(3S)-3,7-bis({[(tert-butoxy)carbonyl]amino})heptanoic acid | 218608-88-9

• 分子结构分类: 有机化合物 - 脂质和类脂质分子 - 脂肪酰基
• 英文名称: (3S)-3,7-bis({[(tert-butoxy)carbonyl]amino})heptanoic acid
• 英文别名: (3S)-3,7-bis[(2-methylpropan-2-yl)oxycarbonylamino]heptanoic acid
• CAS: 218608-88-9
• 化学式: C₁₇H₃₂N₂O₆
• 分子量: 360.451
• InChiKey: PHOMBNRVJNRAAP-LBPRGKRZSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  2.3
• 重原子数：
  25
• 可旋转键数：
  12
• 环数：
  0.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.82
• 拓扑面积：
  114
• 氢给体数：
  3
• 氢受体数：
  6

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  t-butyl 2-(1-methylhydrazinyl)acetate p-toluenesulfonic acid salt 、 (3S)-3,7-bis({[(tert-butoxy)carbonyl]amino})heptanoic acid 在 1-羟基苯并三唑 、 盐酸-N-乙基-Nˊ-(3-二甲氨基丙基)碳二亚胺 、 三乙胺 作用下， 以 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 以42 mg的产率得到(S)-tert-butyl 2-{2-[3,7-bis(tert-butoxycarbonylamino)heptanoyl]-1-methylhydrazinyl}acetate
  参考文献：
  名称：

  Structure–Activity Relationship Studies of 3-epi-Deoxynegamycin Derivatives as Potent Readthrough Drug Candidates

  摘要：

  (+)奈加霉素(1)为一种带有肼结构的天然二肽类抗生素,对 dystrophin 基因的无义突变具有通读活性,并在杜兴氏肌肉营养不良症模型 md x 小鼠肌肉中恢复 dystrophin 的表达。为了开发更有效的通读化合物,我们对携带少量抗微生物活性的另一种天然通读化合物 3-表脱氧奈加霉素(2)进行了结构活性关系研究,侧重于主碳链长度的研究。我们发现比(1)和(2)少一个碳原子的衍生物 9b 拥有更高的通读活性。进一步对 9b 的羧酸部分进行衍化发现,它的邻氯苯甲酯衍生物17e 具有更高的 ClogP 值,17e 的通读活性比 9b 更强。有趣的是,在细胞自由蛋白表达系统中,17e 的通读活性相比于细胞基的测定有着大幅下降。这些结果表明,苯甲酯类衍生物提高了疏水性,并作为前药在活细胞体系中生成具有活性的化合物9b。

  DOI：

  10.1021/acsmedchemlett.5b00121
• 作为产物：
  描述：

  di-tert-butyl (6-hydroxyhexane-1,5-diyl)(S)-dicarbamate 在 18-冠醚-6 、 水 、 三乙胺 、 potassium hydroxide 作用下， 以 乙醇 、 二氯甲烷 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 2.0h， 生成 (3S)-3,7-bis({[(tert-butoxy)carbonyl]amino})heptanoic acid
  参考文献：
  名称：

  Structure–Activity Relationship Studies of 3-epi-Deoxynegamycin Derivatives as Potent Readthrough Drug Candidates

  摘要：

  (+)奈加霉素(1)为一种带有肼结构的天然二肽类抗生素,对 dystrophin 基因的无义突变具有通读活性,并在杜兴氏肌肉营养不良症模型 md x 小鼠肌肉中恢复 dystrophin 的表达。为了开发更有效的通读化合物,我们对携带少量抗微生物活性的另一种天然通读化合物 3-表脱氧奈加霉素(2)进行了结构活性关系研究,侧重于主碳链长度的研究。我们发现比(1)和(2)少一个碳原子的衍生物 9b 拥有更高的通读活性。进一步对 9b 的羧酸部分进行衍化发现,它的邻氯苯甲酯衍生物17e 具有更高的 ClogP 值,17e 的通读活性比 9b 更强。有趣的是,在细胞自由蛋白表达系统中,17e 的通读活性相比于细胞基的测定有着大幅下降。这些结果表明,苯甲酯类衍生物提高了疏水性,并作为前药在活细胞体系中生成具有活性的化合物9b。

  DOI：

  10.1021/acsmedchemlett.5b00121

文献信息

• Synthesis of Androprostamine A and Resormycin
  作者：Hikaru Abe、Yohko Yamazaki、Chiharu Sakashita、Isao Momose、Takumi Watanabe、Masakatsu Shibasaki

  DOI：10.1248/cpb.c16-00207

  日期：——

  Syntheses of androprostamine A (1), and resormycin (3), anti-prostate cancer peptidyl natural products produced by microorganisms, were completed. The characteristic enamide structures of these compounds were installed using the Horner-Wadsworth-Emmons reaction from the corresponding phosphonates in reasonable Z-selectivity.

  我们完成了由微生物产生的抗前列腺癌肽类天然产物安托前列腺素 A（1）和雷米霉素（3）的合成。利用 Horner-Wadsworth-Emmons 反应，以合理的 Z 选择性从相应的膦酸盐合成了这些化合物的特征烯酰胺结构。
• Structure–Activity Relationship Studies of 3-<i>epi</i>-Deoxynegamycin Derivatives as Potent Readthrough Drug Candidates
  作者：Keisuke Hamada、Akihiro Taguchi、Masaya Kotake、Suguru Aita、Saori Murakami、Kentaro Takayama、Fumika Yakushiji、Yoshio Hayashi

  DOI：10.1021/acsmedchemlett.5b00121

  日期：2015.6.11

  (+)-Negamycin (1), a natural dipeptidic antibiotic bearing a hydrazide structure, exhibits a readthrough activity toward the nonsense mutation of the dystrophin gene and restores dystrophin expression in muscles of Duchenne muscular dystrophy model mdx mice. Herein to develop more potent readthrough compounds, we performed a structure activity relationship (SAR) study of 3-epi-deoxynegamycin (2), which is also another natural readthrough compound with little antimicrobial activity, focusing on the main carbon chain length. We found that one carbon atom shorter derivative 9b shows a higher readthrough activity than 1 and 2. Further derivatization at the carboxylic acid part of 9b demonstrates that its meta-chlorobenzyl ester derivative 17e, which has a higher ClogP value, exhibits a more potent readthrough activity than 9b. Interestingly, in the cell-free protein expression system, the readthrough activity of 17e drastically decreases compared to that in the cell-based assay. These results suggest that benzyl ester-type derivatives enhance the hydrophobicity and function as prodrugs to produce active compound 9b in living cell systems.

  (+)奈加霉素(1)为一种带有肼结构的天然二肽类抗生素,对 dystrophin 基因的无义突变具有通读活性,并在杜兴氏肌肉营养不良症模型 md x 小鼠肌肉中恢复 dystrophin 的表达。为了开发更有效的通读化合物,我们对携带少量抗微生物活性的另一种天然通读化合物 3-表脱氧奈加霉素(2)进行了结构活性关系研究,侧重于主碳链长度的研究。我们发现比(1)和(2)少一个碳原子的衍生物 9b 拥有更高的通读活性。进一步对 9b 的羧酸部分进行衍化发现,它的邻氯苯甲酯衍生物17e 具有更高的 ClogP 值,17e 的通读活性比 9b 更强。有趣的是,在细胞自由蛋白表达系统中,17e 的通读活性相比于细胞基的测定有着大幅下降。这些结果表明,苯甲酯类衍生物提高了疏水性,并作为前药在活细胞体系中生成具有活性的化合物9b。