Nα-Boc-lysylalanylalanine methyl ester | 1278592-49-6

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机酸及其衍生物 - 羧酸及其衍生物
• 英文名称: Nα-Boc-lysylalanylalanine methyl ester
• 英文别名: H-Lys(Boc)-Ala-Ala-OMe；methyl (2S)-2-[[(2S)-2-[[(2S)-2-amino-6-[(2-methylpropan-2-yl)oxycarbonylamino]hexanoyl]amino]propanoyl]amino]propanoate
• CAS: 1278592-49-6
• 化学式: C₁₈H₃₄N₄O₆
• 分子量: 402.491
• InChiKey: OWQLSWJFEUKRQT-AVGNSLFASA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  0.19
• 重原子数：
  28.0
• 可旋转键数：
  10.0
• 环数：
  0.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.78
• 拓扑面积：
  148.85
• 氢给体数：
  4.0
• 氢受体数：
  7.0

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  Nα-Boc-lysylalanylalanine methyl ester 在 三乙基硅烷 、 sodium carbonate 、 三乙胺 作用下， 以 四氢呋喃 、 甲醇 、 二氯甲烷 为溶剂， 反应 2.0h， 生成 Nα-(4-nitrobenzoyl)-Nε-thioacetyllysylalanylalanine methyl ester
  参考文献：
  名称：

  Mechanism-based affinity capture of sirtuins

  摘要：

  探测酶的催化活性以及在复杂生化环境中检测其丰度的能力，传统上依赖于动力学测定和诸如使用昂贵试剂（如抗体）的西方印迹等技术。能够同时检测活性并从混合物中分离蛋白催化剂更为困难，在大多数情况下几乎不可能。在本手稿中，我们描述了一种化学方法，利用新型化学工具实现这一目标，针对一种独特的酶家族——去乙酰化酶（sirtuins），从而使得能够快速检测其活性并分离这些蛋白催化剂。去乙酰化酶与许多生理功能的调节相关，包括能量代谢、DNA损伤应答和细胞应激抵抗。我们合成了一种氨氧基衍生的NAD+和一种泛去乙酰化酶抑制剂，该抑制剂会在去乙酰化酶的活性位点反应，形成一种化学稳定的复合物，随后可以与醛基取代的生物素交联。通过链霉亲和素珠子回收生物素化的去乙酰化酶复合物，再通过胶体电泳，我们实现了对活性去乙酰化酶的同时检测、分离和分子量测定。我们展示了这些工具能与多种人类去乙酰化酶亚型（包括SIRT1、SIRT2、SIRT3、SIRT5、SIRT6）交叉反应，并且也能与微生物来源的去乙酰化酶反应。最后，我们展示了能够在反应混合物中同时检测多个去乙酰化酶亚型，确立了在复杂生物样品中进行去乙酰化酶化学研究的概念验证工具。

  DOI：

  10.1039/c0ob00774a
• 作为产物：
  描述：

  Nα-Fmoc-Nε-Boc-lysylalanylalanine methyl ester 在 哌啶 作用下， 以 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 0.33h， 以100%的产率得到Nα-Boc-lysylalanylalanine methyl ester
  参考文献：
  名称：

  Mechanism-based affinity capture of sirtuins

  摘要：

  探测酶的催化活性以及在复杂生化环境中检测其丰度的能力，传统上依赖于动力学测定和诸如使用昂贵试剂（如抗体）的西方印迹等技术。能够同时检测活性并从混合物中分离蛋白催化剂更为困难，在大多数情况下几乎不可能。在本手稿中，我们描述了一种化学方法，利用新型化学工具实现这一目标，针对一种独特的酶家族——去乙酰化酶（sirtuins），从而使得能够快速检测其活性并分离这些蛋白催化剂。去乙酰化酶与许多生理功能的调节相关，包括能量代谢、DNA损伤应答和细胞应激抵抗。我们合成了一种氨氧基衍生的NAD+和一种泛去乙酰化酶抑制剂，该抑制剂会在去乙酰化酶的活性位点反应，形成一种化学稳定的复合物，随后可以与醛基取代的生物素交联。通过链霉亲和素珠子回收生物素化的去乙酰化酶复合物，再通过胶体电泳，我们实现了对活性去乙酰化酶的同时检测、分离和分子量测定。我们展示了这些工具能与多种人类去乙酰化酶亚型（包括SIRT1、SIRT2、SIRT3、SIRT5、SIRT6）交叉反应，并且也能与微生物来源的去乙酰化酶反应。最后，我们展示了能够在反应混合物中同时检测多个去乙酰化酶亚型，确立了在复杂生物样品中进行去乙酰化酶化学研究的概念验证工具。

  DOI：

  10.1039/c0ob00774a

文献信息

• Development of Second Generation Activity-Based Chemical Probes for Sirtuins
  作者：Alyson M. Curry、Elizabeth Barton、Wenjia Kang、Daniel V. Mongeluzi、Yana Cen

  DOI：10.3390/molecules26010011

  日期：——

  shortened irradiation time, and reduced background signal. They were applied to the labeling of individual recombinant proteins, protein mixtures, and whole cell lysate. These cell permeable small molecule probes also enabled the cellular imaging of sirtuin activity change. Taken together, our study provides new chemical biology tools and future drug discovery strategies for perturbing the activity of different

  NAD+（烟酰胺腺嘌呤二核苷酸）依赖性蛋白质脱酰酶，即沉默调节蛋白，是重要的细胞衔接蛋白，可响应低热量条件改变细胞生理学。它们被认为可以调节卡路里限制的有益效果，以延长寿命和改善健康状况。非常需要新型化学探针，以更好地了解 Sirtuin 在各种生物过程中的作用。我们开发了一组非常简单的基于活性的化学探针，用于研究复杂天然蛋白质组中的活性 Sirtuin 含量。这些探针带有一个硫代酰基赖氨酸弹头、一个二氮嗪光亲和标签，以及一个末端炔烃生物正交官能团。与含有二苯甲酮的对应物相比，这些新探针显示出更高的标记效率和灵敏度，缩短照射时间，减少背景信号。它们被用于标记单个重组蛋白、蛋白质混合物和全细胞裂解物。这些可渗透细胞的小分子探针还能够对 Sirtuin 活性变化进行细胞成像。综上所述，我们的研究提供了新的化学生物学工具和未来的药物发现策略，以扰乱不同 Sirtuin 亚型的活性。