1-(2-carboxyethyl)-2-(5-(1-(2-carboxyethyl)-3,3-dimethylindolin-2-ylidene)penta-1,3-dien-1-yl)-3,3-dimethyl-3H-indol-1-ium bromide | 909723-91-7

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 吲哚及其衍生物
• 英文名称: 1-(2-carboxyethyl)-2-(5-(1-(2-carboxyethyl)-3,3-dimethylindolin-2-ylidene)penta-1,3-dien-1-yl)-3,3-dimethyl-3H-indol-1-ium bromide
• 英文别名: 3-[(2Z)-2-[(2E,4E)-5-[1-(2-carboxyethyl)-3,3-dimethylindol-1-ium-2-yl]penta-2,4-dienylidene]-3,3-dimethylindol-1-yl]propanoic acid;bromide
• CAS: 909723-91-7
• 化学式: Br*C₃₁H₃₅N₂O₄
• 分子量: 579.534
• InChiKey: XVPBFTJRRRAZMY-UHFFFAOYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  2.81
• 重原子数：
  38.0
• 可旋转键数：
  9.0
• 环数：
  4.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.32
• 拓扑面积：
  80.85
• 氢给体数：
  2.0
• 氢受体数：
  3.0

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  1-(2-carboxyethyl)-2-(5-(1-(2-carboxyethyl)-3,3-dimethylindolin-2-ylidene)penta-1,3-dien-1-yl)-3,3-dimethyl-3H-indol-1-ium bromide 、 2-(2-(2-(4-sulfamoylbenzamido)ethoxy)ethoxy)ethylamine 在 1-羟基苯并三唑 、 盐酸-N-乙基-Nˊ-(3-二甲氨基丙基)碳二亚胺 、 三乙胺 作用下， 以 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 16.0h， 以25%的产率得到
  参考文献：
  名称：

  Brun, Matthias A.; Tan, Kui-Thong; Nakata, Eiji, Journal of the American Chemical Society, 2009, vol. 131, p. 5873 - 5884

  摘要：

  DOI：
• 作为产物：
  描述：

  1-(2-carboxyethyl)-2,3,3-trimethyl-3H-indol-1-ium bromide 、 1-anilino-3-phenyliminopropene 在 sodium acetate 作用下， 以 乙醇 为溶剂， 反应 18.0h， 以25%的产率得到1-(2-carboxyethyl)-2-(5-(1-(2-carboxyethyl)-3,3-dimethylindolin-2-ylidene)penta-1,3-dien-1-yl)-3,3-dimethyl-3H-indol-1-ium bromide
  参考文献：
  名称：

  Brun, Matthias A.; Tan, Kui-Thong; Nakata, Eiji, Journal of the American Chemical Society, 2009, vol. 131, p. 5873 - 5884

  摘要：

  DOI：

文献信息

• Oligo-Asp Tag/Zn(II) Complex Probe as a New Pair for Labeling and Fluorescence Imaging of Proteins
  作者：Akio Ojida、Kei Honda、Daisuke Shinmi、Shigeki Kiyonaka、Yasuo Mori、Itaru Hamachi

  DOI：10.1021/ja0618604

  日期：2006.8.1

  specific protein in complicated biological systems, a peptide tag incorporated into the protein and a complementary small molecular probe are required. Although a variety of peptide tag/probe pairs have been developed as molecular tools for protein analyses, the availability of pairs suitable for real-time imaging of proteins is still limited. We now report a new peptide tag/artificial probe pair composed

  为了在复杂的生物系统中完成对特定蛋白质的选择性标记，需要掺入蛋白质中的肽标签和互补的小分子探针。尽管已经开发了多种肽标签/探针对作为蛋白质分析的分子工具，但适用于蛋白质实时成像的对的可用性仍然有限。我们现在报告了一个新的肽标签/人工探针对，由可遗传编码的低聚天冬氨酸序列（D4 标签，(D4)n，n = 1-3）和相应的多核 Zn(II) 复合物 (Zn(II)- DpaTyrs）。Zn(II)-DpaTyr 探针与 D4 标签的强结合亲和力是多重配位键和多价效应的结果。用等温滴定量热法定量测定。