benzyl (2-((3-((2R,3R,4S,5R)-3,4-dihydroxy-5-(hydroxymethyl)tetrahydrofuran-2-yl)-2-oxo-2,10-dihydro-3H-benzo[b]pyrimido[4,5-e][1,4]oxazin-9-yl)oxy)ethyl)carbamate | 1188522-63-5

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机氧化合物
• 英文名称: benzyl (2-((3-((2R,3R,4S,5R)-3,4-dihydroxy-5-(hydroxymethyl)tetrahydrofuran-2-yl)-2-oxo-2,10-dihydro-3H-benzo[b]pyrimido[4,5-e][1,4]oxazin-9-yl)oxy)ethyl)carbamate
• CAS: 1188522-63-5
• 化学式: C₂₅H₂₆N₄O₉
• 分子量: 526.503
• InChiKey: BDALNXXHGCQPKK-KTDPBYDISA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  1.01
• 重原子数：
  38.0
• 可旋转键数：
  8.0
• 环数：
  5.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.32
• 拓扑面积：
  173.63
• 氢给体数：
  5.0
• 氢受体数：
  12.0

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  benzyl (2-((3-((2R,3R,4S,5R)-3,4-dihydroxy-5-(hydroxymethyl)tetrahydrofuran-2-yl)-2-oxo-2,10-dihydro-3H-benzo[b]pyrimido[4,5-e][1,4]oxazin-9-yl)oxy)ethyl)carbamate 在 盐酸 、 1,8-二氮杂双环[5.4.0]十一碳-7-烯 作用下， 以 甲醇 、 乙醇 、 二氯甲烷 、 水 为溶剂， 反应 85.0h， 生成 3-(2-((2-aminoethyl)amino)-2-oxoethyl)-9-(2-aminoethoxy)-1,3-diaza-2-oxophenoxazine
  参考文献：
  名称：

  G4靶向吩恶嗪衍生物的体外抗癌活性

  摘要：

  G4 稳定配体现在被认为是抗癌剂、抗病毒剂和抗菌剂。吩恶嗪是用于开发 G4 配体的有前途的支架。在这里，我们针对来自端粒重复序列和KIT启动子区域的 G4 靶标分析了两种已知的基于吩恶嗪的核苷类似物和五种新的核苷和非核苷衍生物。领先的新衍生物表现出非常高的 G4 稳定效果（与常用的选择性 G4 配体 PDS 和 NMM 的效果相当或更好）和对双链上 G4 的选择性（优于 BRACO-19）。所有基于吩恶嗪的配体均抑制细胞代谢活性。吩恶嗪衍生物对肺腺癌细胞 A549' 和人肝癌细胞 HepG2（核苷类似物的 EC50 在纳摩尔范围内）特别有毒，但也影响乳腺癌细胞 MCF7，以及永生化成纤维细胞 VA13 和胚胎肾细胞 HEK293t。 EC50 在微摩尔范围内）。重要的是，EC50 值的变化主要取决于 G4 结合亲和力和 G4 稳定效应，以及定位于细胞核中的吩恶嗪衍生物，这证实了 G4 介导的作用机制。

  DOI：

  10.1016/j.biochi.2022.07.001
• 作为产物：
  描述：

  5-bromo-2',3',5'-tri-O-acetyluridine 在 三苯基膦 、 偶氮二甲酸二乙酯 作用下， 以 四氯化碳 、 二氯甲烷 为溶剂， 生成 benzyl (2-((3-((2R,3R,4S,5R)-3,4-dihydroxy-5-(hydroxymethyl)tetrahydrofuran-2-yl)-2-oxo-2,10-dihydro-3H-benzo[b]pyrimido[4,5-e][1,4]oxazin-9-yl)oxy)ethyl)carbamate
  参考文献：
  名称：

  吩恶嗪核苷衍生物的抗病毒活性谱

  摘要：

  吩恶嗪支架广泛用作稳定核酸双链体，是用于研究核酸结构，识别和代谢等的荧光探针的一部分。在这里，我们介绍基于吩恶嗪的核苷衍生物的合成及其对甲氧西林的抗病毒活性。结构多样的病毒：包膜DNA疱疹病毒水痘带状疱疹病毒（VZV）和人巨细胞病毒，包膜RNA-传脑炎病毒（TBEV）和非包膜RNA肠病毒。研究的化合物可有效抵抗细胞培养物中DNA和RNA病毒的繁殖。3-（2'-脱氧-β-D-呋喃呋喃糖基）-1,3-二氮杂-2-氧代苯恶嗪被证明是VZV复制的有效抑制剂，对野生型的活性优于对胸苷激酶缺陷的菌株（EC 50分别为0.06和10μM）。该化合物在所有研究的细胞系中均未显示出细胞毒性。几种化合物具有抗TBEV的活性（EC 50 0.35–0.91μM），但具有明显的细胞毒性。这些化合物可以作为抗疱疹病毒或抗黄病毒化合物被认为是进一步优化结构的良好起点。

  DOI：

  10.1016/j.antiviral.2019.01.010

文献信息

• [EN] NUCLEIC ACID CHEMICAL MODIFICATIONS<br/>[FR] MODIFICATIONS CHIMIQUES D'ACIDE NUCLÉIQUE
  申请人：ALNYLAM PHARMACEUTICALS INC

  公开号：WO2010101951A1

  公开（公告）日：2010-09-10

  he present invention provides nucleosides of formula (1) and oligonucleotides comprising at least on nucleoside of formula (2): Another aspect of the invention relates to a method of inhibiting the expression of a gene in cell, the method comprising (a) contacting an oligonucleotide of the invention with the cell; and (b) maintaining the cell from step (a) for a time sufficient to obtain degradation of the mRNA of the target gene.

  本发明提供了式（1）的核苷和包含至少一种式（2）核苷的寡核苷酸；发明的另一个方面涉及一种抑制细胞中基因表达的方法，该方法包括（a）将本发明的寡核苷酸与细胞接触；和（b）维持步骤（a）中的细胞足够长的时间以获得目标基因mRNA的降解。
• [EN] NON-NATURAL RIBONUCLEOTIDES, AND METHODS OF USE THEREOF<br/>[FR] RIBONUCLÉOTIDES NON NATURELS, ET PROCÉDÉS POUR LES UTILISER
  申请人：ALNYLAM PHARMACEUTICALS INC

  公开号：WO2009120878A3

  公开（公告）日：2009-11-19