5-amino-1-(β-D-ribofuranosyl)imidazole-4-carboxaldehyde 5'-phosphate | 1133840-44-4

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机氧化合物
• 英文名称: 5-amino-1-(β-D-ribofuranosyl)imidazole-4-carboxaldehyde 5'-phosphate
• 英文别名: [(2R,3S,4R,5R)-5-(5-amino-4-formylimidazol-1-yl)-3,4-dihydroxyoxolan-2-yl]methyl dihydrogen phosphate
• CAS: 1133840-44-4
• 化学式: C₉H₁₄N₃O₈P
• 分子量: 323.199
• InChiKey: FKKKYMHYWVEGBL-JXOAFFINSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -3.2
• 重原子数：
  21
• 可旋转键数：
  5
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.56
• 拓扑面积：
  177
• 氢给体数：
  5
• 氢受体数：
  10

反应信息

• 作为产物：
  描述：

  5-amino-1-β-D-ribofuranosylimidazole-4-carboxaldehyde 在 磷酸三乙酯 、 三氯氧磷 作用下， 反应 4.0h， 以75%的产率得到5-amino-1-(β-D-ribofuranosyl)imidazole-4-carboxaldehyde 5'-phosphate
  参考文献：
  名称：

  探究 AIR 羧化酶紧密结合抑制剂的作用机制

  摘要：

  氨基咪唑核糖核苷酸 (AIR) 羧化酶催化嘌呤中间体 4-羧基-5-氨基咪唑核糖核苷酸 (CAIR) 的合成。以前，我们已经表明化合物 4-硝基-5-氨基咪唑核糖核苷酸 (NAIR) 是一种缓慢、紧密结合的酶抑制剂，Ki 为 0.34 nM。NAIR 的结构属性和缓慢、紧密的结合特性表明该化合物是一种过渡态或反应性中间体类似物。然而，尚不清楚 NAIR 的哪些分子特征有助于 AIR 羧化酶的两种拟议机制中的任何一种的模拟特性。为了获得关于 NAIR 对 AIR 羧化酶的有效抑制机制的更多信息，制备并评估了一系列杂环类似物。我们发现所有化合物都是比 NAIR 更弱的抑制剂，并且 CAIR 类似物不是该酶的替代底物。令人惊讶的是，NAIR 结构的相当细微的变化会导致结合亲和力的深刻变化。酶中间体和这些抑制剂的计算研究表明，NAIR 显示出类似于提议的反应中间体的静电势表面。结果表明 AIR 羧

  DOI：

  10.1016/j.bmc.2008.11.057

文献信息

• Interrogating the mechanism of a tight binding inhibitor of AIR carboxylase
  作者：Steven M. Firestine、Weidong Wu、Hasik Youn、V. Jo Davisson

  DOI：10.1016/j.bmc.2008.11.057

  日期：2009.1

  The enzyme aminoimidazole ribonucleotide (AIR) carboxylase catalyzes the synthesis of the purine intermediate, 4-carboxy-5-aminoimidazole ribonucleotide (CAIR). Previously, we have shown that the compound 4-nitro-5-aminoimidazole ribonucleotide (NAIR) is a slow, tight binding inhibitor of the enzyme with a Ki of 0.34 nM. The structural attributes and the slow, tight binding characteristics of NAIR implicated

  氨基咪唑核糖核苷酸 (AIR) 羧化酶催化嘌呤中间体 4-羧基-5-氨基咪唑核糖核苷酸 (CAIR) 的合成。以前，我们已经表明化合物 4-硝基-5-氨基咪唑核糖核苷酸 (NAIR) 是一种缓慢、紧密结合的酶抑制剂，Ki 为 0.34 nM。NAIR 的结构属性和缓慢、紧密的结合特性表明该化合物是一种过渡态或反应性中间体类似物。然而，尚不清楚 NAIR 的哪些分子特征有助于 AIR 羧化酶的两种拟议机制中的任何一种的模拟特性。为了获得关于 NAIR 对 AIR 羧化酶的有效抑制机制的更多信息，制备并评估了一系列杂环类似物。我们发现所有化合物都是比 NAIR 更弱的抑制剂，并且 CAIR 类似物不是该酶的替代底物。令人惊讶的是，NAIR 结构的相当细微的变化会导致结合亲和力的深刻变化。酶中间体和这些抑制剂的计算研究表明，NAIR 显示出类似于提议的反应中间体的静电势表面。结果表明 AIR 羧