N,N'-((propane-1,3-diylbis(azanediyl))bis(propane-3,1-diyl))bis(2,2,2-trifluoroacetamide) | 294864-37-2

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机酸及其衍生物 - 羧酸及其衍生物
• 英文名称: N,N'-((propane-1,3-diylbis(azanediyl))bis(propane-3,1-diyl))bis(2,2,2-trifluoroacetamide)
• CAS: 294864-37-2
• 化学式: C₁₃H₂₂F₆N₄O₂
• 分子量: 380.334
• InChiKey: QSBYXZGZQWFTGA-UHFFFAOYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  0.69
• 重原子数：
  25.0
• 可旋转键数：
  12.0
• 环数：
  0.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.85
• 拓扑面积：
  82.26
• 氢给体数：
  4.0
• 氢受体数：
  4.0

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  N,N'-((propane-1,3-diylbis(azanediyl))bis(propane-3,1-diyl))bis(2,2,2-trifluoroacetamide) 在 ammonium hydroxide 作用下， 以 甲醇 、 二氯甲烷 为溶剂， 反应 37.0h， 生成 [3-(tert-Butoxycarbonyl-{3-[tert-butoxycarbonyl-(2-cyano-ethyl)-amino]-propyl}-amino)-propyl]-{3-[tert-butoxycarbonyl-(2-cyano-ethyl)-amino]-propyl}-carbamic acid tert-butyl ester
  参考文献：
  名称：

  DNA结合和基因传递的聚胺-聚乙二醇构建体的合成和表征。

  摘要：

  需要改进的非病毒载体系统，以在基因治疗中有效地将DNA传递至靶细胞核。通过适当的Boc保护的嘧啶衍生物与ω-甲氧基PEG环氧乙烷基甲基醚的反应合成了一系列线性多胺聚（乙二醇）（PEG）构建体。通过这种方法已经制备了带有1-3个MeOPEG单元和0、2或4个N-甲基的构建体。H2N（CH2）3NBoc（CH2）3NBoc（CH2）3NHBoc是通过在一个锅中通过三氟乙酰基除草剂，Boc的连接以及去除三氟乙酰基而有效制备的。类似的过程得到H 2 N（CH 2）3 NBoc（CH 2）3 NBoc（CH 2）3 NH 2。用1，3-二溴丙烷将BocMeN（CH2）3NHMe烷基化，得到BocMeN（CH2）3NMe（CH2）3NMe（CH2）3NMeBoc。氰基乙基化/还原序列扩展了H2N（CH2）3NBoc（CH2）3NBoc（CH2）3NH2，得到H2N（CH2）3NBoc（CH2）3NBo

  DOI：

  10.1016/s0968-0896(00)00113-9
• 作为产物：
  描述：

  N¹,N³-bis(2-cyanoethyl)propane-1,3-diamine 在 W-2 Raney Ni 氨 、 氢气 作用下， 以 甲醇 为溶剂， 20.0 ℃ 、359.97 kPa 条件下， 反应 90.0h， 生成 N,N'-((propane-1,3-diylbis(azanediyl))bis(propane-3,1-diyl))bis(2,2,2-trifluoroacetamide)
  参考文献：
  名称：

  DNA结合和基因传递的聚胺-聚乙二醇构建体的合成和表征。

  摘要：

  需要改进的非病毒载体系统，以在基因治疗中有效地将DNA传递至靶细胞核。通过适当的Boc保护的嘧啶衍生物与ω-甲氧基PEG环氧乙烷基甲基醚的反应合成了一系列线性多胺聚（乙二醇）（PEG）构建体。通过这种方法已经制备了带有1-3个MeOPEG单元和0、2或4个N-甲基的构建体。H2N（CH2）3NBoc（CH2）3NBoc（CH2）3NHBoc是通过在一个锅中通过三氟乙酰基除草剂，Boc的连接以及去除三氟乙酰基而有效制备的。类似的过程得到H 2 N（CH 2）3 NBoc（CH 2）3 NBoc（CH 2）3 NH 2。用1，3-二溴丙烷将BocMeN（CH2）3NHMe烷基化，得到BocMeN（CH2）3NMe（CH2）3NMe（CH2）3NMeBoc。氰基乙基化/还原序列扩展了H2N（CH2）3NBoc（CH2）3NBoc（CH2）3NH2，得到H2N（CH2）3NBoc（CH2）3NBo

  DOI：

  10.1016/s0968-0896(00)00113-9

文献信息

• Developing Bivalent Ligands to Target CUG Triplet Repeats, the Causative Agent of Myotonic Dystrophy Type 1
  作者：Amin Haghighat Jahromi、Yuan Fu、Kali A. Miller、Lien Nguyen、Long M. Luu、Anne M. Baranger、Steven C. Zimmerman

