Exploring the chemical space of functionalized [1,2,4]triazolo[4,3-a]quinoxaline-based compounds targeting the bromodomain of BRD9
作者:Erica Gazzillo、Martina Pierri、Ester Colarusso、Maria Giovanna Chini、Maria Grazia Ferraro、Marialuisa Piccolo、Carlo Irace、Ines Bruno、Giuseppe Bifulco、Stefania Terracciano、Gianluigi Lauro
DOI:10.1016/j.bioorg.2023.106677
日期:2023.10
previously introduced by us, were here employed to evaluate a second generation of compounds, exploring different substitution patterns on the heterocyclic core. Starting from the promising data obtained from our previously identified [1,2,4]triazolo[4,3-a]quinoxaline-based compounds 1–4, the combination of in silico studies, chemical synthesis, biophysical and in vitro assays led to the identification
在这里,我们报告了一项与基于[1,2,4]三唑并[4,3- a ]喹喔啉的化合物相关的详细构效关系(SAR)研究,该化合物针对含溴结构域蛋白9(BRD9)的读取器模块。我们之前引入的基于 3D 结构的药效团模型在这里用于评估第二代化合物,探索杂环核心上的不同取代模式。从我们之前鉴定的[1,2,4]三唑并[4,3- a ]喹喔啉基化合物1 – 4获得的有希望的数据开始,计算机研究、化学合成、生物物理和体外测定的结合导致鉴定了一组新的衍生物,选择这些衍生物是为了彻底探索溴结构域结合位点的化学空间。更详细地说,对 C-4 位置不同接头的研究强调了胺间隔基对于与蛋白质对应物的结合是必需的,以及 C-1 处的烷基取代基对于增加对 BRD9 的选择性的关键作用。此外,从我们收集的结果分析中推断出氢键供体基团的重要性,氢键供体基团对于锚定 ZA 区域至关重要,并且是与 Ile53 残基相互作用所必需的。