Ac-Asn(β-GlcNAc)-Asp-Ala-Tyr-Ser-OH | 1245517-46-7

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机酸及其衍生物 - 羧酸及其衍生物
• 英文名称: Ac-Asn(β-GlcNAc)-Asp-Ala-Tyr-Ser-OH
• 英文别名: (3S)-3-[[(2S)-2-acetamido-4-[[(2R,3R,4R,5S,6R)-3-acetamido-4,5-dihydroxy-6-(hydroxymethyl)oxan-2-yl]amino]-4-oxobutanoyl]amino]-4-[[(2S)-1-[[(2S)-1-[[(1S)-1-carboxy-2-hydroxyethyl]amino]-3-(4-hydroxyphenyl)-1-oxopropan-2-yl]amino]-1-oxopropan-2-yl]amino]-4-oxobutanoic acid
• CAS: 1245517-46-7
• 化学式: C₃₃H₄₇N₇O₁₇
• 分子量: 813.773
• InChiKey: KOUVBKFHTPBTBP-FKMNGZDOSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -5.4
• 重原子数：
  57
• 可旋转键数：
  20
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.55
• 拓扑面积：
  389
• 氢给体数：
  14
• 氢受体数：
  17

反应信息

• 作为产物：
  描述：

  2-乙酰氨基-1-氨基-1,2-二脱氧-beta-D-吡喃葡萄糖 、 、 Fmoc-Asp(OAll)-(Dmb)Asp(OtBu)-OH 、 溶剂黄146 、 Fmoc-L-天冬氨酸 4-烯丙酯 在 N-甲基吗啉 、 Methanaminium,N-[(dimethylamino)(3H-1,2,3-triazolo[4,5-b]pyridin-3-yloxy)methylene]-N-methyl-, hexafluorophosphate(1-) 、 哌啶 作用下， 以 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 以59%的产率得到Ac-Asn(β-GlcNAc)-Asp-Ala-Tyr-Ser-OH
  参考文献：
  名称：

  Synthesis of N-linked glycopeptides via solid-phase aspartylation

  摘要：

  描述了一种高效的制备N-连接糖肽的策略。该方法依赖于在天冬氨酸残基上使用侧链保护基团，具体为丙烯基和Dmab酯，这些保护基团与Fmoc策略固相合成中使用的保护基团是正交的。在肽组装后，这些保护基团被选择性去除，并将得到的自由侧链与糖苷胺衍生化，以获得带有天然N-连接的树脂结合糖肽。最初，N-连接糖肽根据该策略成功合成，然而，产率因位于假定糖基化位点相邻（C末端）的氨基酸残基的性质而有显著变化。这是由于生成了大量天冬酰亚胺副产物。通过在靠近丙烯基或Dmab保护的天冬氨酸残基的残基上引入2,4-二甲氧基苄基（Dmb）主链酰胺保护基团，可以克服天冬酰亚胺的形成。在固相天冬酰化反应后，N-连接糖肽的产量极为优秀。利用丙烯基和Dmab酯固相方法的实用性和正交性，制备了带有两种不同碳水化合物基团的N-连接糖肽。这 exemplified了固相方法在制备带有各种N-连接糖组合的糖肽方面的高效性。

  DOI：

  10.1039/c003673k

文献信息

• Synthesis of N-linked glycopeptides via solid-phase aspartylation
  作者：Trent Conroy、Katrina A. Jolliffe、Richard J. Payne

  DOI：10.1039/c003673k

  日期：——

  An efficient strategy for the preparation of N-linked glycopeptides is described. The method relies on the use of side chain protecting groups on aspartic acid residues, namely the allyl and Dmab esters, which are orthogonal to those utilised in Fmoc-strategy SPPS. After peptide assembly these protecting groups were selectively removed and the resulting free side chains derivatised with a glycosylamine to afford a resin bound glycopeptide bearing a native N-linkage. Initially, N-linked glycopeptides were successfully synthesised according to this strategy, however, yields varied substantially depending on the nature of the amino acid residue situated adjacent (C-terminal) to the putative glycosylation site. This was due to generation of substantial quantities of aspartimide by-products. Aspartimide formation was overcome by incorporation of a 2,4-dimethoxybenzyl (Dmb) backbone amide protecting group on the residue adjacent to an allyl- or Dmab-protected aspartic acid residue. N-linked glycopeptides were prepared in excellent yield after the solid-phase aspartylation reactions. The utility and orthogonality of the allyl and Dmab ester solid-phase approaches were exploited in the preparation of an N-linked glycodecapeptide bearing two different carbohydrate moieties. This exemplified the efficiency of the solid-phase methodology for the preparation of glycopeptides bearing various combinations of N-linked glycans.

  描述了一种高效的制备N-连接糖肽的策略。该方法依赖于在天冬氨酸残基上使用侧链保护基团，具体为丙烯基和Dmab酯，这些保护基团与Fmoc策略固相合成中使用的保护基团是正交的。在肽组装后，这些保护基团被选择性去除，并将得到的自由侧链与糖苷胺衍生化，以获得带有天然N-连接的树脂结合糖肽。最初，N-连接糖肽根据该策略成功合成，然而，产率因位于假定糖基化位点相邻（C末端）的氨基酸残基的性质而有显著变化。这是由于生成了大量天冬酰亚胺副产物。通过在靠近丙烯基或Dmab保护的天冬氨酸残基的残基上引入2,4-二甲氧基苄基（Dmb）主链酰胺保护基团，可以克服天冬酰亚胺的形成。在固相天冬酰化反应后，N-连接糖肽的产量极为优秀。利用丙烯基和Dmab酯固相方法的实用性和正交性，制备了带有两种不同碳水化合物基团的N-连接糖肽。这 exemplified了固相方法在制备带有各种N-连接糖组合的糖肽方面的高效性。