Z-Gly-Gly-Leu-Aib-OtBu | 1359857-15-0

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机酸及其衍生物 - 羧酸及其衍生物
• 英文名称: Z-Gly-Gly-Leu-Aib-OtBu
• 英文别名: Cbz-Gly-Gly-Leu-Aib-OtBu；tert-butyl 2-methyl-2-[[(2S)-4-methyl-2-[[2-[[2-(phenylmethoxycarbonylamino)acetyl]amino]acetyl]amino]pentanoyl]amino]propanoate
• CAS: 1359857-15-0
• 化学式: C₂₆H₄₀N₄O₇
• 分子量: 520.626
• InChiKey: BEBRRMCSBKMWHW-IBGZPJMESA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  2.7
• 重原子数：
  37
• 可旋转键数：
  15
• 环数：
  1.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.58
• 拓扑面积：
  152
• 氢给体数：
  4
• 氢受体数：
  7

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  Z-Gly-Gly-Leu-Aib-OtBu 在 N-甲基吗啉 、 N-羟基-7-氮杂苯并三氮唑 、 盐酸-N-乙基-Nˊ-(3-二甲氨基丙基)碳二亚胺 、 三氟乙酸 作用下， 以 二氯甲烷 为溶剂， 生成 Z-Gly-Gly-Leu-Aib-Gly-Ile-Leu-OMe
  参考文献：
  名称：

  Trichogin GA IV: A versatile template for the synthesis of novel peptaibiotics

  摘要：

  从真菌长链毛霉中分离出来的 Trichogin GA IV 是具有膜修饰特性的短链肽亚类--脂链肽的原型。这种蛋白胨主要折叠成 310-/α- 混合螺旋构象，具有明显的两亲性，尽管这种两亲性并不强，但这很可能是它能够扰乱细菌膜并诱导细胞死亡的原因。在以前的论文中，我们曾报道过 trichogin GA IV 有趣的生物特性，即它对革兰氏阳性细菌（尤其是耐甲氧西林金黄色葡萄球菌菌株）的良好活性、对蛋白水解降解的稳定性以及较低的溶血活性。为了通过增加肽的螺旋两亲性来拓宽其抗菌活性谱，我们在这项工作中采用溶液法和固相法合成、纯化并充分表征了一组三叶草苷 GA IV 类似物、5、6、9 位的四个 Gly 残基被一个（2、5、6 或 9 位）、两个（5 和 6 位）、三个（2、5 和 9 位）和四个（2、5、6 和 9 位）Lys 残基取代。在水性、有机和膜模拟环境中，通过傅立叶变换红外吸收、CD 和二维核磁共振技术评估了含 Lys 类似物的构象偏好。有趣的是，事实证明，带电残基的存在会诱导七叶皂苷的螺旋构象（从 310 螺旋到 α 螺旋）随 pH 值的变化而发生转变，这是一个可逆的过程。通过在模型膜中的荧光泄漏实验、蛋白酶抗性、抗菌和抗真菌活性、细胞毒性和溶血作用，进一步检验了类似物显著增加的两亲性所发挥的作用。总之，我们的生物学结果证明，这些类似物中一些取代度最低的是开发新型膜活性抗菌剂的良好候选物。

  DOI：

  10.1039/c1ob06178j
• 作为产物：
  描述：

  H-AIB-OT BU.盐酸盐 在 N-甲基吗啉 、 N-羟基-7-氮杂苯并三氮唑 、 palladium 10% on activated carbon 、 氢气 、 1-羟基苯并三唑 、 盐酸-N-乙基-Nˊ-(3-二甲氨基丙基)碳二亚胺 作用下， 以 甲醇 、 二氯甲烷 为溶剂， 生成 Z-Gly-Gly-Leu-Aib-OtBu
  参考文献：
  名称：

  Trichogin GA IV: A versatile template for the synthesis of novel peptaibiotics

  摘要：

  从真菌长链毛霉中分离出来的 Trichogin GA IV 是具有膜修饰特性的短链肽亚类--脂链肽的原型。这种蛋白胨主要折叠成 310-/α- 混合螺旋构象，具有明显的两亲性，尽管这种两亲性并不强，但这很可能是它能够扰乱细菌膜并诱导细胞死亡的原因。在以前的论文中，我们曾报道过 trichogin GA IV 有趣的生物特性，即它对革兰氏阳性细菌（尤其是耐甲氧西林金黄色葡萄球菌菌株）的良好活性、对蛋白水解降解的稳定性以及较低的溶血活性。为了通过增加肽的螺旋两亲性来拓宽其抗菌活性谱，我们在这项工作中采用溶液法和固相法合成、纯化并充分表征了一组三叶草苷 GA IV 类似物、5、6、9 位的四个 Gly 残基被一个（2、5、6 或 9 位）、两个（5 和 6 位）、三个（2、5 和 9 位）和四个（2、5、6 和 9 位）Lys 残基取代。在水性、有机和膜模拟环境中，通过傅立叶变换红外吸收、CD 和二维核磁共振技术评估了含 Lys 类似物的构象偏好。有趣的是，事实证明，带电残基的存在会诱导七叶皂苷的螺旋构象（从 310 螺旋到 α 螺旋）随 pH 值的变化而发生转变，这是一个可逆的过程。通过在模型膜中的荧光泄漏实验、蛋白酶抗性、抗菌和抗真菌活性、细胞毒性和溶血作用，进一步检验了类似物显著增加的两亲性所发挥的作用。总之，我们的生物学结果证明，这些类似物中一些取代度最低的是开发新型膜活性抗菌剂的良好候选物。

