BocN(CH2CONH-PyPyPy-CO2Me)CH2CO2H | 470464-10-9

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机酸及其衍生物 - 羧酸及其衍生物
• 英文名称: BocN(CH2CONH-PyPyPy-CO2Me)CH2CO2H
• CAS: 470464-10-9
• 化学式: C₂₈H₃₅N₇O₉
• 分子量: 613.627
• InChiKey: FXMJBCJKDNZDFR-UHFFFAOYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  2.25
• 重原子数：
  44.0
• 可旋转键数：
  10.0
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.36
• 拓扑面积：
  195.23
• 氢给体数：
  4.0
• 氢受体数：
  11.0

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  BocN(CH2CONH-PyPyPy-CO2Me)CH2CO2H 在 盐酸 、 4-二甲氨基吡啶 、 盐酸-N-乙基-Nˊ-(3-二甲氨基丙基)碳二亚胺 作用下， 以 乙酸乙酯 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 15.0h， 生成
  参考文献：
  名称：

  亚氨基二乙酸连接的聚酰胺的合成和 DNA 结合特性：合作扩展 2:1 并排平行结合的表征

  摘要：

  制备了一系列亚氨基二乙酸 (IDA) 连接的聚酰胺 (DpPyPyPy-IDA-PyPyPyDp)，并构成通过可官能化的五原子接头头对头连接的聚酰胺。发现 IDA 接头对不同于 β-丙氨酸（延伸）或 γ-氨基丁酸（发夹）接头的 DNA 结合构象产生独特的影响，导致在最有可能具有交错排列与堆叠排列的扩展构象。在一系列包含系统变化的富含 A/T 的结合位点大小的发夹脱氧寡核苷酸上进行的荧光嵌入剂置换 (FID) 测定的通用变体用于区分 IDA 连接的聚酰胺的结合模式。

  DOI：

  10.1021/ja026588m
• 作为产物：
  描述：

  methyl 4-<<<4-<<<4-<<(tert-butyloxy)carbonyl>amino>-1-methyl-pyrrol-2-yl>carbonyl>amino>-1-methyl-pyrrol-2-yl>carbonyl>amino>-1-methyl-pyrrole-2-carboxylate 在 盐酸 、 4-二甲氨基吡啶 、 盐酸-N-乙基-Nˊ-(3-二甲氨基丙基)碳二亚胺 作用下， 以 乙酸乙酯 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 6.5h， 生成 BocN(CH2CONH-PyPyPy-CO2Me)CH2CO2H
  参考文献：
  名称：

  亚氨基二乙酸连接的聚酰胺的合成和 DNA 结合特性：合作扩展 2:1 并排平行结合的表征

  摘要：

  制备了一系列亚氨基二乙酸 (IDA) 连接的聚酰胺 (DpPyPyPy-IDA-PyPyPyDp)，并构成通过可官能化的五原子接头头对头连接的聚酰胺。发现 IDA 接头对不同于 β-丙氨酸（延伸）或 γ-氨基丁酸（发夹）接头的 DNA 结合构象产生独特的影响，导致在最有可能具有交错排列与堆叠排列的扩展构象。在一系列包含系统变化的富含 A/T 的结合位点大小的发夹脱氧寡核苷酸上进行的荧光嵌入剂置换 (FID) 测定的通用变体用于区分 IDA 连接的聚酰胺的结合模式。

  DOI：

  10.1021/ja026588m