(R)-2,4-Dihydroxy-3,3-dimethyl-N-[2-(2-propionylamino-ethylcarbamoyl)-ethyl]-butyramide | 147859-87-8

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机酸及其衍生物 - 羧酸及其衍生物
• 英文名称: (R)-2,4-Dihydroxy-3,3-dimethyl-N-[2-(2-propionylamino-ethylcarbamoyl)-ethyl]-butyramide
• 英文别名: (2R)-2,4-Dihydroxy-3,3-dimethyl-N-[3-oxo-3-[[2-[(1-oxopropyl)amino]ethyl]amino]propyl]butanamide；(2R)-2,4-dihydroxy-3,3-dimethyl-N-[3-oxo-3-[2-(propanoylamino)ethylamino]propyl]butanamide
• CAS: 147859-87-8
• 化学式: C₁₄H₂₇N₃O₅
• 分子量: 317.385
• InChiKey: FVGGLZHIFREMID-LBPRGKRZSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -1.5
• 重原子数：
  22
• 可旋转键数：
  10
• 环数：
  0.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.79
• 拓扑面积：
  128
• 氢给体数：
  5
• 氢受体数：
  5

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  (R)-2,4-Dihydroxy-3,3-dimethyl-N-[2-(2-propionylamino-ethylcarbamoyl)-ethyl]-butyramide 在 pantetheine kinase CoaA 、 5’-三磷酸腺苷 、 magnesium chloride 作用下， 反应 3.0h， 生成 Phosphoric acid mono-{(R)-3-hydroxy-2,2-dimethyl-3-[2-(2-propionylamino-ethylcarbamoyl)-ethylcarbamoyl]-propyl} ester
  参考文献：
  名称：

  柔红霉素启动酮合酶DpsC的结构和功能研究

  摘要：

  柔红霉素是II型聚酮化合物，是具有抗癌，抗生素和抗病毒活性的一大类多环芳族天然产物之一。II型聚酮化合物是通过丙二酰辅酶A构件的组装而形成的，尽管在极少数情况下，生物合成是通过掺入非丙二酰衍生的起始剂单元而引发的，这会增加聚β-酮主链的分子多样性。尚不清楚将新的起始剂单元转移到聚酮化合物合酶（PKS）上的引发机理。柔红霉素的生物合成过程包含一个独特的丙酰基启动子单元，该启动子单元被认为是启动酮合成酶（KS III）的一个子类（“ DpsC型”）所选择。然而，迄今为止，尚无该KS III酶亚类的结构信息。尽管以前已经暗示了用丙酰辅酶A进行自我酰化的选择性，我们证明DpsC对自酰基化或酰基转移至相关的酰基载体蛋白DpsG并带有短酰基CoAs并没有区别。我们介绍了DpsC的五个晶体结构，包括载脂蛋白-DpsC，乙酰基-DpsC，丙酰基-DpsC，丁酰基-DpsC，以及DpsC与不可水解的磷酸泛肽

  DOI：

  10.1021/acschembio.7b00551
• 作为产物：
  描述：

  在 盐酸 、 水 作用下， 以 四氢呋喃 为溶剂， 生成 (R)-2,4-Dihydroxy-3,3-dimethyl-N-[2-(2-propionylamino-ethylcarbamoyl)-ethyl]-butyramide
  参考文献：
  名称：

  大肠杆菌中炔基辅酶 A 抗代谢物的抗生素评价和体内分析。

  摘要：

  泛酰胺作为 CoA 和载体蛋白依赖性生物合成途径的潜在抑制剂已成为许多研究的主题。基于 3 对大肠杆菌生长抑制的初步观察，我们合成了一小部分泛酰巯基乙胺类似物，并重新检查了此类抗生素的抑制特性，重点是了解这些化合物作为底物的能力利用生物合成途径的天然 CoA 和载体蛋白。我们的研究结果表明，二级结构-活性关系是这些化合物抗生素活性的重要因素。

  DOI：

  10.1016/j.bmcl.2008.07.078

文献信息

• Martini, Harald; Retey, Janos, Angewandte Chemie, 1993, vol. 105, # 2, p. 287 - 289
  作者：Martini, Harald、Retey, Janos

  DOI：——

  日期：——
• Antibiotic evaluation and in vivo analysis of alkynyl Coenzyme A antimetabolites in Escherichia coli
  作者：Andrew C. Mercer、Jordan L. Meier、Gene H. Hur、Andrew R. Smith、Michael D. Burkart

  DOI：10.1016/j.bmcl.2008.07.078

  日期：2008.11

  of much study as potential inhibitors of CoA and carrier protein dependent biosynthetic pathways. Based on an initial observation of growth inhibition in Escherichia coli by 3, we have synthesized a small panel of pantetheine analogues and re-examined the inhibitory properties of this class of antibiotics with an emphasis on understanding the ability of these compounds to act as substrates of native

  泛酰胺作为 CoA 和载体蛋白依赖性生物合成途径的潜在抑制剂已成为许多研究的主题。基于 3 对大肠杆菌生长抑制的初步观察，我们合成了一小部分泛酰巯基乙胺类似物，并重新检查了此类抗生素的抑制特性，重点是了解这些化合物作为底物的能力利用生物合成途径的天然 CoA 和载体蛋白。我们的研究结果表明，二级结构-活性关系是这些化合物抗生素活性的重要因素。
• Structural and Functional Studies of the Daunorubicin Priming Ketosynthase DpsC
  作者：David R. Jackson、Gaurav Shakya、Avinash B. Patel、Lina Y. Mohammed、Kostas Vasilakis、Pakorn Wattana-Amorn、Timothy R. Valentic、Jacob C. Milligan、Matthew P. Crump、John Crosby、Shiou-Chuan Tsai

  DOI：10.1021/acschembio.7b00551

  日期：2018.1.19

  cocrystal of DpsC with a nonhydrolyzable phosphopantetheine (PPant) analogue. The DpsC crystal structures reveal the architecture of the active site, the molecular determinants for catalytic activity and homology to O-malonyl transferases, but also indicate distinct differences. These results provide a structural basis for rational engineering of starter unit selection in type II polyketide synthases.

  柔红霉素是II型聚酮化合物，是具有抗癌，抗生素和抗病毒活性的一大类多环芳族天然产物之一。II型聚酮化合物是通过丙二酰辅酶A构件的组装而形成的，尽管在极少数情况下，生物合成是通过掺入非丙二酰衍生的起始剂单元而引发的，这会增加聚β-酮主链的分子多样性。尚不清楚将新的起始剂单元转移到聚酮化合物合酶（PKS）上的引发机理。柔红霉素的生物合成过程包含一个独特的丙酰基启动子单元，该启动子单元被认为是启动酮合成酶（KS III）的一个子类（“ DpsC型”）所选择。然而，迄今为止，尚无该KS III酶亚类的结构信息。尽管以前已经暗示了用丙酰辅酶A进行自我酰化的选择性，我们证明DpsC对自酰基化或酰基转移至相关的酰基载体蛋白DpsG并带有短酰基CoAs并没有区别。我们介绍了DpsC的五个晶体结构，包括载脂蛋白-DpsC，乙酰基-DpsC，丙酰基-DpsC，丁酰基-DpsC，以及DpsC与不可水解的磷酸泛肽