  DOI：

  10.1039/c1ob06178j

文献信息

• Partial thioamide scan on the lipopeptaibiotic trichogin GA IV. Effects on folding and bioactivity
  作者：Marta De Zotti、Barbara Biondi、Cristina Peggion、Matteo De Poli、Haleh Fathi、Simona Oancea、Claudio Toniolo、Fernando Formaggio

  DOI：10.3762/bjoc.8.129

  日期：——

  common chemical tool to control the conformation of linear peptides and to explore potentially useful effects on their biochemical and biophysical properties. The thioamide, psi[CS-NH], group is a nearly isosteric structural mimic of the amide (peptide) functionality. In this paper, we describe the solution synthesis, chemical characterization, preferred conformation, and membrane and biological activities

  骨架修饰是一种常用的化学工具，用于控制线性肽的构象，并探索对其生化和生物物理特性的潜在有用影响。硫代酰胺 psi[CS-NH] 基团是酰胺（肽）功能的近等排结构模拟物。在本文中，我们描述了三种精心挑选的脂肽生物 [Leu(11)-OMe] 毛虫素 GA IV 的肽类似物的溶液合成、化学表征、优选构象以及膜和生物活性。在每个类似物中，加入了一个单一的硫代酰胺置换。研究了靠近 N 端、中心和靠近 C 端的序列位置。
• Trichogin GA IV: A versatile template for the synthesis of novel peptaibiotics
  作者：Marta De Zotti、Barbara Biondi、Cristina Peggion、Fernando Formaggio、Yoonkyung Park、Kyung-Soo Hahm、Claudio Toniolo

  DOI：10.1039/c1ob06178j

  日期：——

  Trichogin GA IV, isolated from the fungus Trichoderma longibrachiatum, is the prototype of lipopeptaibols, the sub-class of short-length peptaibiotics exhibiting membrane-modifying properties. This peptaibol is predominantly folded in a mixed 310-/α- helical conformation with a clear, albeit modest, amphiphilic character, which is likely to be responsible for its capability to perturb bacterial membranes and to induce cell death. In previous papers, we reported on the interesting biological properties of trichogin GA IV, namely its good activity against Gram positive bacteria, in particular methicillin-resistant S. aureus strains, its stability towards proteolytic degradation, and its low hemolytic activity. Aiming at broadening the antimicrobial activity spectrum by increasing the peptide helical amphiphilicity, in this work we synthesized, by solution and solid-phase methodologies, purified and fully characterized a set of trichogin GA IV analogs in which the four Gly residues at positions 2, 5, 6, 9, lying in the poorly hydrophilic face of the helical structure, are substituted by one (position 2, 5, 6 or 9), two (positions 5 and 6), three (positions 2, 5, and 9), and four (positions 2, 5, 6, and 9) Lys residues. The conformational preferences of the Lys-containing analogs were assessed by FT-IR absorption, CD and 2D-NMR techniques in aqueous, organic, and membrane-mimetic environments. Interestingly, it turns out that the presence of charged residues induces a transition of the helical conformation adopted by the peptaibols (from 310- to α-helix) as a function of pH in a reversible process. The role played in the analogs by the markedly increased amphiphilicity was further tested by fluorescence leakage experiments in model membranes, protease resistance, antibacterial and antifungal activities, cytotoxicity, and hemolysis. Taken together, our biological results provide evidence that some of the least substituted among these analogs are good candidates for the development of new membrane-active antimicrobial agents.

  从真菌长链毛霉中分离出来的 Trichogin GA IV 是具有膜修饰特性的短链肽亚类--脂链肽的原型。这种蛋白胨主要折叠成 310-/α- 混合螺旋构象，具有明显的两亲性，尽管这种两亲性并不强，但这很可能是它能够扰乱细菌膜并诱导细胞死亡的原因。在以前的论文中，我们曾报道过 trichogin GA IV 有趣的生物特性，即它对革兰氏阳性细菌（尤其是耐甲氧西林金黄色葡萄球菌菌株）的良好活性、对蛋白水解降解的稳定性以及较低的溶血活性。为了通过增加肽的螺旋两亲性来拓宽其抗菌活性谱，我们在这项工作中采用溶液法和固相法合成、纯化并充分表征了一组三叶草苷 GA IV 类似物、5、6、9 位的四个 Gly 残基被一个（2、5、6 或 9 位）、两个（5 和 6 位）、三个（2、5 和 9 位）和四个（2、5、6 和 9 位）Lys 残基取代。在水性、有机和膜模拟环境中，通过傅立叶变换红外吸收、CD 和二维核磁共振技术评估了含 Lys 类似物的构象偏好。有趣的是，事实证明，带电残基的存在会诱导七叶皂苷的螺旋构象（从 310 螺旋到 α 螺旋）随 pH 值的变化而发生转变，这是一个可逆的过程。通过在模型膜中的荧光泄漏实验、蛋白酶抗性、抗菌和抗真菌活性、细胞毒性和溶血作用，进一步检验了类似物显著增加的两亲性所发挥的作用。总之，我们的生物学结果证明，这些类似物中一些取代度最低的是开发新型膜活性抗菌剂的良好候选物。