6-((3S,6R,16S,21aR)-1,4,17,23-tetraoxoicosahydro-1H-16,6-(epiminomethano)pyrrolo[1,2-a][1,4,7]triazacyclononadecin-3-yl)hexanoic acid | 1219015-62-9

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机酸及其衍生物 - 羧酸及其衍生物
• 英文名称: 6-((3S,6R,16S,21aR)-1,4,17,23-tetraoxoicosahydro-1H-16,6-(epiminomethano)pyrrolo[1,2-a][1,4,7]triazacyclononadecin-3-yl)hexanoic acid
• CAS: 1219015-62-9
• 化学式: C₂₆H₄₂N₄O₆
• 分子量: 506.643
• InChiKey: OGADLBDHHVWDGP-IVAOSVALSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  2.01
• 重原子数：
  36.0
• 可旋转键数：
  6.0
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.81
• 拓扑面积：
  144.91
• 氢给体数：
  4.0
• 氢受体数：
  5.0

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  6-((3S,6R,16S,21aR)-1,4,17,23-tetraoxoicosahydro-1H-16,6-(epiminomethano)pyrrolo[1,2-a][1,4,7]triazacyclononadecin-3-yl)hexanoic acid 在 苄氧基胺盐酸盐 、 1-羟基苯并三唑 、 三乙胺 、 N,N'-二环己基碳二亚胺 、 rosenmund catalyst 、 氢气 、 溶剂黄146 作用下， 以 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 48.0h， 以73%的产率得到N-hydroxy-6-[(1S,7R,10S,13R)-2,8,11,24-tetraoxo-3,9,12,23-tetrazatricyclo[11.9.2.03,7]tetracosan-10-yl]hexanamide
  参考文献：
  名称：

  使用闭环复分解法合成双环四肽HDAC抑制剂的策略

  摘要：

  环肽具有多种生物活性，由于结构刚性，受体选择性和生化稳定性而被认为是良好的治疗剂。我们已经基于不同的环四肽支架开发了双环四肽HDAC抑制剂。为了合成这些双环四肽，涉及两个环化步骤，即肽环化和通过闭环复分解（RCM）融合脂族侧链。在这些合成过程中，我们已经建立了两个事实：脂族环长度的下限和双环四肽合成的较好合成路线。发现九个亚甲基环长度是脂族环的下限，并且合成路线的选择取决于环状四肽支架中氨基酸的构型。 九个亚甲基单元是脂肪族环长度的下限，合成途径的选择取决于环状四肽支架中氨基酸的构型。RCM和随后的肽环化是LDLD配置的正确途径，而LLLD配置的反向途径是正确的途径。

  DOI：

  10.1007/s12039-015-0922-y
• 作为产物：
  描述：

  tert-butyl ((2S,12R)-12-((S)-8-(benzyloxy)-2-((tert-butoxycarbonyl)amino)-8-oxooctanamido)-13-oxoazacyclotridecane-2-carbonyl)-D-prolinate 在 palladium on activated charcoal 、 氢气 、 溶剂黄146 、 N,N-二异丙基乙胺 、 N-[(dimethylamino)-3-oxo-1H-1,2,3-triazolo[4,5-b]pyridin-1-yl-methylene]-N-methylmethanaminium hexafluorophosphate 作用下， 以 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 7.0h， 生成 6-((3S,6R,16S,21aR)-1,4,17,23-tetraoxoicosahydro-1H-16,6-(epiminomethano)pyrrolo[1,2-a][1,4,7]triazacyclononadecin-3-yl)hexanoic acid
  参考文献：
  名称：

  使用闭环复分解法合成双环四肽HDAC抑制剂的策略

  摘要：

  环肽具有多种生物活性，由于结构刚性，受体选择性和生化稳定性而被认为是良好的治疗剂。我们已经基于不同的环四肽支架开发了双环四肽HDAC抑制剂。为了合成这些双环四肽，涉及两个环化步骤，即肽环化和通过闭环复分解（RCM）融合脂族侧链。在这些合成过程中，我们已经建立了两个事实：脂族环长度的下限和双环四肽合成的较好合成路线。发现九个亚甲基环长度是脂族环的下限，并且合成路线的选择取决于环状四肽支架中氨基酸的构型。 九个亚甲基单元是脂肪族环长度的下限，合成途径的选择取决于环状四肽支架中氨基酸的构型。RCM和随后的肽环化是LDLD配置的正确途径，而LLLD配置的反向途径是正确的途径。

  DOI：

  10.1007/s12039-015-0922-y

文献信息

• Bicyclic peptides as potent inhibitors of histone deacetylases: Optimization of alkyl loop length
  作者：Nurul M. Islam、Tamaki Kato、Norikazu Nishino、Hyun-Jung Kim、Akihiro Ito、Minoru Yoshida

  DOI：10.1016/j.bmcl.2009.12.054

  日期：2010.2

  Bicyclic tetrapeptide hydroxamic acids were prepared as histone deacetylase (HDAC) inhibitors, and the evaluated inhibitory activity shows that they are potent against HDAC1 and HDAC4. The in vivo activity depends on alkyl loop length. (c) 2009 Elsevier Ltd. All rights reserved.