[EN] FLUORESCENT NUCLEOSIDE ANALOGS THAT MIMIC NATURALLY OCCURRING NUCLEOSIDES<br/>[FR] ANALOGUES NUCLEOSIDIQUES FLUORESCENTS IMITANT DES NUCLEOSIDES NATURELS
申请人:UNIV CALIFORNIA
公开号:WO2006076102A2
公开(公告)日:2006-07-20
[EN] The present invention provides fluorescent nucleoside analogs with conjugated membered heterocycles, including furan and thiophene. The fluorescent nucleoside analogs maintain structural similarity to naturally occurring nucleoside bases, mimicking shape, size, hybridization, and recognition properties. Incorporation of the fluorescent cyclic compounds confers specific photophysical characteristics including a bathochromic (red) shift of the absorption spectrum to minimize absorption overlap with naturally occurring nucleoside bases, and a shift to the long emission wavelength in the visible range. The invention also provides for various methods of synthesizing the fluorescent nucleoside analogs and incorporating the fluorescent analogs in DNA, RNA, or oligomer synthesis. Further, methods of detecting the fluorescent nucleoside analogs in an oligonucleotide or oligomer are provided. The subject compounds are useful as probes in the study of the structure and dynamics of nucleic acids and their complexes with proteins.
[FR] La présente invention concerne ces analogues nucléosidiques fluorescents avec hétérocycles à 5 éléments conjugués, comprenant le furane et le thiophène. Lesdits analogues présentent une similitude avec des bases nucléosidiques naturelles, dont ils imitent la forme, la taille ainsi que les propriétés d'hybridation et de reconnaissance. L'incorporation des composés cycliques fluorescents confèrent des caractéristiques photophysiques spécifiques, dont un décalage bathochrome (vers le rouge) du spectre d'absorption qui réduit le chevauchement d'absorption avec les bases nucléosidiques naturelles, et un décalage de la longueur d'onde à émission longue dans la plage visible. L'invention concerne également diverses méthodes de synthèse des analogues nucléosidiques fluorescents et d'incorporation desdits analogues dans l'ADN, l'ARN ou la synthèse d'oligomères. Sont également décrites des méthodes de détection d'analogues nucléosidiques fluorescents dans un oligonucléotide ou un oligomère. Les composés de l'invention conviennent en tant que sondes dans l'étude de la structure et de la dynamique des acides nucléiques et des complexes qu'ils forment avec des protéines.