PROTAC连接子，属于PEG类化合物，可用来合成PROTAC分子。

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  生物素-PEG3-羧酸 在 盐酸-N-乙基-Nˊ-(3-二甲氨基丙基)碳二亚胺 、 三乙胺 、 三氟乙酸 作用下， 以 二氯甲烷 为溶剂， 反应 3.0h， 生成 C₂₁H₃₈N₄O₇S
  参考文献：
  名称：

  Intracellular Formation of a DNA Damage-Induced, Histone Post-Translational Modification Following Bleomycin Treatment

  摘要：

  DOI：

  10.1021/jacs.2c02880
• 作为产物：
  描述：

  (+)生物素-N-琥珀酰亚胺基酯 在 三氟乙酸 作用下， 以 二氯甲烷 为溶剂， 生成 生物素-PEG3-羧酸
  参考文献：
  名称：

  [EN] SYNTHESIS OF NOVEL ASYMMETRIC BOW-TIE PAMAM DENDRIMER-BASED CONJUGATES FOR TUMOR-TARGETING DRUG DELIVERY
  [FR] SYNTHÈSE DE NOUVEAUX CONJUGUÉS ASYMÉTRIQUES À BASE D'UN DENDRIMÈRE PAMAM EN NŒUD PAPILLON POUR ADMINISTRATION DE MÉDICAMENTS CIBLÉE VERS UNE TUMEUR

  摘要：

  本公开涉及一种公式为Vm-D-C-D'-(T-F)n的基于树状聚合物的结合物，该结合物对于肿瘤靶向药物传递很有用。不对称树状聚合物的使用可以实现特定的靶向以及合成的可重复性。

  公开号：

  WO2015038493A1

文献信息

• Target Identification of Yaku’amide B and Its Two Distinct Activities against Mitochondrial F_oF₁-ATP Synthase
  作者：Kai Kitamura、Hiroaki Itoh、Kaori Sakurai、Shingo Dan、Masayuki Inoue

  DOI：10.1021/jacs.8b07339

  日期：2018.9.26

  four β,β-dialkylated α,β-unsaturated amino acid residues. Growth-inhibitory profile of 1b against a panel of 39 human cancer cell lines is distinct from those of clinically used anticancer drugs, suggesting a novel mechanism of action. We achieved total syntheses of chemical probes based on 1b and elucidated the cellular target and mode of action of 1b. Fluorescent (3, 4) and biotinylated (5, 6) derivatives

  Yaku'amide B (1b) 是一种结构独特的十四肽，带有四个 β,β-二烷基化 α,β-不饱和氨基酸残基。1b 对一组 39 种人类癌细胞系的生长抑制特征与临床使用的抗癌药物不同，表明了一种新的作用机制。我们实现了基于 1b 的化学探针的全合成，并阐明了 1b 的细胞靶点和作用方式。分别制备了 1b 的荧光 (3, 4) 和生物素化 (5, 6) 衍生物用于细胞成像研究和下拉分析。此外，合成了1b的非天然对映体（ent-1b）及其荧光探针（ent-3）用于对照实验。使用 3 和 4 进行的亚细胞定位分析表明，1b 选择性地积聚在 MCF-7 人乳腺癌细胞的线粒体中。6 的下拉分析显示 FoF1-ATP 合酶是 1b 的主要靶蛋白。与这些发现一致，生化活性测定表明 1b 抑制由线粒体 FoF1-ATP 合酶催化的 ATP 产生。值得注意的是，还发现 1b 能够增强 FoF1-ATP 合酶的
• BIOTIN STANNANE FOR HPLC-FREE RADIOIODINATION
  申请人：Carter Randall Lee

  公开号：US20130261311A1

  公开（公告）日：2013-10-03

  The present teachings provide methods that enable the preparation and purification of radioiodinated vectors without the need for HPLC purification, as well as novel precursors which include biotin-like substituents useful in such methods.

  本教学提供了一种方法，可以在无需HPLC纯化的情况下实现放射碘化向量的制备和纯化，同时还包括一些新颖的前体，其中包括类生物素取代基，这些前体在这些方法中非常有用。
• INHIBITORS OF RNA-GUIDED NUCLEASE TARGET BINDING AND USES THEREOF
  申请人：THE BROAD INSTITUTE, INC.

  公开号：US20210177832A1

  公开（公告）日：2021-06-17

  Compositions and methods for inhibiting the activity of RNA-guided endonucleases, and methods for identifying such compositions are included. Methods of treatment using the inhibitory compounds, formulations and methods are also detailed, as well as control of nucleic acid editing systems and methods using said compounds.

  本发明涉及抑制RNA引导内切酶活性的组合物和方法，以及识别此类组合物的方法。本发明还详细描述了使用抑制剂化合物的治疗方法、制剂和方法，以及使用该化合物控制核酸编辑系统和方法。
• [EN] USE OF COMPOSITIONS MODULATING CHROMATIN STRUCTURE FOR GRAFT VERSUS HOST DISEASE (GVHD)<br/>[FR] UTILISATION DE COMPOSITIONS MODULANT LA STRUCTURE DE LA CHROMATINE CONTRE LA MALADIE DU GREFFON CONTRE L'HÔTE (GVHD)
  申请人：DANA FARBER CANCER INST INC

  公开号：WO2016073903A1

  公开（公告）日：2016-05-12

  In some aspects, the instant disclosure relates to methods of treating chronic graft versus host disease (cGVHD). In some embodiments, the method comprises administering to a subject in need thereof a EZH2 inhibitor, a Bcl6 inhibitor and/or BRD4 inhibitor. The present disclosure is based, at least in part, on the discovery that enhancer of zeste homolog 2 (EZH2) inhibitors, B-cell lymphoma 6 protein (Bcl6) inhibitors and/or bromodomain-containing protein 4 (BRD4) inhibitors can be used to treat chronic graft versus host disease (cGVHD).

  在某些方面，瞬时披露涉及治疗慢性移植物抗宿主病（cGVHD）的方法。在某些实施例中，该方法包括向需要该方法的受试者施用EZH2抑制剂、Bcl6抑制剂和/或BRD4抑制剂。本公开至少部分地基于发现，增强子of zeste同源物2（EZH2）抑制剂、B细胞淋巴瘤6蛋白（Bcl6）抑制剂和/或含有bromodomain的蛋白4（BRD4）抑制剂可用于治疗慢性移植物抗宿主病（cGVHD）。
• Proteomics‐Based Discovery of First‐in‐Class Chemical Probes for Programmed Cell Death Protein 2 (PDCD2)
  作者：Wenzhi Ji、Woong Sub Byun、Wenchao Lu、Xijun Zhu、Katherine A. Donovan、Brendan G. Dwyer、Jianwei Che、Linjie Yuan、Xianmixinuer Abulaiti、Steven M. Corsello、Eric S. Fischer、Tinghu Zhang、Nathanael S. Gray

  DOI：10.1002/anie.202308292

  日期：2023.10.23

  protein 2 (PDCD2) degrader, 10 e, was developed by combination of mass spectrometry-based proteomics with a concise structure-degradation relationship campaign. Our work provides valuable tool compounds for PDCD2 to the scientific community and highlights that combination of proteomics technology with chemical optimization can be a powerful approach and a useful supplement for chemical probes discovery

  通过将基于质谱的蛋白质组学与简洁的结构-降解关系活动相结合，开发了一流的程序性细胞死亡蛋白 2 （PDCD2） 降解剂 10 e。我们的工作为科学界提供了有价值的 PDCD2 工具化合物，并强调蛋白质组学技术与化学优化的结合可以成为化学探针发现的有力方法和有益补充。