1-(2,5-dideoxy-β-D-glycero-pent-4-enofuranosyl)uracil | 58096-66-5

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 二嗪类
• 英文名称: 1-(2,5-dideoxy-β-D-glycero-pent-4-enofuranosyl)uracil
• 英文别名: 2'5'-dideoxyuridin-4'-ene；1-[(2R,4S)-4-Hydroxy-5-methylideneoxolan-2-yl]pyrimidine-2,4(1H,3H)-dione；1-[(2R,4S)-4-hydroxy-5-methylideneoxolan-2-yl]pyrimidine-2,4-dione
• CAS: 58096-66-5
• 化学式: C₉H₁₀N₂O₄
• 分子量: 210.189
• InChiKey: GWUGJFCGJLMLER-POYBYMJQSA-N

物化性质

• 密度：
  1.47±0.1 g/cm3(Predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -0.7
• 重原子数：
  15
• 可旋转键数：
  1
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.33
• 拓扑面积：
  78.9
• 氢给体数：
  2
• 氢受体数：
  4

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  1-(2,5-dideoxy-β-D-glycero-pent-4-enofuranosyl)uracil 在 吡啶 、 咪唑 、 氨 、 4-甲基苯磺酸吡啶 作用下， 以 1,4-二氧六环 、 二氯甲烷 、 乙腈 为溶剂， 反应 53.0h， 生成 dimethyl (3-O-tert-butyldimethylsilyl-1,2,5-trideoxy-1-cytosin-1-yl-α-L-threo-pentofuranos-4-yloxy)methylphosphonate
  参考文献：
  名称：

  亲电试剂促进羟甲基膦酸酯加成到4'，5'-didehydronucleosides：一种新的5'-核苷酸的等构类似物的方法

  摘要：

  亲电子促进的将二烷基羟甲基膦酸酯加到受保护的4'，5'-didehydronucleosides上，生成2'，5'-dideoxynucleosides的4'-di烷基膦酰基甲氧基衍生物的差向异构体混合物，这是2'-deoxynucleoside 5'-monophosphates的新类似物。在与4'，5'-二氢胸苷的加成反应中评估了几种类型的亲电试剂（甲苯磺酸吡啶鎓，NIS，NBS，MCPBA等）。从中发现，甲苯磺酸吡啶鎓在这些转化中具有实际用途。它的使用导致了一系列常见2'-脱氧核苷的4'-膦酰基甲氧基衍生物的制备。在生物学筛选中，这些游离膦酸没有发挥明显的细胞抑制或抗病毒活性。

  DOI：

  10.1016/j.tet.2007.03.059
• 作为产物：
  描述：

  2-脱氧尿苷 在 吡啶 、 碘 、 sodium methylate 、 三苯基膦 作用下， 以 1,4-二氧六环 、 甲醇 为溶剂， 反应 23.0h， 生成 1-(2,5-dideoxy-β-D-glycero-pent-4-enofuranosyl)uracil
  参考文献：
  名称：

  4'-叠氮基和4'-甲氧基核苷的合成及其抗HIV活性。

  摘要：

  合成了一系列核苷，其中4'-氢被叠氮基或甲氧基取代。合成4'-叠氮基类似物的关键步骤是将叠氮化碘立体和区域选择性加成到4'-不饱和核苷前体中，然后通过氧化辅助置换5'-碘基。4'-甲氧基核苷是通过4'-不饱和核苷的环氧化制得的，合适的环氧化物是用甲醇打开的。反应机理考虑，经验构象规则，基于NMR的构象计算和NOE实验表明4'-叠氮核苷偏爱呋喃糖部分的3'-内（N型）构象。当评估它们在A3.01细胞培养物中对HIV的抑制作用时，所有4'-azido-2' -脱氧-β-D-核苷表现出有效的活性。IC50的范围从4'-叠氮基2'-脱氧尿苷（6c）的0.80 microM到4'-叠氮基2'-脱氧鸟苷（6e）的0.003 microM。在该系列中，检测到的细胞毒性是IC50的50-1500倍。4'-甲氧基-2'-脱氧-β-D-核苷的活性比其叠氮基对应物低2-3个数量级，并且毒性更低。4'-取代的-2

  DOI：

  10.1021/jm00086a013

文献信息

• Antiviral agents
  申请人：SYNTEX (U.S.A.) INC.