  DOI：10.1021/jm400794z

  日期：2013.12.12

  expanded CUG repeat transcript (CUGexp) is the causative agent of myotonic dystrophy type 1 (DM1) by sequestering muscleblind-like 1 protein (MBNL1), a regulator of alternative splicing. On the basis of a ligand (1) that was previously reported to be active in an in vitro assay, we present the synthesis of a small library containing 10 dimeric ligands (4–13) that differ in length, composition, and attachment

  扩展的 CUG 重复转录本 (CUG exp ) 是通过隔离肌盲样 1 蛋白 (MBNL1) 导致 1 型强直性肌营养不良 (DM1) 的病原体，MBNL1 是可变剪接的调节因子。基于先前报道在体外测定中具有活性的配体 ( 1 )，我们提出了一个包含 10个二聚配体 ( 4-13 )的小文库的合成，这些配体的长度、组成和附着点不同链接链。与寡醚接头相比，寡氨基接头对 CUG RNA 的亲和力更大，并且更有效。最有效的体外配体（9) 被证明是水溶性的并且具有细胞和细胞核渗透性，在 DM1 细胞模型中显示 MBNL1 核糖核病灶几乎完全分散。使用延时共聚焦荧光显微镜观察到9的生物活性的直接证据是其在单个活 DM1 模型细胞中分散核糖核病灶的能力。
• Dicationic Bis(9-methylphenazine-1-carboxamides):  Relationships between Biological Activity and Linker Chain Structure for a Series of Potent Topoisomerase Targeted Anticancer Drugs
  作者：Swarna A. Gamage、Julie A. Spicer、Graeme J. Finlay、Alistair J. Stewart、Peter Charlton、Bruce C. Baguley、William A. Denny

  DOI：10.1021/jm0003283

  日期：2001.4.1

  reverse effects, with the R = Me analogue being more potent than the R = H one as well as being the most potent in the series [IC(50) in JL(C) cells 0.08 nM; superior to that for the clinical bis(naphthalimide) LU 79553]. Overall, the IC(50)s of analogues with linker chains (CH(2))(n)NH(CH(2))(m)NH(CH(2))(n) were inversely proportional to linker length. Constraining the rigidity of the linker chain by incorporating

  双（9-甲基吩嗪-1-羧酰胺）通过各种不同的dicicic（CH（2））（n）（）NR（CH（2））（m）NR（CH（2））（n）接头连接通过使9-甲基吩嗪-1-羧酸咪唑啉化物与适当的多胺反应，制备了长度（羧酰胺NN距离为11.0至18.4A）和刚性。评价了这些化合物在P388白血病，Lewis肺癌以及野生型（JL（C））和突变型（JL（A）和JL（D））形式的人Jurkat白血病中具有低水平的拓扑异构酶II的生长抑制特性（拓扑II）。这些化合物在抗性Jurkat品系中均具有小于1的IC（50）比，这与对topo II的抑制作用不是主要的作用机理相一致。由（CH（2））（2）NR（CH（2））（2）NR（CH（2））（2）接头连接的类似物是非常有效的细胞毒素，对人类细胞系具有选择性，但是绝对效能从R = H到R = Me急剧下降到R = Pr和Bu。相反，（CH（2））（2）NR（CH（2
• Structure–activity relationships of lipopolysaccharide sequestration in N-alkylpolyamines
  作者：Anurupa Shrestha、Diptesh Sil、Subbalakshmi S. Malladi、Hemamali J. Warshakoon、Sunil A. David

  DOI：10.1016/j.bmcl.2009.03.055

  日期：2009.5

  We have previously shown that simple N-acyl or N-alkyl polyamines bind to and sequester Gram-negative bacterial lipopolysaccharide, affording protection against lethality in animal models of endotoxicosis. Several iterative design-and-test cycles of SAR studies, including high-throughput screens, had converged on compounds with polyamine scaffolds which have been investigated extensively with reference to the number, position, and length of acyl or alkyl appendages. However, the polyamine backbone itself had not been explored sufficiently, and it was not known if incremental variations on the polymethylene spacing would affect LPS-binding and neutralization properties. We have now systematically explored the relationship between variously elongated spermidine [NH2-(CH2)(3)-NH-(CH2)(4)-NH2] and norspermidine [NH2-(CH2)(3)-NH-(CH2)(3)-NH2] backbones, with the N-alkyl group being held constant at C-16 in order to examine if changing the spacing between the inner secondary amines may yield additional SAR information. We find that the norspermine-type compounds consistently showed higher activity compared to corresponding spermine homologues. (c) 2009 Elsevier Ltd. All rights reserved.