Design of HIV-1 Protease Inhibitors with Pyrrolidinones and Oxazolidinones as Novel P1′-Ligands To Enhance Backbone-Binding Interactions with Protease: Synthesis, Biological Evaluation, and Protein−Ligand X-ray Studies
作者:Arun K. Ghosh、Sofiya Leshchenko-Yashchuk、David D. Anderson、Abigail Baldridge、Marcus Noetzel、Heather B. Miller、Yunfeng Tie、Yuan-Fang Wang、Yasuhiro Koh、Irene T. Weber、Hiroaki Mitsuya
DOI:10.1021/jm900303m
日期:2009.7.9
Structure-based design, synthesis, and biological evaluation of a series of novel HIV-1 protease inhibitors are described. In an effort to enhance interactions with protease backbone atoms, we have incorporated stereochemically defined methyl-2-pyrrolidinone and methyl oxazolidinone as the P1′-ligands. These ligands are designed to interact with Gly-27′ carbonyl and Arg-8 side chain in the S1′-subsite
描述了一系列新型 HIV-1 蛋白酶抑制剂的基于结构的设计、合成和生物学评价。为了增强与蛋白酶骨架原子的相互作用,我们将立体化学定义的甲基-2-吡咯烷酮和甲基恶唑烷酮作为 P1'-配体。这些配体旨在与 HIV 蛋白酶 S1' 亚位点中的 Gly-27' 羰基和 Arg-8 侧链相互作用。我们已经研究了这些配体与我们之前开发的双四氢呋喃 (bis-THF) 和环戊基四氢呋喃 (Cp-THF) 结合作为 P2 配体的潜力。抑制剂19b ( R)-氨基甲基-2-吡咯烷酮和Cp-THF被证明是最有效的化合物。这种抑制剂对多重 PI 抗性临床 HIV-1 变体保持近乎完全的效力。19b结合的 HIV-1 蛋白酶的高分辨率蛋白质配体 X 射线晶体结构显示 P1'-吡咯烷酮杂环和 P2-Cp-配体参与与 S1' 和 S2 中的骨架原子的几个关键相互作用HIV-1蛋白酶的亚位点。