6-[2-[3-[5-[2-[4-(2,2-difluoro-4,6,10,12-tetramethyl-3-aza-1-azonia-2-boranuidatricyclo[7.3.0.03,7]dodeca-1(12),4,6,8,10-pentaen-8-yl)-3-methoxyphenyl]ethynyl]-1,3,3-trimethylindol-1-ium-2-yl]prop-2-enylidene]-3,3-dimethylindol-1-yl]hexanoic acid;iodide | 1260102-33-7

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 吲哚及其衍生物
• 英文名称: 6-[2-[3-[5-[2-[4-(2,2-difluoro-4,6,10,12-tetramethyl-3-aza-1-azonia-2-boranuidatricyclo[7.3.0.03,7]dodeca-1(12),4,6,8,10-pentaen-8-yl)-3-methoxyphenyl]ethynyl]-1,3,3-trimethylindol-1-ium-2-yl]prop-2-enylidene]-3,3-dimethylindol-1-yl]hexanoic acid;iodide
• CAS: 1260102-33-7
• 化学式: C₅₂H₅₆BF₂N₄O₃*I
• 分子量: 960.754
• InChiKey: IXENJHPBJGTHEC-UHFFFAOYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  7.84
• 重原子数：
  63
• 可旋转键数：
  12
• 环数：
  8.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.33
• 拓扑面积：
  60.7
• 氢给体数：
  1
• 氢受体数：
  8

反应信息

• 作为产物：
  描述：

  5-碘-2,3,3-三甲基-3H-吲哚 在 吡啶 、 copper(l) iodide 、 四(三苯基膦)钯 、 三乙胺 作用下， 以 甲醇 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 30.0h， 生成 6-[2-[3-[5-[2-[4-(2,2-difluoro-4,6,10,12-tetramethyl-3-aza-1-azonia-2-boranuidatricyclo[7.3.0.03,7]dodeca-1(12),4,6,8,10-pentaen-8-yl)-3-methoxyphenyl]ethynyl]-1,3,3-trimethylindol-1-ium-2-yl]prop-2-enylidene]-3,3-dimethylindol-1-yl]hexanoic acid;iodide
  参考文献：
  名称：

  具有极好分辨率荧光输出的封装能量传输盒

  摘要：

  本文涉及具有可调光子特性的水相容荧光成像探针的开发，这些探针可以在单一波长下激发。使用简单的合成路线制备了由 BODIPY 供体和花青受体组成的双色团盒 1a-1c，并研究了它们的光物理特性。在 488 nm 激发 BODIPY 部分后，激发能量通过乙炔桥转移到花青染料受体，后者发出大约 600、700 和 800 nm 的光，即具有显着的色散。有效的能量转移促进了这种效应，它在 86 和 290 nm 之间产生了“准斯托克斯”位移，为成像打开了一个巨大的光谱窗口。暗盒的发射特性取决于能量转移 (ET) 机制：转移速度越快，效率越高。ET 速率的测量表明，在盒 1a 和 1b 中发生的直通键 ET 比经典的直通空间 Förster ET 快 2 个数量级。然而，在盒式磁带 1c 的情况下，两种机制都是可能的，并且速率测量不允许我们区分它们。因此，盒式磁带 1a-1c 非常适合在涉及单个激光

  DOI：

  10.1021/ja107193j

文献信息

• Organelle-selective energy transfer: A fluorescent indicator of intracellular environment
  作者：Aurore Loudet、Yuichiro Ueno、Liangxing Wu、Jiney Jose、Rola Barhoumi、Robert Burghardt、Kevin Burgess

  DOI：10.1016/j.bmcl.2011.01.040

  日期：2011.3

  A dye cassette fluoresces green (ca 520 nm) in the cytoplasm, endoplasmic reticulum (ER), and lysosomes, but red in mitochondria, that is, it illustrates 'organelle specific energy transfer'. This phenomenon may open new horizons in intracellular imaging. (C) 2011 Elsevier Ltd. All rights reserved.
• Encapsulated Energy-Transfer Cassettes with Extremely Well Resolved Fluorescent Outputs
  作者：Yuichiro Ueno、Jiney Jose、Aurore Loudet、César Pérez-Bolívar、Pavel Anzenbacher、Kevin Burgess

  DOI：10.1021/ja107193j

  日期：2011.1.12

  spectral window for imaging. The emissive properties of the cassettes depend on the energy-transfer (ET) mechanism: the faster the transfer, the more efficient it is. Measurements of rates of ET indicate that a through-bond ET takes place in the cassettes 1a and 1b that is 2 orders of magnitude faster than the classical through-space, Förster ET. In the case of cassette 1c, however, both mechanisms are possible

  本文涉及具有可调光子特性的水相容荧光成像探针的开发，这些探针可以在单一波长下激发。使用简单的合成路线制备了由 BODIPY 供体和花青受体组成的双色团盒 1a-1c，并研究了它们的光物理特性。在 488 nm 激发 BODIPY 部分后，激发能量通过乙炔桥转移到花青染料受体，后者发出大约 600、700 和 800 nm 的光，即具有显着的色散。有效的能量转移促进了这种效应，它在 86 和 290 nm 之间产生了“准斯托克斯”位移，为成像打开了一个巨大的光谱窗口。暗盒的发射特性取决于能量转移 (ET) 机制：转移速度越快，效率越高。ET 速率的测量表明，在盒 1a 和 1b 中发生的直通键 ET 比经典的直通空间 Förster ET 快 2 个数量级。然而，在盒式磁带 1c 的情况下，两种机制都是可能的，并且速率测量不允许我们区分它们。因此，盒式磁带 1a-1c 非常适合在涉及单个激光