N-(3-(dimethylamino)propyl)-1-methyl-4-(1-methyl-4-(1-methyl-4-(3-(1-methyl-4-(1-methyl-4-nitro-1H-pyrrole-2-carboxamido)-1H-pyrrole-2-carboxamido)propanamido)-1H-pyrrole-2-carboxamido)-1H-pyrrole-2-carboxamido)-1H-pyrrole-2-carboxamide | 160030-29-5

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机酸及其衍生物 - 羧酸及其衍生物
• 英文名称: N-(3-(dimethylamino)propyl)-1-methyl-4-(1-methyl-4-(1-methyl-4-(3-(1-methyl-4-(1-methyl-4-nitro-1H-pyrrole-2-carboxamido)-1H-pyrrole-2-carboxamido)propanamido)-1H-pyrrole-2-carboxamido)-1H-pyrrole-2-carboxamido)-1H-pyrrole-2-carboxamide
• CAS: 160030-29-5
• 化学式: C₃₈H₄₇N₁₃O₈
• 分子量: 813.873
• InChiKey: DDNDEEOWLMFHHO-UHFFFAOYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  2.48
• 重原子数：
  59.0
• 可旋转键数：
  17.0
• 环数：
  5.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.32
• 拓扑面积：
  245.63
• 氢给体数：
  6.0
• 氢受体数：
  14.0

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  N-(3-(dimethylamino)propyl)-1-methyl-4-(1-methyl-4-(1-methyl-4-(3-(1-methyl-4-(1-methyl-4-nitro-1H-pyrrole-2-carboxamido)-1H-pyrrole-2-carboxamido)propanamido)-1H-pyrrole-2-carboxamido)-1H-pyrrole-2-carboxamido)-1H-pyrrole-2-carboxamide 在 palladium on activated charcoal 氢气 、 1-羟基苯并三唑 、 N,N'-二环己基碳二亚胺 作用下， 以 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 6.33h， 生成 N-[5-[[5-[[3-[[5-[[5-[[5-[3-(dimethylamino)propylcarbamoyl]-1-methylpyrrol-3-yl]carbamoyl]-1-methylpyrrol-3-yl]carbamoyl]-1-methylpyrrol-3-yl]amino]-3-oxopropyl]carbamoyl]-1-methylpyrrol-3-yl]carbamoyl]-1-methylpyrrol-3-yl]-1-methylimidazole-2-carboxamide
  参考文献：
  名称：

  发夹肽基序。一类新的用于双螺旋 DNA 小沟序列特异性识别的寡肽

  摘要：

  作为反平行并排二聚体结合在 DNA 小沟中的肽可以头对尾连接，以提供一类新的发夹寡肽，其对 DNA 具有增强的序列特异性。合成了四种六肽，其中三（N-甲基吡咯甲酰胺）（P3）和 N-甲基咪唑-2-甲酰胺-netropsin（2-ImN）的末端胺和羧基分别与甘氨酸（Gly）、β-丙氨酸 (βAla)、4-氨基丁酸 (GABA) 和 5-氨基戊酸 (Ava) 氨基酸。六肽 2-ImN-GABA-P3 以 7.6 X 10^7 M^(-1)（10 mM Tris·HCl、10 mM KCl、10 mM MgCl_2 和5 mM CaCl_2，pH 7.0 和 22 °C）。

  DOI：

  10.1021/ja00097a004
• 作为产物：
  描述：

  [2-(5-{5-[5-(3-Dimethylamino-propylcarbamoyl)-1-methyl-1H-pyrrol-3-ylcarbamoyl]-1-methyl-1H-pyrrol-3-ylcarbamoyl}-1-methyl-1H-pyrrol-3-ylcarbamoyl)-ethyl]-carbamic acid tert-butyl ester 在 1-羟基苯并三唑 、 N,N'-二环己基碳二亚胺 、 三氟乙酸 作用下， 以 二氯甲烷 为溶剂， 反应 8.83h， 生成 N-(3-(dimethylamino)propyl)-1-methyl-4-(1-methyl-4-(1-methyl-4-(3-(1-methyl-4-(1-methyl-4-nitro-1H-pyrrole-2-carboxamido)-1H-pyrrole-2-carboxamido)propanamido)-1H-pyrrole-2-carboxamido)-1H-pyrrole-2-carboxamido)-1H-pyrrole-2-carboxamide
  参考文献：
  名称：

  发夹肽基序。一类新的用于双螺旋 DNA 小沟序列特异性识别的寡肽

  摘要：

  作为反平行并排二聚体结合在 DNA 小沟中的肽可以头对尾连接，以提供一类新的发夹寡肽，其对 DNA 具有增强的序列特异性。合成了四种六肽，其中三（N-甲基吡咯甲酰胺）（P3）和 N-甲基咪唑-2-甲酰胺-netropsin（2-ImN）的末端胺和羧基分别与甘氨酸（Gly）、β-丙氨酸 (βAla)、4-氨基丁酸 (GABA) 和 5-氨基戊酸 (Ava) 氨基酸。六肽 2-ImN-GABA-P3 以 7.6 X 10^7 M^(-1)（10 mM Tris·HCl、10 mM KCl、10 mM MgCl_2 和5 mM CaCl_2，pH 7.0 和 22 °C）。

  DOI：

  10.1021/ja00097a004