Identification of N,N-arylalkyl-picolinamide derivatives targeting the RNA-binding protein HuR, by combining biophysical fragment-screening and molecular hybridization
作者:S. Della Volpe、P. Linciano、R. Listro、E. Tumminelli、M. Amadio、I. Bonomo、W.A.M. Elgaher、S. Adam、A.K.H. Hirsch、F.M. Boeckler、F. Vasile、D. Rossi、S. Collina
DOI:10.1016/j.bioorg.2021.105305
日期:2021.11
synthesize focused analogues of compound N-(3-chlorobenzyl)-N-(3,5-dihydroxyphenethyl)-4-hydroxybenzamide (1), our previously reported hit. STD NMR spectroscopy, molecular modeling, and SPR offered further insight into the HuR-small molecule interaction and showed that fragment-based approaches represent a promising and yet underexplored strategy to tackle such unusual targets. Lastly, fluorescence polarization
Hu 蛋白是 RNA 结合蛋白 (RBP) 家族的成员,在转录后过程的调节中起关键作用。通过与选定的 mRNA 相互作用,RBP 调节其功能和稳定性;因此,RBP 失调会导致涉及多种病理的关键蛋白质的异常翻译。在过去几年中,这一观察引起了人们的兴趣,即通过使用能够调节 RBP 活性的小分子来开发针对这些病理的新疗法。在四种 Hu 蛋白中,我们已将我们的努力集中在 HuR 异构体上,它主要与癌症、炎症和视网膜病变有关。在目前的工作中,旨在开发能够调节 HuR-mRNA 复合物稳定性的化合物,我们通过表面等离子共振 (SPR) 和饱和转移差 (STD) NMR 评估富含卤素的杂环片段 (HEFLibs) 库来应用生物物理片段筛选,以选择能够与 HuR 相互作用的有希望的片段。一种选定的片段和一些市售的同类物被用来设计和合成化合物的聚焦类似物N- (3-氯苄基) -N- (3,5-二羟基苯乙基)-4-羟基苯甲酰胺(