3,5-diamino-N-(2-((2-aminoethyl)amino)ethyl)-6-chloropyrazine-2-carboxamide | 1449337-10-3

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 二嗪类
• 英文名称: 3,5-diamino-N-(2-((2-aminoethyl)amino)ethyl)-6-chloropyrazine-2-carboxamide
• CAS: 1449337-10-3
• 化学式: C₉H₁₆ClN₇O
• 分子量: 273.725
• InChiKey: ZFPZNKNRQKYZBY-UHFFFAOYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -1.43
• 重原子数：
  18.0
• 可旋转键数：
  6.0
• 环数：
  1.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.44
• 拓扑面积：
  144.97
• 氢给体数：
  5.0
• 氢受体数：
  7.0

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  3,5-diamino-N-(2-((2-aminoethyl)amino)ethyl)-6-chloropyrazine-2-carboxamide 、 4-(N,N-二甲基胺磺酰基)-7-氟苯并呋喃 以 三乙胺 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 12.0h， 以28%的产率得到
  参考文献：
  名称：

  使用β-环糊精修饰的DNA和DNA和RNA支架上的荧光配体协同识别特定核糖核酸的合理设计。

  摘要：

  我们通过结合合理设计的两个探针协同工作，提出了一种用于DNA和RNA分析的二元荧光法。一种探针是带有β-环糊精（β-CyD）的寡核苷酸（ODN）偶联物。另一个探针是一个小的报告配体，它包含一个核碱基特异性杂环和对环境敏感的荧光团的连接分子。报道分子配体的杂环可识别在缀合物标记的靶标上的缺口中显示的单个核碱基，同时，荧光团部分与附近的β-CyD形成发光的包合物。三个报告子配体，MNDS（萘啶-丹磺酰基连接的配体），MNDB（萘啶-DBD）和DPDB（吡啶DBD），被用于DNA和RNA与3'末端或5'末端修饰的β-何秀兰探测- ODN缀合物。对于DNA靶标，拴在ODN面向间隙的3'-末端的β-CyD与伸出间隙位点主要凹槽（MNDS和DPDB）的荧光团相互作用。同时，ODN 5'端的β-CyD与小沟（MNDB和DPDB）中的荧光团相互作用。这项研究获得的结果可能是基于控制功能分子的接近度来设计二元DNA

  DOI：

  10.1002/chem.201300985
• 作为产物：
  描述：

  二乙烯三胺 、 3,5-二氨基-6-氯吡嗪-2-羧酸甲酯 反应 24.0h， 生成 3,5-diamino-N-(2-((2-aminoethyl)amino)ethyl)-6-chloropyrazine-2-carboxamide
  参考文献：
  名称：

  使用β-环糊精修饰的DNA和DNA和RNA支架上的荧光配体协同识别特定核糖核酸的合理设计。

  摘要：

  我们通过结合合理设计的两个探针协同工作，提出了一种用于DNA和RNA分析的二元荧光法。一种探针是带有β-环糊精（β-CyD）的寡核苷酸（ODN）偶联物。另一个探针是一个小的报告配体，它包含一个核碱基特异性杂环和对环境敏感的荧光团的连接分子。报道分子配体的杂环可识别在缀合物标记的靶标上的缺口中显示的单个核碱基，同时，荧光团部分与附近的β-CyD形成发光的包合物。三个报告子配体，MNDS（萘啶-丹磺酰基连接的配体），MNDB（萘啶-DBD）和DPDB（吡啶DBD），被用于DNA和RNA与3'末端或5'末端修饰的β-何秀兰探测- ODN缀合物。对于DNA靶标，拴在ODN面向间隙的3'-末端的β-CyD与伸出间隙位点主要凹槽（MNDS和DPDB）的荧光团相互作用。同时，ODN 5'端的β-CyD与小沟（MNDB和DPDB）中的荧光团相互作用。这项研究获得的结果可能是基于控制功能分子的接近度来设计二元DNA

  DOI：

  10.1002/chem.201300985