生物素-PEG2-C6-叠氮 | 1011268-29-3

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 生物素及其衍生物
• 中文名称: 生物素-PEG2-C6-叠氮
• 英文名称: Biotin-PEG2-C6-Azide
• 英文别名: N-[2-[2-[2-[5-[(3aS,4S,6aR)-2-oxo-1,3,3a,4,6,6a-hexahydrothieno[3,4-d]imidazol-4-yl]pentanoylamino]ethoxy]ethoxy]ethyl]-6-azidohexanamide
• CAS: 1011268-29-3
• 化学式: C₂₂H₃₉N₇O₅S
• 分子量: 513.662
• InChiKey: NYAZUAAGKILBHO-WFXMLNOXSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  1
• 重原子数：
  35
• 可旋转键数：
  20
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.86
• 拓扑面积：
  157
• 氢给体数：
  4
• 氢受体数：
  8

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  4-hydroxy Nonenal Alkyne 、 生物素-PEG2-C6-叠氮 、 Ser-Leu-Arg-Arg-Ser-Ser-Cys-Phe-Gly-Gly-Arg 在 sodium tetrahydroborate 、 copper(II) sulfate 、 sodium ascorbate 、 三[(1-苄基-1H-1,2,3-三唑-4-基)甲基]胺 作用下， 以 phosphate buffer 、 二甲基亚砜 、 乙腈 为溶剂， 反应 2.0h， 生成
  参考文献：
  名称：

  使用点击化学鉴定 4-羟基壬烯醛的蛋白质靶标，用于叠氮基和炔基衍生物的离体生物素化。

  摘要：

  多不饱和脂肪酸 (PUFA) 是氧化应激过程中自由基损伤的主要目标。可扩散的亲电 α、β-不饱和醛，例如 4-羟基壬烯醛 (HNE)，已被证明可以修饰介导细胞信号传导的蛋白质（例如 IKK 和 Keap1），并改变负责诱导抗氧化基因、热休克蛋白、和 DNA 损伤反应。为了充分了解细胞对 HNE 的反应，重要的是要以公正的方式确定其蛋白质靶标。这需要一种检测和分离 HNE 修饰蛋白的策略，而不管 HNE 与其靶标之间的化学键的性质如何。合成了 HNE 的叠氮基或炔基衍生物，并证明它们在诱导血红素加氧酶诱导和诱导结肠癌 (RKO) 细胞凋亡的能力方面与 HNE 相同。暴露于标记的 HNE 衍生物的细胞被裂解并暴露于试剂以实现 Staudinger 连接或铜催化的 Huisgen 1,3 偶极环加成反应（点击化学），以将 HNE 加成的蛋白质与生物素结合，用于随后的亲和纯化。两种策略都能有效地对标记的

  DOI：

  10.1021/tx700347w
• 作为产物：
  描述：

  6-azidohexanoyl chloride 、 N-生物素-3,6-二氧杂辛烷-1,8-二胺 在 三乙胺 作用下， 以 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 以1.4 g的产率得到生物素-PEG2-C6-叠氮
  参考文献：
  名称：

  使用点击化学鉴定 4-羟基壬烯醛的蛋白质靶标，用于叠氮基和炔基衍生物的离体生物素化。

  摘要：

  多不饱和脂肪酸 (PUFA) 是氧化应激过程中自由基损伤的主要目标。可扩散的亲电 α、β-不饱和醛，例如 4-羟基壬烯醛 (HNE)，已被证明可以修饰介导细胞信号传导的蛋白质（例如 IKK 和 Keap1），并改变负责诱导抗氧化基因、热休克蛋白、和 DNA 损伤反应。为了充分了解细胞对 HNE 的反应，重要的是要以公正的方式确定其蛋白质靶标。这需要一种检测和分离 HNE 修饰蛋白的策略，而不管 HNE 与其靶标之间的化学键的性质如何。合成了 HNE 的叠氮基或炔基衍生物，并证明它们在诱导血红素加氧酶诱导和诱导结肠癌 (RKO) 细胞凋亡的能力方面与 HNE 相同。暴露于标记的 HNE 衍生物的细胞被裂解并暴露于试剂以实现 Staudinger 连接或铜催化的 Huisgen 1,3 偶极环加成反应（点击化学），以将 HNE 加成的蛋白质与生物素结合，用于随后的亲和纯化。两种策略都能有效地对标记的

  DOI：

  10.1021/tx700347w

文献信息

• Identification of Protein Targets of 4-Hydroxynonenal Using Click Chemistry for ex Vivo Biotinylation of Azido and Alkynyl Derivatives
  作者：Andrew Vila、Keri A. Tallman、Aaron T. Jacobs、Daniel C. Liebler、Ned A. Porter、Lawrence J. Marnett

  DOI：10.1021/tx700347w

  日期：2008.2.1

  exposed to the tagged HNE derivatives were lysed and exposed to reagents to effect Staudinger ligation or copper-catalyzed Huisgen 1,3 dipolar cycloaddition reaction (click chemistry) to conjugate HNE-adducted proteins with biotin for subsequent affinity purification. Both strategies yielded efficient biotinylation of tagged HNE-protein conjugates, but click chemistry was found to be superior for the recovery

  多不饱和脂肪酸 (PUFA) 是氧化应激过程中自由基损伤的主要目标。可扩散的亲电 α、β-不饱和醛，例如 4-羟基壬烯醛 (HNE)，已被证明可以修饰介导细胞信号传导的蛋白质（例如 IKK 和 Keap1），并改变负责诱导抗氧化基因、热休克蛋白、和 DNA 损伤反应。为了充分了解细胞对 HNE 的反应，重要的是要以公正的方式确定其蛋白质靶标。这需要一种检测和分离 HNE 修饰蛋白的策略，而不管 HNE 与其靶标之间的化学键的性质如何。合成了 HNE 的叠氮基或炔基衍生物，并证明它们在诱导血红素加氧酶诱导和诱导结肠癌 (RKO) 细胞凋亡的能力方面与 HNE 相同。暴露于标记的 HNE 衍生物的细胞被裂解并暴露于试剂以实现 Staudinger 连接或铜催化的 Huisgen 1,3 偶极环加成反应（点击化学），以将 HNE 加成的蛋白质与生物素结合，用于随后的亲和纯化。两种策略都能有效地对标记的