prop-2-inylcarbamic acid 1-{2-[2-(2-tert-butoxycarbonylaminoethoxy)ethoxy]ethoxymethyl}-2-cyanoethyl ester | 1288999-01-8

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机酸及其衍生物 - 羧酸及其衍生物
• 英文名称: prop-2-inylcarbamic acid 1-{2-[2-(2-tert-butoxycarbonylaminoethoxy)ethoxy]ethoxymethyl}-2-cyanoethyl ester
• CAS: 1288999-01-8
• 化学式: C₁₉H₃₁N₃O₇
• 分子量: 413.471
• InChiKey: XVVKFOUWGQUZDI-UHFFFAOYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  1.2
• 重原子数：
  29.0
• 可旋转键数：
  14.0
• 环数：
  0.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.74
• 拓扑面积：
  128.14
• 氢给体数：
  2.0
• 氢受体数：
  8.0

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  prop-2-inylcarbamic acid 1-{2-[2-(2-tert-butoxycarbonylaminoethoxy)ethoxy]ethoxymethyl}-2-cyanoethyl ester 在 copper(l) iodide 、 四(三苯基膦)钯 、 2-氯-1,3,2-苯并二氧磷杂环己烷-4-酮 、 三乙胺 、 三氟乙酸 作用下， 以 1,4-二氧六环 、 吡啶 、 水 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 0.91h， 生成
  参考文献：
  名称：

  氟化物可切割、荧光标记的可逆终止子：合成和在引物延伸中的使用

  摘要：

  在 3'- O 上含有保护基团的荧光 2'-脱氧核苷酸-位置是可逆终止子，可实现基于阵列的 DNA 合成测序 (SBS) 方法。在此，我们描述了四个可逆终止子的合成和完整表征，这些终止子带有一个 3' 封闭部分和一个接头染料系统，该系统在相同的氟化物处理下可去除。每个核苷酸类似物都有一个不同的荧光团，通过氟化物可裂解的接头和 2-氰乙基部分作为 3'-封闭基团连接到碱基上，也可以通过使用氟化物处理来去除。此外，我们鉴定了一种 DNA 聚合酶，即 RevertAid M-MuLV 逆转录酶，它可以整合四种修饰的可逆终止子。

  DOI：

  10.1002/chem.201001952
• 作为产物：
  描述：

  (2-{2-[2-(3-cyano-2-hydroxypropoxy)ethoxy]ethoxy}ethyl)-carbamic acid tert-butyl ester 在 potassium carbonate 、 potassium hydrogencarbonate 作用下， 以 乙腈 为溶剂， 反应 27.0h， 生成 prop-2-inylcarbamic acid 1-{2-[2-(2-tert-butoxycarbonylaminoethoxy)ethoxy]ethoxymethyl}-2-cyanoethyl ester
  参考文献：
  名称：

  氟化物可切割、荧光标记的可逆终止子：合成和在引物延伸中的使用

  摘要：

  在 3'- O 上含有保护基团的荧光 2'-脱氧核苷酸-位置是可逆终止子，可实现基于阵列的 DNA 合成测序 (SBS) 方法。在此，我们描述了四个可逆终止子的合成和完整表征，这些终止子带有一个 3' 封闭部分和一个接头染料系统，该系统在相同的氟化物处理下可去除。每个核苷酸类似物都有一个不同的荧光团，通过氟化物可裂解的接头和 2-氰乙基部分作为 3'-封闭基团连接到碱基上，也可以通过使用氟化物处理来去除。此外，我们鉴定了一种 DNA 聚合酶，即 RevertAid M-MuLV 逆转录酶，它可以整合四种修饰的可逆终止子。

  DOI：

  10.1002/chem.201001952