isophthalic acid methyl ONSu ester | 1334952-91-8

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 苯和取代衍生物
• 英文名称: isophthalic acid methyl ONSu ester
• 英文别名: 2,5-Dioxopyrrolidin-1-yl methyl isophthalate；3-O-(2,5-dioxopyrrolidin-1-yl) 1-O-methyl benzene-1,3-dicarboxylate
• CAS: 1334952-91-8
• 化学式: C₁₃H₁₁NO₆
• 分子量: 277.233
• InChiKey: RNFAEFHUHOYZCY-UHFFFAOYSA-N

物化性质

• 沸点：
  430.1±47.0 °C(Predicted)
• 密度：
  1.43±0.1 g/cm3(Predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  0.7
• 重原子数：
  20
• 可旋转键数：
  5
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.23
• 拓扑面积：
  90
• 氢给体数：
  0
• 氢受体数：
  6

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  isophthalic acid methyl ONSu ester 在 caesium carbonate 、 三氟乙酸 作用下， 以 甲醇 、 水 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 2.0h， 生成 5'-O-[N-(3-methoxycarbonylbenzoyl)sulfamoyl]cytidine
  参考文献：
  名称：

  Sialyltransferase inhibitors: consideration of molecular shape and charge/hydrophobic interactions

  摘要：

  In order to evaluate the importance of molecular shape of inhibitor molecules and the charge/H-bond and hydrophobic interactions, we synthesized three types of molecules and tested them against a sialyltransferase. The first type of compounds were designed as substrate mimics in which the phosphate in CMP-Neu5NAc was replaced by a non-hydrolysable, uncharged 1,2,3-triazole moiety. The second type of compound contained a 2-deoxy-2,3-dehydro-acetylneuraminic moiety which was linked to cytidine through its carboxylic acid and amide linkers. In the third type of compound the sialyl phosphate was substituted by an aryl sulfonamide which was then linked to cytidine. Inhibition study of these cytidine conjugates against Campylobacter jejuni sialyltransferase Cst 06 showed that the first type of molecules are competitive inhibitors, whereas the other two could only inhibit the enzyme non-competitively. The results indicate that although the binding specificity may be guided by molecular shape and H-bond interaction, the charge and hydrophobic interactions contributed most to the binding affinity. Crown Copyright (C) 2013 Published by Elsevier Ltd. All rights reserved.

  DOI：

  10.1016/j.carres.2012.12.017
• 作为产物：
  描述：

  N-羟基丁二酰亚胺 、 间苯二甲酸单甲酯 在 N,N'-二环己基碳二亚胺 作用下， 以 四氢呋喃 为溶剂， 反应 19.0h， 以22.4%的产率得到isophthalic acid methyl ONSu ester
  参考文献：
  名称：

  人工分子钳：一种合成聚合酶的新型设备。

  摘要：

  由环糊精（CD）二聚体组成的合成聚合酶无需使用溶剂和助催化剂即可产生高分子量的环状酯聚合物。一个CD部分连接至超分子催化剂的活性位点，并通过充当人工分子钳位（参见图片）来传播聚合反应。另一个CD部分引发开环聚合。

  DOI：

  10.1002/anie.201102834

文献信息

• Discovery and Structure-Based Design of Macrocyclic Peptides Targeting STUB1
  作者：Simon Ng、Alexander C. Brueckner、Soheila Bahmanjah、Qiaolin Deng、Jennifer M. Johnston、Lan Ge、Ruchia Duggal、Bahanu Habulihaz、Benjamin Barlock、Sookhee Ha、Ahmad Sadruddin、Constance Yeo、Corey Strickland、Andrea Peier、Brian Henry、Edward C. Sherer、Anthony W. Partridge

  DOI：10.1021/acs.jmedchem.2c00406

  日期：2022.7.28

  are lacking. Identifying a tool compound will be a step toward validating the target in a broader therapeutic sense. Herein, screening more than a billion macrocyclic peptides resulted in STUB1 binders, which were further optimized by a structure-enabled in silico design. The strategy to replace the macrocyclic peptides’ hydrophilic and solvent-exposed region with a hydrophobic scaffold improved cellular

  最近的证据表明，删除 STUB1（干扰素-γ 传感的关键负调节因子）可能会清除恶性细胞。然而，目前的研究主要依赖于遗传方法，因为缺乏 STUB1 的药理学抑制剂。识别工具化合物将是在更广泛的治疗意义上验证靶标的一步。在此，筛选了超过 10 亿个大环肽，产生了 STUB1 结合物，并通过计算机设计中的结构进一步优化。用疏水性支架取代大环肽的亲水性和溶剂暴露区域的策略改善了细胞通透性，同时保持了结合构象。用四唑生物等排体进一步取代限制通透性的末端天冬氨酸，在一定程度上保留了结合，同时提高了通透性，这表明了一条前进的道路。尽管对于细胞研究来说不是最佳的，但当前的先导化合物为进一步开发 STUB1 的选择性工具化合物以实现目标验证提供了有价值的模板。