(1S,2S,3S,4S,5R,6R)-3,4,5-tris(benzyloxy)-6-((benzyloxy)methyl)bicyclo[4.1.0]heptan-2-ol | 845799-28-2

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 苯和取代衍生物
• 英文名称: (1S,2S,3S,4S,5R,6R)-3,4,5-tris(benzyloxy)-6-((benzyloxy)methyl)bicyclo[4.1.0]heptan-2-ol
• CAS: 845799-28-2
• 化学式: C₃₆H₃₈O₅
• 分子量: 550.695
• InChiKey: WQQDNRSREREXPX-YTIMIXIJSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  6.34
• 重原子数：
  41.0
• 可旋转键数：
  13.0
• 环数：
  6.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.33
• 拓扑面积：
  57.15
• 氢给体数：
  1.0
• 氢受体数：
  5.0

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  (1S,2S,3S,4S,5R,6R)-3,4,5-tris(benzyloxy)-6-((benzyloxy)methyl)bicyclo[4.1.0]heptan-2-ol 在 palladium on activated charcoal 四氮唑 、 sodium hypochlorite 、 氢气 作用下， 以 四氢呋喃 、 甲醇 、 二氯甲烷 、 水 为溶剂， 反应 25.0h， 生成 (1S,2S,3R,4S,5R,6R)-3,4,5-trihydroxy-6-(hydroxymethyl)bicyclo[4.1.0]heptan-2-yl dihydrogen phosphate
  参考文献：
  名称：

  Synthesis and biological evaluation of a bicyclo[4.1.0]heptyl analogue of glucose-1-phosphate

  摘要：

  报道了一种葡萄糖-1-磷酸的双环[4.1.0]庚基类似物的合成，即(1R,2R,3S,4S,5S,6S)-3,4,5-三羟基-6-(羟甲基)-双环[4.1.0]庚烷-2-基二氢磷酸酯(5)。所选择的合成路线始于甲基α-D-葡萄糖吡喃醇，共经过11步反应，总收率为3%。化合物5被测试为UTP:α-D-葡萄糖-1-磷酸尿苷转移酶的潜在底物，该酶将葡萄糖-1-磷酸转化为UDP-葡萄糖。然而，构象限制的葡萄糖-1-磷酸类似物5被发现是酵母转移酶的弱结合抑制剂，而不是底物(在0.1 mmol L^–1的浓度下，抑制率为12%)。关键词：葡萄糖-1-磷酸，抑制，UTP:α-D-葡萄糖-1-磷酸尿苷转移酶。

  DOI：

  10.1139/v04-109
• 作为产物：
  描述：

  (1D)-(1,3,4/2)-1,2,3-tri-O-benzyl-4-C-[(benzyloxy)methyl]cyclohex-5-ene-1,2,3,4-tetrol 在 二(氰基苯)二氯化钯 、 diethylzinc 、 sodium methylate 、 lithium hexamethyldisilazane 作用下， 以 四氢呋喃 、 甲醇 、 正己烷 、 乙酸乙酯 、 甲苯 为溶剂， 反应 66.5h， 生成 (1S,2S,3S,4S,5R,6R)-3,4,5-tris(benzyloxy)-6-((benzyloxy)methyl)bicyclo[4.1.0]heptan-2-ol
  参考文献：
  名称：

  基于糖苷水解酶机理的新型共价抑制剂：糖基化过渡态构象

  摘要：

  糖科学研究中共价抑制剂的设计对化学生物学探针的开发很重要。在这里，我们报告了一种新的基于碳环机理的α-葡萄糖苷酶共价抑制剂的合成。该酶通过烯丙基阳离子或阳离子过渡态有效催化其烷基化。我们显示该烯丙基共价抑制剂具有不同的催化能力，用于假糖基化和去糖基化。这样的抑制剂具有成为有用的化学生物学工具的潜力。

  DOI：

  10.1021/jacs.7b05065

文献信息

• Conformationally Controlled Reactivity of Carbasugars Uncovers the Choreography of Glycoside Hydrolase Catalysis
  作者：Pal John Pal Adabala、Saeideh Shamsi Kazem Abadi、Oluwafemi Akintola、Sandeep Bhosale、Andrew J. Bennet

  DOI：10.1021/acs.joc.9b03152

  日期：2020.3.6

  reacting by an SN1 mechanism, while reaction rates for the worse leaving groups are limited by a conformational change of the Michaelis complex prior to a rapid SN2 reaction with the enzymatic nucleophile. Five bicyclo[4.1.0]heptyl-based carbaglucoses were tested with this enzyme, and our results are consistent with pseudoglycosidic bond cleavage that occurs via SN1 transition states that include nonproductive

  糖苷水解酶 (GH) 催化糖缀合物的水解，其中酶在催化循环期间编排一系列构象变化。因此，一些 GH 家族，包括 α-淀粉酶 (GH13)，在动力学上隐藏了它们的化学步骤。为了解决 GH13 酶的这个问题，我们制备了七种基于环己烯基的 α-d-吡喃葡萄糖苷卡巴糖，我们证明它们是 GH13 酵母 α-葡萄糖苷酶的良好共价抑制剂。离去基团的速率常数和 pKa 之间的线性自由能关系向上弯曲，这表明机制发生了变化，较好的离去基团通过 SN1 机制反应，而较差的离去基团的反应速率受在与酶促亲核试剂进行快速 SN2 反应之前，Michaelis 复合物的构象变化。用这种酶测试了五种基于双环 [4.1.0] 庚基的卡巴葡萄糖，我们的结果与通过 SN1 过渡态发生的假糖苷键切割一致，包括离去基团与酶的非生产性结合。总之，我们表明，这两种卡巴糖的构象正交反应揭示了酶和天然底物的米氏复合物所经历的构象变化所隐藏