  公开号：EP0371366A1

  公开（公告）日：1990-06-06

  Nucleoside compounds of the formula wherein: B is guanine, adenine, thymine, uracil, cytosine, hypoxanthine, xanthine, 5-methylcytosine, 4-ethoxy-5-methyl-2-oxo-pyrimidine, 4-isopropoxy-5-methyl-2-oxo-pyrimidine, or 5-methyl-2-oxo-pyrimidine; X isHorF; Y is H, OH, OCH3 or F; and Z is where n is zero, one, or three and both R are hydrogen or lower alkyl; or Y and Z together form a cyclic phosphate ester; and the pharmaceutically acceptable esters, ethers and salts thereof, have been found to have potent antiviral activity with a high therapeutic ratio.

  式中的核苷化合物 其中 B 是鸟嘌呤、腺嘌呤、胸腺嘧啶、尿嘧啶、胞嘧啶、次黄嘌呤、黄嘌呤、5-甲基胞嘧啶、4-乙氧基-5-甲基-2-氧代嘧啶、4-异丙氧基-5-甲基-2-氧代嘧啶或 5-甲基-2-氧代嘧啶； X 是 H 或 F； Y 是 H、OH、OCH3 或 F；以及 Z 是 其中 n 为 0、1 或 3，两个 R 均为氢或低级烷基；或 Y 和 Z 共同形成环磷酸酯；已发现这些药学上可接受的酯、醚和盐具有很强的抗病毒活性和很高的治疗比例。
• SUBSTITUTED NUCLEOSIDES, NUCLEOTIDES AND ANALOGS THEREOF
  申请人：Janssen BioPharma, Inc.

  公开号：EP3466959A1

  公开（公告）日：2019-04-10

  Disclosed herein are nucleosides, nucleotides and analogs thereof of fomula (III), pharmaceutical compositions that include one or more of nucleosides, nucleotides and analogs thereof, and methods of synthesizing the same. Also disclosed herein are compouns of formula (III) for use in methods of ameliorating and/or treating a disease and/or a condition, including an infection from a paramyxovirus and/or an orthomyxovirus, with a nucleoside, a nucleotide and an analog thereof.

  本文公开了式(III)的核苷、核苷酸及其类似物，包括一种或多种核苷、核苷酸及其类似物的药物组合物，以及合成方法。本文还公开了式(III)化合物，用于用核苷、核苷酸及其类似物改善和/或治疗疾病和/或病症，包括副粘病毒和/或正粘病毒感染的方法。
• [EN] MODIFIED NUCLEOSIDE, NUCLEOTIDE AND MODIFIED NUCLEIC ACID POLYMER, AND PREPARATION METHOD THEREFOR AND APPLICATION THEREOF<br/>[FR] NUCLÉOSIDE MODIFIÉ, NUCLÉOTIDE ET POLYMÈRE D'ACIDE NUCLÉIQUE MODIFIÉ, PROCÉDÉ DE PRÉPARATION CORRESPONDANT ET UTILISATION ASSOCIÉE<br/>[ZH] 修饰核苷、核苷酸和修饰核酸聚合物及其制备方法和应用
  申请人：ACAD OF MILITARY MEDICAL SCIENCES

  公开号：WO2021000380A1

  公开（公告）日：2021-01-07

  本公开涉及核酸药物技术领域，尤其是涉及一种修饰核苷、核苷酸和修饰核酸聚合物及其制备方法和应用。一种修饰核苷，选自具有以下结构的化合物或其盐：式（1）。本公开的修饰核苷，通过对核苷进行修饰，在4'位引入叠氮基、氨基或胺基等，得到一种新型的修饰核苷结构。可对该修饰核苷进行进一步修饰，得到核苷酸和修饰核酸聚合物，具有良好的核酶耐受性。
• US5449664A
  申请人：——

  公开号：US5449664A

  公开（公告）日：1995-09-12
• [EN] COMPOUNDS AND METHODS FOR TREATING DISEASE<br/>[FR] COMPOSÉS ET MÉTHODES POUR TRAITER UNE MALADIE
  申请人：[en]ROME THERAPEUTICS, INC.

  公开号：WO2023178133A1

  公开（公告）日：2023-09-21

  The invention provides compounds, compositions and methods for treating medical disorders, such as cancer, an autoimmune disorder, and/or a neurological disorder, and inhibiting LINE1 reverse transcriptase and/or HERV-K reverse transcriptase using a compound according to Formula I or a pharmaceutically acceptable salt thereof, or a related compound provided herein.